DPANN

DPANN
DPANN
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산시디필럼
과학적 분류 e
도메인: 고세균
슈퍼문: DPANN
린케 외 2013년
필라[1]

DPANN은 2013년에 [2]처음 제안된 고세균류의 슈퍼문이다.많은 구성원들은 삶의 [2]다른 영역으로부터의 수평적 유전자 이동의 새로운 징후를 보인다.그들은 다른 고세균에 비해 크기가 작기 때문에 나노고세균 또는 초소형 고세균으로 알려져 있다.

DPANN은 처음 발견된 Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanohaloarchaeota, Nanohaloarchaeota라는 다섯 그룹의 머리글자에 의해 형성된 약어이다.나중에 DPANN 슈퍼문 [3]내에서 발견되어 제안되었다.2017년, 또 다른 알티아르카이오타 문([4]문)이 이 슈퍼문에 추가되었다.DPANN의 단생성은 포함된 필라의 높은 돌연변이율로 인해 지금까지 확립된 것으로 간주되지 않았으며,[5][6] 이는 계통수가 관련되지 않고 기저 또는 관절로 분류되는 LBA(Long Branch attraction)의 아티팩트로 이어질 수 있다.이 분석들은 DPANN이 Euryarchaeota에 속하거나 Euryarchaeota [5][6][7]내의 다양한 위치를 차지하는 다계통임을 시사한다.

DPANN은 다양한 환경 분포와 신진대사를 가진 서로 다른 필라를 함께 그룹화하며, 나노알카이오타와 같은 공생 및 호열성 형태, 파르바카이오타와 같은 산성 동물, 그리고 아에니그마카이오타와 디아페로트리테스와 같은 비원적 동물로부터 다양하다.DPANN은 또한 수면 위에는 있지만 아래에는 없는 질산염이 풍부한 지하수에서도 검출되었으며, 이는 이러한 분류군을 [8]찾는 것이 여전히 매우 어렵다는 것을 보여준다.

특성.

그들은 다른 고기에 비해 크기가 작은 것이 특징이며, 비록 많은 것들이 다른 유기체와의 공생 또는 기생 관계에 의존하는 편모충이지만, 그들의 작은 게놈과 함께 그들은 자유로운 삶을 영위하기에 제한적이지만 충분한 이화 능력을 가지고 있다.그들의 특징의 대부분은 초소형 박테리아(CPR 그룹)[3]와 비슷하거나 유사하다.

제한된 대사 용량은 작은 게놈의 산물이고 많은 것들이 뉴클레오티드, 아미노산, 지질에 대한 중심 생합성 경로가 없다는 사실에 반영된다. 따라서 대부분의 DPAN 고세균은 생물학적 요구사항을 충족시키기 위해 다른 미생물에 의존한다.하지만 자유롭게 살 수 있는 가능성이 있는 것은 발효성 및 호기성 이종영양동물이다.[3]

대부분 혐기성이기 때문에 재배할 수 없습니다.그들은 호열성, 고산성, 고호염성 또는 내금속성과 같은 극한 환경 또는 해양 및 호수 퇴적물의 온대 환경에서도 산다.그들은 땅이나 바다에서 [3]거의 발견되지 않는다.

분류

계통발생학

Tom A. Williams et al. 2017,[19] Castelle et al. 2015[3], Dombrowski et al. 2020.[20] Jordan et al. 2017[7] Cavalier-Smith2020[6] 및 Feng et al 2021.[21]

몇몇 계통학 분석에 따르면 DPANN은 고세균의 첫 번째 발산 분지일 수 있다.최근의 계통발생학적 분석에서는 다음과 같은 계통발생학이 발견되었다.[3][19][20]

박테리아

고세균
DPANN

알타르카이오타

디아페로트리테스

미크라카이오타

운디나카이오타

아네그마타카에오타

나노할로아르카이오타

나노아르카이오타속

파르바카이오타

마마르카이오타

파시아카이오타

애저샤오타

에우리아카이오타

프로테오아르카이오타속

택

아스가르드

로키아카이오타

오딘카르카이오타

토라카이오타

헤임달라카이오타

(+α-단백균)

진핵생물

다른 계통발생학적 분석에서는 DPANN이 Euryarchaeota에 속할 수도 있고 Euryarchaeota 내에서 다른 위치를 차지하고 있는 다계통일 수도 있다는 주장이 제기되었습니다.또한 알티아카이오타문(Altiarchaeota문)이 DPANN 또는 Euryarchaeota로 [20][5]분류되어야 하는지 여부도 논의되고 있다.계통수에서 DPAN의 대체 위치는 다음과 같다.[7][6][21]따옴표로 표시된 그룹은 DPANN에 할당된 혈통이지만 계통학적으로 다른 그룹과는 분리되어 있습니다.

박테리아

고세균
에우리아카이오타

테르모코치

하데사르카이아목

메타노박테리아

메타노피리

메타노코끼속

열가소성 아스마타

시조글로비

메타노미크로비아

나노할로아카이오타

할로아카이아목

알타르카이오타

DPANN

디아페로트리테스

미크라카이오타

운디나카이오타

아네그마타카에오타

나노아르카이오타속

파르바카이오타

마마르카이오타

파시아카이오타

애저샤오타

프로테오아르카이오타속

택

아스가르드

로키아카이오타

오딘카르카이오타

토라카이오타

헤임달라카이오타

(+α-단백균)

진핵생물

분류법

현재 인정된 분류법은 LPSN([22]Standing in Nomenclature)과 [23]NCBI(National Center for Biotechnology Information)를 사용한 원핵생물명목록에 기초하고 있다.

"DPANN"[24][25][26]의 계통발생


DPANN
알타르카이오타
"알타르카이아'

"알타르케아레스'

아이나카이오타
아이나카이아

0-14-0-20-30-16

이아나르케아레스

미크라카이오타
"미크로카이아"

노롱가라기날레스

"미크라크과"

"부라크에레스'

"발효목"

구가라카이아레스속

앤스톤랄레스

운디나카이오타
"우디나카이아"

"Undinarchaeales"

후베라카이아오타
후베라카이아속

후베라르카이아목

아네그마르카에오타
아네그마르카이아속

아네그마르카에레스속

'나노하라카이오타'
'나노할로바이아'

'나노할로비알레스'

'나노카에오타'
'나노르카이아'

'나노아케아레스'

"파스타케아레스"

"Weesearchaeales"

"Tiddalikarchaeales"

"Parvarchaeales"

슈퍼문 "DPANN" 린케 외 2013년

  • 알타르카이오타Probst 등 2018년 (SM1)
    • 클래스 "Altarchaeia" 교정. Probst et al. 2014
      • "Altarchaeales" 교정장치를 주문합니다. Probst et al. 2014
  • 문 "Iainarchaeota"[Diapherotrites" 린케 외 2013] (DUSEL-3)
    • 클래스 '아이나카이아' 린케 외 2020
      • '칸디다투스 포르테레아' Probst & Banfield 2017 {0-14-0-20-30-16: CSSED10-239}
      • "Iainarchaeales" 린케 외 2020년 주문
  • 문 "Micrarchaeota" Baker & Dick 2013
    • 클래스 '미크라카이아' 바스케스 캄포스 외 2021
      • "Anstonelales" Vazquez-Campos 등 2021년 주문(LFWA-IIc)
      • "Burarchaeales" Vazquez-Campos 등 2021년 주문(LFWA-IIB)
      • "Fermentimicrarchaeales" Kadnikov 등 2020년 주문
      • "Gugarchaeales" Vazquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIa) 주문
      • "Micrarchaeales" Vazquez-Campos 등 2021년 주문
      • "Norongaragalinales" Vazquez-Campos 등 2021년 주문(LFWA-II)
  • 돔브로스키문 등 2020년
    • 등급 '운디나카이아' 돔브로스키 외 2020
      • 주문 "Undinarchaeales" 돔브로스키 외, 2020
  • 문 "Huberarchaeota" Probst et al. 2019
    • 클래스 "Huberarchaeia" 교정. Probst et al. 2019
      • "Huberarchaeales" 린케 외 2020년 주문
  • 아네그마타카이오타문. Rinke et al. 2013 (DSEG, DUSEL2)
    • "애니그마타르카이아" 등급 교정. 린케 외 2020년
      • "Aenigmatarchaeales"를 주문합니다. 린케 외 2020년
  • "나노할라카이오타"문. 린케 외 2013년
    • "나노할로바이아" 등급의 교정 장치입니다.라코노 외 연구진 2020년
      • '나노할로비알레스' 라코노 외 2020년 주문
    • 수업?나노할라카이아" 교정기. 나라싱아라오 외 2012년
      • "Nanohalarchaeales"목
  • 문 "나노아르카이오타" 휴버 외 2002
    • 클래스 '나노아르카이아' 바스케스 캄포스 외 2021
  • 문 ?"마카에오타"
  • 주문하시겠습니까?빈나마타르카에레스속

레퍼런스

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외부 링크