부다페스트 레퍼런스 코넥텀

Budapest Reference Connectome
부다페스트 레퍼런스 코넥텀
Budapest Reference Connectome.png
개발자발라즈 스잘카이, 차바 케레페시, 바린트 바르가, 빈스 그로르무스
안정적 해제
3.0
기록 위치Perl, JavaScript, WebGL
다음에서 사용 가능영어
유형코넥토믹스
웹사이트pitgroup.org/connectome/

부다페스트 레퍼런스 커넥톰 서버는 418명의 건강한 피험자의 자주 나타나는 해부학적 뇌 연결을 계산한다.[1][2]휴먼 커넥톰 프로젝트의 확산 MRI 데이터 세트에서 CSV와 GraphML 형식으로 내려받아 3D로 현장에서 시각화할 수 있는 참조 커넥텀(또는 브레인 그래프)으로 준비했다.null

특징들

부다페스트 레퍼런스 커넥텀에는 해부학적으로 식별된 회색 물질 영역에 해당하는 1015개의 노드가 있다.사용자는 수많은 매개변수를 설정할 수 있으며 그에 따른 합의 코넥텀은 웹페이지에서 쉽게 시각화된다.[2]사용자는 그래픽 구성요소에 있는 노드의 해부학적 라벨을 확대, 회전 및 조회할 수 있다.null

배경

부다페스트 레퍼런스 코넥텀은 버전 2의 96개 피험자와 버전 3의 418개 피험자의 뇌 그래프를 보여주는 컨센서스 그래프다.피험자의 일정 비율에 존재하는 가장자리만 반환된다.선택한 각 가장자리는 해당 가장자리를 포함하는 각 그래프에서 특정 가중치를 가지므로 이러한 다중 가중치는 평균(즉, 평균) 또는 중위수를 취함으로써 단일 가중치로 결합된다.사용자 인터페이스는 사용자가 반환되는 가장자리의 최소 빈도를 선택할 수 있는 매개변수를 사용자 정의할 수 있다.여성 또는 남성 기준 코넥텀을 보고 비교하는 옵션이 있다.여성의 코넥텀은 남성보다 훨씬 많은 가장자리를 포함하고 있으며, 여성의 코넥텀의 가장자리 중 많은 부분이 두 반구 사이를 운행한다.[3][4][5]null

디스커버리스

부다페스트 레퍼런스 코넥텀은 연구자들을 인간 두뇌 그래프의 컨센서스 코넥텀 다이내믹스 발견으로 이끌었다.모든 뇌 그래프에 나타난 가장자리는 뇌계 주위에 연결된 서브그래프를 형성한다.점차적으로 덜 빈번한 가장자리를 허용함으로써, 이 핵심 서브그래프는 관목으로서 지속적으로 성장한다.성장 역학은 개인의 두뇌 개발을 반영할 수 있으며, 인간의 일치된 두뇌 그래프의 일부 가장자리를 지시할 수 있는 기회를 제공할 수 있다.[6]null

참조

  1. ^ Szalkai, Balázs; et al. (2015). "The Budapest Reference Connectome Server v2.0". Neuroscience Letters. 595: 60–2. arXiv:1412.3151. doi:10.1016/j.neulet.2015.03.071. PMID 25862487. S2CID 6563189.
  2. ^ a b Szalkai, Balázs; Kerepesi, Csaba; Varga, Balint; Grolmusz, Vince (2017). "Parameterizable consensus connectomes from the Human Connectome Project: the Budapest Reference Connectome Server v3.0". Cognitive Neurodynamics. 11 (1): 113–116. arXiv:1602.04776. doi:10.1007/s11571-016-9407-z. PMC 5264751. PMID 28174617.
  3. ^ Ingalhalikar, M.; Smith, A.; Parker, D.; Satterthwaite, T. D.; Elliott, M. A.; Ruparel, K.; Hakonarson, H.; Gur, R. E.; Gur, R. C.; Verma, R. (2013). "Sex differences in the structural connectome of the human brain". Proceedings of the National Academy of Sciences. 111 (2): 823–828. Bibcode:2014PNAS..111..823I. doi:10.1073/pnas.1316909110. ISSN 0027-8424. PMC 3896179. PMID 24297904.
  4. ^ Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2015). "Graph Theoretical Analysis Reveals: Women's Brains Are Better Connected than Men's". PLOS ONE. 10 (7): e0130045. arXiv:1501.00727. Bibcode:2015PLoSO..1030045S. doi:10.1371/journal.pone.0130045. ISSN 1932-6203. PMC 4488527. PMID 26132764.
  5. ^ Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2017). "Brain Size Bias Compensated Graph-Theoretical Parameters are Also Better in Women's Structural Connectomes". Brain Imaging and Behavior. 12 (3): 663–673. doi:10.1007/s11682-017-9720-0. PMID 28447246. S2CID 4028467.
  6. ^ Kerepesi, Csaba; et al. (2016). "How to Direct the Edges of the Connectomes: Dynamics of the Consensus Connectomes and the Development of the Connections in the Human Brain". PLOS ONE. 11 (6): e0158680. arXiv:1509.05703. Bibcode:2016PLoSO..1158680K. doi:10.1371/journal.pone.0158680. PMC 4928947. PMID 27362431.