제프리 장

Geoffrey Chang

Geoffrey Chang은 캘리포니아 대학, 샌디에이고의 Skaggs School of Pharmacy and Pharmical Sciences 및 School of Medicine의 약리학과 교수입니다.그의 실험실은 일체형 막 단백질의 구조 생물학에 초점을 맞추고 있으며, 특히 결정화에 대한 저항성이 악명 높은 막 단백질의 3차 구조를 해결하기 위한 X선 결정학 기술을 탐구한다.그 연구소는 박테리아에 있는 다제내성 운반체 단백질의 구조를 전문적으로 연구해 왔다.Scripps 연구소의 교수였던 2001년, [2]Chang은 다제내성의 구조 생물학에 대한 그의 업적으로 연구자들을 학문적 경력 초기에 지원하도록 설계된 Beckman Young Investigators [1]Award를 수상했다.장은 2012년에 [3]스크립스에서 이웃 UC 샌디에이고로 이적을 발표했다.

2007년, Chang과 공동 저자들은 다른 연구 그룹이 매우 다른 구조를 발표한 후 3개의 다제 운반 단백질의 구조를 설명하는 이전에 발표된 5개의 논문을 철회했고, 이는 Chang 그룹의 맞춤형 소프트웨어 [4]도구에서 치명적인 버그를 발견하게 만들었다.하지만, 그 이후로, 장은 [5][6]구조 생물학 분야의 다른 논문들을 발표했고,[7] "많은 과학 분야에 매우 중요한 영향을 미칠 수 있는 예외적으로 혁신적인 연구 프로젝트"에 대해 국립 보건원으로부터 "EUREKA" 보조금을 받았습니다.

철회된 용지

Chang과 공동 저자는 EmrE 및 MsbA로 알려진 다제내성 전달체의 구조에 대한 논문을 발표했다.비록 초기 구조는 혼란스러운 그 분야의 조립 dimer,[8]에 그들의 ATP결합 사이트의 그들의 예상치 못한 배치로 인해 고려된 추가 구조의 것과 같은 단백질이 나오는 것은 이 장 씨는 구조들은 그 분자의 생물학적 활성을 갖는 형태를 나타낼 것 같지 않은 것으로 나타났다.s.[9]Chang과 공저자들은 EmrE와 MbbA에 대한 구조 논문을 철회하면서 잘못 조립된 이머의 [4][10]출현을 초래한 데이터 오해의 근원으로 내부 소프트웨어 유틸리티의 오류를 인용했다.인기 있는 단백질 구조 검증 도구를 철회된 MsbA 구조 중 하나에 적용하면 이 [11]구조에서 심각한 오류를 나타내는 점수가 나옵니다.

다음 [10][12]문서는 2007년에 철회되었습니다.

  • Chang, G; Roth, CB (2001). "Structure of MsbA from E. coli: a homolog of the multidrug resistance ATP binding cassette (ABC) transporters". Science. 293 (5536): 1793–800. Bibcode:2001Sci...293.1793C. doi:10.1126/science.293.5536.1793. PMID 11546864.
  • Pornillos, O; Chen, YJ; Chen, AP; Chang, G (2005). "X-ray structure of the EmrE multidrug transporter in complex with a substrate". Science. 310 (5756): 1950–3. Bibcode:2005Sci...310.1950P. doi:10.1126/science.1119776. PMID 16373573.
  • Reyes, CL; Chang, G (2005). "Structure of the ABC transporter MsbA in complex with ADP.vanadate and lipopolysaccharide". Science. 308 (5724): 1028–31. Bibcode:2005Sci...308.1028R. doi:10.1126/science.1107733. PMID 15890884. S2CID 37250061.
  • Chang, G (2003). "Structure of MsbA from Vibrio cholera: a multidrug resistance ABC transporter homolog in a closed conformation". J Mol Biol. 330 (2): 419–30. doi:10.1016/s0022-2836(03)00587-4. PMID 12823979.
  • Ma, C; Chang, G (2004). "Structure of the multidrug resistance efflux transporter EmrE from Escherichia coli". Proc Natl Acad Sci USA. 101 (9): 2852–7. Bibcode:2004PNAS..101.2852M. doi:10.1073/pnas.0400137101. PMC 365709. PMID 14970332.

이 에피소드는 컴퓨터 생물학의 소프트웨어 엔지니어링 관행 개선을 동기화하는 사례 연구로 과학[13] 및[14] 대중 매체 모두에서 언급되었습니다.

최근 작업

2009년, 장은 많은 약물을 포함한 특정 물질을 세포 밖으로 내보내는 단백질을 설명하는 논문을 [5]사이언스에 발표했다.P-당단백질 또는 줄여서 P-gp라고 불리는 이 단백질은 암세포가 화학요법 [15]약물에 내성을 갖는 주된 이유 중 하나이다.2010년,[6] 그는 과학자들에 의해 기술된 유일한 다제내성 운반체 등급에 속하는 MATE(다중항균성 압출 단백질) 패밀리 운반체 NorM의 구조를 자세히 설명하는 연구를 이끌었다.이 연구는 위험한 항생제 내성 균주를 퇴치하는 것뿐만 아니라 내구성 있는 농작물 [16]품종을 개발하는 데에도 영향을 미칩니다.

레퍼런스

  1. ^ "Geoffrey Chang". Arnold and Mabel Beckman Foundation. Retrieved 1 August 2018.
  2. ^ 스크립스 연구소 뉴스와 뷰.개요 1(9): 2001년 4월 2일.접속일 2001년 1월 17일
  3. ^ Robbins, Gary (9 Oct 2012). "Scripps Research Loses Fifth Talented Scientist". San Diego Union-Tribune. Retrieved 10 February 2015.
  4. ^ a b Miller, G (2006). "Scientific publishing. A scientist's nightmare: software problem leads to five retractions". Science. 314 (5807): 1856–7. doi:10.1126/science.314.5807.1856. PMID 17185570. S2CID 34054520.
  5. ^ a b Aller, S.; et al. (2009). "Structure of P-Glycoprotein Reveals a Molecular Basis for Poly-Specific Drug Binding". Science. 323 (5922): 1718–1722. Bibcode:2009Sci...323.1718A. doi:10.1126/science.1168750. PMC 2720052. PMID 19325113.
  6. ^ a b 그는 "카티온 결합 멀티드러그 및 독성 화합물 압출 트랜스포터 구조", http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature09408.html 등
  7. ^ Scripps Research Institute Geoffrey Chang, EURKA상 수상 http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20100920/etc.html
  8. ^ Higgins, CF; Linton, KJ (2001). "Structural biology. The xyz of ABC transporters". Science. 293 (5536): 1782–4. doi:10.1126/science.1065588. PMID 11546861. S2CID 83363016.
  9. ^ Dawson, RJ; Locher, KP (2006). "Structure of a bacterial multidrug ABC transporter". Nature. 443 (7108): 180–5. Bibcode:2006Natur.443..180D. doi:10.1038/nature05155. PMID 16943773. S2CID 27132450.
  10. ^ a b Chang, G; Roth, CB; Reyes, CL; Pornillos, O; Chen, YJ; Chen, AP (2006). "Retraction". Science. 314 (5807): 1875. doi:10.1126/science.314.5807.1875b. PMID 17185584. S2CID 220093343.
  11. ^ Wiederstein, M; Sippl, MJ (2007). "ProSA-web: interactive web service for the recognition of errors in three-dimensional structures of proteins". Nucleic Acids Res. 35 (Web Server issue): W407–10. doi:10.1093/nar/gkm290. PMC 1933241. PMID 17517781.
  12. ^ Gawrylewski A. (2006)수축은 구조 바이오를 불안정하게 합니다.최신 조사 결과는 5개의 높은 평가를 받은 논문 The Scientist 2007년 1월 4일 무료 전문 액세스 날짜 2007년 1월 17일로부터 결론을 내렸습니다.
  13. ^ Perkel, Jeffrey M. (29 June 2011). "Coding your way out of a problem". Nature Methods. 8 (7): 541–543. doi:10.1038/nmeth.1631. PMID 21716280. S2CID 13175560.
  14. ^ Tenner, Edward (7 December 2012). "Buggy Software: Achilles Heel of Big-Data-Powered Science?". The Atlantic. Retrieved 10 February 2015.
  15. ^ 과학자들이 암세포를 화학요법에 내성을 갖게 하는 단백질 구조를 발견하다 http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20090330/chang.html
  16. ^ Scripps Research Institute http://www.scripps.edu/news/press/20100922 Wayback Machine 2010-09-28 아카이브

외부 링크