lsy-6 마이크로RNA
lsy-6 microRNA| lsy-6 | |
|---|---|
| 식별자 | |
| 기호. | lsy-6 |
| Rfam | RF00823 |
| miRBase 패밀리 | MIPF0000265 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 마이크로RNA |
| 도메인 | 진핵생물; 메타조아; 선충; |
| PDB 구조 | PDBe |
lsy-6 마이크로RNA는 miRNA의 종류에 속하며, 이것들은 여러 메커니즘에 의해 다른 유전자의 발현 수준을 조절하는 기능을 한다.lsy-6는 짧은 비코드 RNA 분자이며 신경계 발달에 역할을 하는 것으로 확인된 최초의 miRNA이다.선충 케노하브디스의 좌우 신경 비대칭을 조절합니다.
톱니바퀴-1 유전자를 통한 좌우 비대칭
ASEL과 ASER은 C. elegans에서 화학수용체 유전자 발현의 비대칭 패턴에 책임이 있다고 생각되는 한 쌍의 양쪽 미각수용체 뉴런이다.이 두 개의 미각 뉴런은 연결성, 위치, 유전자 발현 패턴뿐만 아니라 형태학적으로도 좌우 대칭이다.단, 특정 신호 분자의 [1]표현은 좌우 비대칭입니다.ASE 뉴런은 Nkx형 호메오박스 유전자인 cog-1의 정확한 용량에 매우 민감하며, 이 유전자의 추가 복제는 좌/우 비대칭 결함을 쉽게 발생시킬 것이다.
lsy-6은 cog-1 발현 제어에 책임이 있다. 이는 전사 메커니즘만으로는 이 조절에 충분하지 않기 때문이다.lsy-6와 cog-1은 출생 후 처음에는 ASEL과 ASER에 의해 동시에 발현되지만, 나중에 두 개의 ASE 뉴런 중 하나(lsy-6의 경우 ASEL, cog-1의 경우 ASER)로 발현이 제한된다.lsy-6는 21-nt miRNA를 코드하고, 이는 cog-1 유전자의 3µ UTR에서 단일 상보적 부위에 결합한다.이 상호작용은 (ASER가 아닌) ASEL 셀타입에서만 볼 수 있기 때문에 비대칭 톱니바퀴-1 분포가 발생합니다.lsy-6의 제거는 ASEL에서 cog-1의 전사를 변화시키는 것으로 관찰되었으며, 이는 lsy-6을 발현함에도 불구하고, ASEL 뉴런은 [1]cog-1을 전사하지 않음을 나타낸다.
추가 표현
lsy-6는 입술 감각 뉴런과 PVQ 복부 척수 인터뉴론을 포함한 [1]여러 다른 뉴런 유형에서 추가로 발현된다.
lsy-6/lsy-2 피드백 루프
lsy-6의 발현 자체는 아연 핑거 전사 인자인 [2]lsy-2에 의해 조절된다.lsy-2와 lsy-6의 상호작용은 세포형 특이적이며 lsy-2 돌연변이 동물에서 lsy-6 발현을 완전히 상실한다.miRNAs lsy-6, mir-273 및 각각의 전사인자 cog-1 및 die-1로 이루어진 ASE 좌우방향성에 필요한 쌍안정 피드백 루프가 마련되어 있다.보는 반면 lsy-6 ASEL에 먹지만 ASER과 하류 전사 인자 cog-1,[3]mir-273 표현의 표현을 규제하고 강하게 ASER에 치중하고die-1 전사 인자의 mRNA에 상호 보완성을 나타낸다. die-1post-transcriptional 수준에 있었고 컨트롤 activat에 의해chemosensory 편측성 규제된다 표현된다.에서g ASEL만의 [4]lsy-6 표현.ASER에서의 die-1의 발현은 3' UTR 영역 내의 2개의 사이트를 통해 다운 조절됩니다.
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레퍼런스
- ^ a b c Johnston RJ, Hobert O (December 2003). "A microRNA controlling left/right neuronal asymmetry in Caenorhabditis elegans". Nature. 426 (6968): 845–849. doi:10.1038/nature02255. PMID 14685240.
- ^ Johnston RJ, Hobert O (December 2005). "A novel C. elegans zinc finger transcription factor, lsy-2, required for the cell type-specific expression of the lsy-6 microRNA". Development. 132 (24): 5451–5460. doi:10.1242/dev.02163. PMID 16291785.
- ^ Didiano D, Hobert O (July 2008). "Molecular architecture of a miRNA-regulated 3′ UTR". RNA. 14 (7): 1297–1317. doi:10.1261/rna.1082708. PMC 2441980. PMID 18463285.
- ^ Chang S, Johnston RJ, Frøkjaer-Jensen C, Lockery S, Hobert O (August 2004). "MicroRNAs act sequentially and asymmetrically to control chemosensory laterality in the nematode". Nature. 430 (7001): 785–789. doi:10.1038/nature02752. PMID 15306811.
외부 링크
