HNCA 실험

4개의 순차적 잔류물에 대한 HNCA 및 HNCOCA의 개략도.질소-15 치수는 스크린에 수직입니다.각각의 창은 아미노산의 질소 화학적 변화에 초점을 맞추고 있습니다.순차 할당은 알파 탄소 화학 변화를 일치시켜 이루어집니다.

HNCA는 단백질 NMR 분야에서 일반적으로 사용되는 3D 3중 공진 NMR 실험입니다.이 이름은 실험의 자화 전달 경로에서 유래했습니다.아미노산 잔기의 아미드 양성자의 자화는 아미노산 배열의 시작 잔기와 이전 잔기의 알파 탄소로 전달된다.이와는 대조적으로, 보완적인 HNCOCA 실험은 자화를 이전^[1] 잔류물의 알파 탄소에만 전달합니다.HNCA 실험은 종종 HNCOCA와 함께 단백질의 특정 잔류물에 알파 탄소 공명 신호를 할당하기 위해 사용됩니다.이 실험은 0.1 mM 이상의 농도로 C 및 N 동위원소 라벨링으로 제조된 단백질의 정제 시료를 필요로 하므로 일반적으로 재조합 단백질에만 적용한다.

이 실험에서 생성된 스펙트럼은 양성자 축, N 축, C 축의 3가지 차원으로 구성됩니다.나머지 i 피크는 {H_N(i), N(i), C_alpha(i)} 및 {H_N(i), N(i), C_alpha(i-1)}에 나타나는 반면 보완 HNCOCA 실험 피크는 {H_N(i), N(i), C_alpha(i-1)}에만 나타납니다.이 두 가지 실험은 함께 단백질의 각 아미노산 잔기에 대한 알파 탄소 화학적 변화를 밝히고 단백질 배열에서 인접한 잔기를 연결하는 정보를 제공한다.

레퍼런스

인용문

1. ^ Bax A, Ikura M (May 1991). "An efficient 3D NMR technique for correlating the proton and 15N backbone amide resonances with the alpha-carbon of the preceding residue in uniformly ¹⁵N/¹³C enriched proteins". J. Biomol. NMR. 1 (1): 99–104. doi:10.1007/BF01874573. PMID 1668719.

일반 참고 자료

단백질 NMR 분광학: 원칙과 실천(1995) 존 카바나, 웨인 J. 페어 브라더, 아서 G. 팔머 3세, 니콜라스 J.Skelton, 학술 출판사