ALIL 의사 노트
ALIL pseudoknot| ALIL 의사 노트 | |
|---|---|
 의사 노트가 없는 ALIL의 세컨더리 구조 | |
| 식별자 | |
| 기호. | 하지 않다 |
| Rfam | RF01497 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 시스레그 |
| 도메인 | 박테리아 |
| PDB 구조 | PDBe |
ALIL pseudoknot은 박테리아에서 프레임시프트를 유도하는 RNA 원소이다.소수의 유전자의 발현에는 이동 부위의 3'쪽에 위치한 RNA 2차 구조에 의해 프레임 이동 빈도가 증가하는 프레임 이동이 필요하다.이 구조는 의사 루프가 될 수도 있고 스템 루프가 될 수도 있으며 mRNA 전위치에 대한 물리적인 장벽으로 작용하기 때문에 리보솜 [1]일시정지가 발생합니다.
삽입 시퀀스 3(IS3) 패밀리에 속하는 트랜스포저블 요소 클래스의 비교 분석을 통해 ALIL 의사 노트가 확인되었으며, 다수의 박테리아 [2]종에 걸쳐 보존되어 있는 것으로 나타났다.이 유사 노트는 프로그램된 -1 리보솜 프레임시프트(PRF-1)를 자극하여 전이에 필요한 효소인 트랜스포사제의 발현을 자극한다.이 의사 노트의 2차 구조를 결정하기 위해 돌연변이 유발과 화학적 탐침이 사용되었으며, 이 의사 노트는 꼭대기 루프와 내부 [3]루프 사이의 상호작용에 의해 형성된다고 제안되었다.
레퍼런스
- ^ Brierley I, Pennell S (2001). "Structure and function of the stimulatory RNAs involved in programmed eukaryotic-1 ribosomal frameshifting". Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 66: 233–48. doi:10.1101/sqb.2001.66.233. PMID 12762025.
- ^ Kropinski AM, Farinha MA, Jansons I (March 1994). "Nucleotide sequence of the Pseudomonas aeruginosa insertion sequence IS222: another member of the IS3 family". Plasmid. 31 (2): 222–8. doi:10.1006/plas.1994.1024. PMID 8029330.
- ^ Mazauric MH, Licznar P, Prère MF, Canal I, Fayet O (July 2008). "Apical loop-internal loop RNA pseudoknots: a new type of stimulator of -1 translational frameshifting in bacteria". The Journal of Biological Chemistry. 283 (29): 20421–32. doi:10.1074/jbc.M802829200. PMID 18474594.[영구 데드링크]
