엑손트랩

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엑손 트래핑은 알려지지 않은 인트론 엑손 구조의 진핵생물 DNA 조각에서 잠재적 엑손들을 식별하기 위한 분자생물학 기법이다.^[1]이것은 그 조각이 표현된 유전자의 일부인지 판단하기 위해 행해진다.

유전체 파편은 알려진 DNA의 엑손 인트론 엑손 시퀀스로 구성된 '분할 벡터'의 인트론에 삽입되고, 벡터는 진핵 세포에 삽입된다.만약 파편에 엑손(즉, 인트론 DNA만으로 구성)이 포함되어 있지 않다면, 벡터의 원래 인트론과 함께 분할될 것이다.한편, 엑손(exon)이 포함되어 있으면, 전사(intron자료가 모두 제거된 상태에서) 후 성숙한 mRNA의 일부가 된다.'포장된 exons'의 존재는 mRNA의 크기를 증가시키거나 RT-PCR을 통해 검출되어 관심의 DNA를 증폭시킬 수 있다.

이 기술은 주로 mRNA에서 생성된 cDNA 시퀀싱의 접근방식에 의해 대체되었고, NCBI의 블라스트 서버와 같은 생물정보학 도구를 사용하여 시퀀스의 출처를 결정함으로써 적절한 exon-intron 스플라이스 사이트를 식별했다.

참조