LocDB
LocDB | |
|---|---|
| 내용 | |
| 묘사 | 국부화의 실험적 주석 |
| 유기체 | 호모 사피엔스 아라비도시스탈리아나 |
| 연락 | |
| 연구소 | 컬럼비아 대학교 |
| 실험실. | 생화학·분자생물물리학부 |
| 작가들 | 스루티 라스토기 |
| 주요 인용문 | Rastogi & al. (2011년)[1] |
| 발매일 | 2010 |
| 접근 | |
| data 형식 | MySQL 데이터베이스 |
| 웹 사이트 | http://www.rostlab.org/services/locDB |
| 웹 서비스 URL | http://www.rostlab.org/services/locDB/search.php |
| 여러가지 종류의 | |
| 버전 | 릴리스 1.0 |
LocDB는[1] 호모 사피엔스(인간)와 아라비도시스 탈리아나(풀)에서 단백질의 세포하 국재화를 위한 실험 주석을 수집하는 전문가 큐레이션 데이터베이스입니다.데이터베이스는 또한 실험 정보를 가진 모든 단백질에 대한 다양한 최첨단 예측 방법으로부터 세포 내 국재화의 예측을 포함한다.
단백질은 세포의 기본적인 기능 성분이다.그들은 유전자 정보를 물리적 현실로 바꾸는 데 책임이 있다.이 고분자들은 유전자 조절, 효소 촉매 작용, 세포 대사, DNA 복제, 영양소의 운반, 인식, 신호 전달을 매개합니다.포스트 게놈 시대에 단백질 기능을 설명하기 위한 이 풍부한 데이터의 해석은 근본적인 도전이다.현재까지 효모와 같이 가장 잘 연구된 유기체에서도 단백질의 약 4분의 1이 특징지어지지 않은 상태로 남아 있다.단백질 기능을 실험적으로 결정하는 데 있어 가장 큰 장애물은 그 연구가 막대한 자원을 필요로 한다는 것이다.따라서 데이터베이스에 축적된 배열의 양과 대응하는 단백질의 실험적 특성화 사이의 차이는 계속 커지고 있다.생물정보학은 단백질 기능의 보다 빠르고 효과적인 예측을 위한 도구의 개발을 통해 이러한 배열-기능 간극을 메우는 데 중심적인 역할을 한다.이 저장소는 실험 주석과 예측 사이의 격차를 효과적으로 메우고 새로운 예측 [1]방법을 테스트하기 위한 더 크고 안정적인 데이터 세트를 제공합니다.
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레퍼런스
- ^ a b c Rastogi, Shruti; Rost Burkhard (Jan 2011). "LocDB: experimental annotations of localization for Homo sapiens and Arabidopsis thaliana". Nucleic Acids Res. England. 39 (Database issue): D230-4. doi:10.1093/nar/gkq927. PMC 3013784. PMID 21071420.
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