글리칸 배열

Glycan array

기능 글리코믹스 컨소시엄(CFG), 국립 기능 글리코믹스 센터(NCFG), Z 바이오테크놀로지, LLC가 제공하는 것과 같은 글리카 배열에는 탄수화물 화합물이 들어 있으며, 탄수화물 특이성을 정의하고 리간드를 식별하기 위해 강의실, 항체 또는 세포 수용체로 선별할 수 있다.글리칸 배열 선별은 예를 들어 유전자 발현 DNA 마이크로레이 또는 단백질 상호작용 단백질 마이크로레이를 연구하는 데 사용되는 다른 마이크로 어레이와 거의 동일한 방식으로 작용한다.null

글리칸 배열은 다양한 과당류 및/또는 다당류로 구성되며 공간적으로 정의된 배열에서 견고한 지지대에 고정된다.[1]이 기술은 고투과 환경에서 글리칸과 단백질의 상호작용을 연구하는 수단을 제공한다.이러한 천연 또는 합성(탄수화물 합성 참조) 글리칸은 강의실, 세포 표면 수용체 또는 바이러스 같은 전체 유기체와 같은 글리칸 결합 단백질과 배양된다.결합은 형광 기반 검출 방법을 사용하여 정량화한다.null

적용들

글리칸 어레이 기술은 호스트와 병원체 상호작용의 특수성을 연구하기 위해 지금까지도 적용되어 왔다.[2]

초기에, 글리칸 배열은 독감 A 바이러스의 Hemaggluinin (인플루엔자a)의 특이성을 판단하고 다른 종류의 독감(유래종 조류 포함)을 구별하는데 유용하다는 것이 입증되었다.이는 CFG 어레이뿐만 아니라 맞춤형 어레이에서도 나타났다.[4]교차 플랫폼 벤치마크는 글리칸 표현과 간격이 결합에 미치는 영향을 강조하도록 이끌었다.[5]null

글리칸 배열을 표면 플라스몬 공명(SPR)과 같은 다른 기법과 결합하여 글리칸 결합의 특성화를 정교하게 할 수 있다.예를 들어, 이 조합은 염증, 사멸, 막 밀매를 포함한 몇 가지 생물학적 과정에 관여하는 Annexin A1의 칼슘 의존 헤파린 결합을 입증했다.[6]null

참조

  1. ^ Oyelaran O, Gildersleeve JC (Oct 2009). "Glycan arrays: recent advances and future challenges". Curr Opin Chem Biol. 13 (4): 406–413. doi:10.1016/j.cbpa.2009.06.021. PMC 2749919. PMID 19625207.
  2. ^ Geissner A, Anish C, Seeberger PH (Feb 2014). "Glycan arrays as tools for infectious disease research". Curr Opin Chem Biol. 18: 38–45. doi:10.1016/j.cbpa.2013.11.013. PMID 24534751.
  3. ^ Stevens J, Blixt O, Tumpey TM, Taubenberger JK, Paulson JC, Wilson IA (Apr 2006). "Structure and receptor specificity of the hemagglutinin from an H5N1 influenza virus". Science. 312 (5772): 404–410. Bibcode:2006Sci...312..404S. doi:10.1126/science.1124513. PMID 16543414.
  4. ^ Childs RA, Palma AS, Wharton S, Matrosovich T, Liu Y, Chai W, Campanero-Rhodes MA, Zhang Y, Eickmann M, Kiso M, Hay A, Matrosovich M, Feizi T (Sep 2009). "Receptor-binding specificity of pandemic influenza A (H1N1) 2009 virus determined by carbohydrate microarray". Nat Biotechnol. 27 (9): 797–799. doi:10.1038/nbt0909-797. PMC 3771066. PMID 19741625.
  5. ^ Wang L, Cummings RD, Smith DF, Huflejt M, Campbell CT, Gildersleeve JC, Gerlach JQ, Kilcoyne M, Joshi L, Serna S, Reichardt NC, Parera Pera N, Pieters RJ, Eng W, Mahal LK (Jun 2014). "Cross-platform comparison of glycan microarray formats". Glycobiology. 24 (6): 507–17. doi:10.1093/glycob/cwu019. PMC 4001710. PMID 24658466.
  6. ^ Horlacher T, Noti C, de Paz JL, Bindschädler P, Hecht ML, Smith DF, Fukuda MN, Seeberger PH (Apr 2011). "Characterization of annexin A1 glycan binding reveals binding to highly sulfated glycans with preference for highly sulfated heparan sulfate and heparin". Biochemistry. 50 (13): 2650–9. doi:10.1021/bi101121a. PMC 3068229. PMID 21370880.