바이오플렉스

BioPlex
Mediator 콤플렉스의 서브유닛 중 하나인 MED1의 상호작용 네트워크.

바이오플렉스(ORFeome 기반 복합체의 생물물리학적 상호작용)는 단백질-단백질 [1][2][3]상호작용을 연구하기 위한 개방형 접근 자원이다.하버드 의대와 바이오젠이 협력한 결과다.바이오플렉스 1.0은 7668개의 단백질 [4]중 23,744개의 상호작용을 보고했다.BioPlex 2.0은 이러한 관찰을 확장하여 29,000개 이상의 새로운 [5]상호작용을 탐지했습니다.

기본적인 기술은 인간의 세포에서 "베이트" 단백질을 발현시키는 것이다.이러한 미끼 단백질은 다른 단백질과 상호작용을 하고, 미끼와 "사료" 단백질의 복합체는 친화력 정화에 의해 분리된다.상호작용하는 먹잇감 단백질은 질량분석법을 사용하여 식별된다.

연구에 사용

제대로 특징지어지지 않은 단백질의 상호작용 파트너를 결정하는 것은 그 단백질의 기능에 대한 단서를 제공할 수 있고, 질병 유전자가 어떤 "단백질 군집"에 있는지를 아는 것은 그 [5]작용에 대한 더 나은 맥락을 줄 수 있다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ anon. "BioPlex". harvard.edu. harvard.edu. Retrieved 24 May 2017.
  2. ^ anon (2015-07-18). "Facebook for the Proteome". technology.org. technology.org. Retrieved 24 May 2017.
  3. ^ anon. "New study maps protein interactions for a quarter of the human genome". phys.org/. phys.org. Retrieved 24 May 2017.
  4. ^ Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Colby G, Baltier K, Dong R, Guarani V, Vaites LP, Ordureau A, Rad R, Erickson BK, Wühr M, Chick J, Zhai B, Kolippakkam D, Mintseris J, Obar RA, Harris T, Artavanis-Tsakonas S, Sowa ME, De Camilli P, Paulo JA, Harper JW, Gygi SP (2015). "The BioPlex Network: A Systematic Exploration of the Human Interactome". Cell. 162 (2): 425–40. doi:10.1016/j.cell.2015.06.043. PMC 4617211. PMID 26186194.
  5. ^ a b Huttlin EL, Bruckner RJ, Paulo JA, Cannon JR, Ting L, Baltier K, Colby G, Gebreab F, Gygi MP, Parzen H, Szpyt J, Tam S, Zarraga G, Pontano-Vaites L, Swarup S, White AE, Schweppe DK, Rad R, Erickson BK, Obar RA, Guruharsha KG, Li K, Artavanis-Tsakonas S, Gygi SP, Harper JW (2017). "Architecture of the human interactome defines protein communities and disease networks". Nature. 545 (7655): 505–509. Bibcode:2017Natur.545..505H. doi:10.1038/nature22366. PMC 5531611. PMID 28514442.