종양유전학 연구를 위한 데이터베이스 목록
List of databases for oncogenomic research |
종양유전학 연구를 위한 데이터베이스는 암 데이터와 종양유전학 연구에 전념하는 생물학적 데이터베이스이다.이들은 암 데이터의 주요 소스가 될 수 있으며, 일정 수준의 분석(처리된 데이터)을 제공하거나 온라인 데이터 마이닝을 제공할 수도 있습니다.
목록.
아래 표는 종양유전학 연구에 특화된 데이터베이스의 개요를 보여줍니다.이 목록은 포괄적인 목록이 아니며 일반 포커스가 있는 데이터베이스를 포함하지 않습니다.List of biological database(생체 데이터베이스 목록) 또는 Microarray database(마이크로 어레이 데이터베이스)에서 암 데이터를 포함하는 데이터베이스를 찾을 수 있습니다.
| 데이터베이스 | 연구소/조직 | 변경 유형 | 프라이머리 소스 | 처리된 데이터 | 유기체 | 셀 회선 | 공개 데이터 | 제한된 데이터 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ocimum Bio Solutions의 BioExpress® Oncology Suite에는 1차, 전이 및 양성 종양 검체 및 일치하는 인접 대조군을 포함한 정상 검체의 유전자 발현 데이터가 포함되어 있습니다. (BioExpress Oncology Suite) → | Ocimum Bio Solutions(미국) | 유전자 발현 | 네. | 네. | 인간, 쥐 및 마우스 | 네. | 아니요. | 네. | |
| ClinicalTrials.gov에는 임상시험에 대한 설명과 몇 가지 결과가 게재되어 있으며, 그 대부분은 유전적으로 대상이 되고 있습니다. → | 미국 국립보건원 | 여러가지 | 네. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| CEO Life Sciences Consortium의 프로젝트 데이터 범위를 통해 연구자들은 식별되지 않은 환자 수준, 대조군 암, 단계 III 암 데이터를 공유, 통합 및 분석할 수 있습니다. → | 미국, CEO 생명과학 컨소시엄 | 여러가지 | 아니요. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 네. | |
| 암 체세포 돌연변이 목록(COSmic) → | Wellcome Trust Sanger Institute, 영국 | 돌연변이 | 아니요. | 네. | 인간 | 네. | 네. | 네. | |
| cBio Cancer Genomics 포털 → | 메모리얼 슬론케터링 암센터, 미국 | 복사 번호, 돌연변이, 메틸화, 유전자 발현, miRNA 발현, 단백질, 인산화 | 아니요. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| 국제 암 게놈 컨소시엄 → | 세계 | 돌연변이 | 네. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 네. | |
| Integrative Oncogenomics Cancer Browser(IntOGEN) → | 스페인 폼페우 파브라 대학교 | 복사 번호, 돌연변이, 유전자 발현 | 아니요. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| 마우스 레트로바이러스 태그 부착 암 유전자 데이터베이스 → | 싱가포르 분자 세포 생물학 연구소 | 돌연변이 | 네. | 네. | 마우스 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| 마우스 종양 생물학 데이터베이스 →[주 1] | 잭슨 연구소, 미국 | 복사 번호, 돌연변이, 메틸화, 유전자 발현 | 아니요. | 아니요. | 마우스 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | |
| OncoDB.HCC → | 대만 시니카 학회 | 복사 번호, 유전자 발현, QTL | 아니요. | 네. | 인간, 마우스, 쥐 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| Genevestigator →에는 GEO와 TCGA로 유명한 암 연구 프로젝트를 포함한 수많은 공공 저장소의 데이터가 포함되어 있습니다. | 스위스 네비온 AG | 유전자 발현 | 아니요. | 네. | 인간, 마우스, 쥐, 원숭이, 개 및 기타 | 네. | 네. | 네. | |
| Omicsoft Corporation의 OncoLand에는 TCGA, ICGC 등을 포함한 대규모 Genomic 프로젝트의 데이터가 포함되어 있습니다. | 오믹소프트, 미국 | 복사 번호, 돌연변이, 메틸화, 유전자 발현, miRNA 발현, 단백질, 인산화 | 네. | 네. | 인간, 쥐 및 마우스 | 네. | 네. | 네. | |
| 온코민 → | Compendia Bioscience, Inc, 미국 | 유전자 발현 | 아니요. | 네. | 인간 | 네. | 아니요. | 네. | |
| 온코레발 → | 터키 보아지치 대학교 | 유전자 발현 | 아니요. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| 프로제틱스 → | 취리히 대학교 (스위스) | 복사번호 | 아니요. | 네. | 인간 | 네. | 네. | 아니요. | |
| 암 게놈 지도 → | 미국 국립 암 연구소 | 복사 번호, 돌연변이, 메틸화, 유전자 발현, miRNA 발현 | 네. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 네. | |
| 암 자원 → | 대학 의학 베를린, 독일 | ||||||||
| 로체 암 게놈 데이터베이스(RCGDB) [1] | Roche Diagnostics(독일, Penzberg) | ||||||||
| 암 유전자 네트워크 → | 킹스 칼리지 런던, 영국 | 돌연변이 | 아니요. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 아니요. | |
| 무타진 | 미국 NIH, NCBI | 돌연변이 | 아니요. | 네. | 인간 | 아니요. | 네. | 아니요. |
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메모들
- ^ 생물학적 데이터에 대한 참조만 포함합니다.
