잘뷰
Jalview | |
| 개발자 | Dunde 대학의 Andrew Waterhouse, James Procter, David Martin, Geoffrey Barton. Michelle Clamp, James Capt, Stephen Searle, Geoffrey Barton의 오리지널 버전. |
|---|---|
| 안정적 해제 | 2.11.2[1] / 2022년 3월 10일; 전 |
| 기록 위치 | 자바 |
| 운영 체제 | UNIX, 리눅스, Mac OS X, 마이크로소프트 윈도우즈 |
| 유형 | 생물정보학 도구 |
| 면허증 | GPL |
| 웹사이트 | http://www.jalview.org |
Jalview는 다중 시퀀스 정렬을 보고 편집하는 데 사용되는 생물정보학 소프트웨어다.이 프로그램은 원래 옥스퍼드 대학교와 유럽 생물정보학 연구소(EBI)에서 제프 바튼의 그룹에서 일하면서 미슐 클램프가 썼다.[2]앤드류 워터하우스와 짐 프록터가 던디대 생명과학대학의 제프 바튼의 그룹에서 근무하면서 제작한 재설계 버전인 잘뷰 2는 2005년 출시됐으며,[3] 개발은 생명공학생명과학연구회(BBSRC)와 웰컴 트러스트(Wellcome Trust)가 지원하고 있다.
다양한 웹 서버(예: EBI ClustalW 서버 및 Pfam 단백질 도메인 데이터베이스)에서 널리 사용되지만 범용 정렬 편집기로도 사용할 수 있다.
잘뷰는 다중 시퀀스 정렬 생성, 보기 및 편집 외에도 계통생성 나무 계산, 분자 구조 보기 등 다양한 기능이 있다.Jalview의 최근 버전에는 공용 데이터베이스 또는 로컬 VCF(Variant Call Format) 파일의 유전적 변이 분석을 위한 기능이 포함되어 있다.Jalview는 데이터를 가져오고 계산을 수행하기 위해 많은 외부 웹 서비스에 연결된다.
참고 항목
참조
- ^ "Release History".
- ^ Clamp M, Cuff J, Searle SM, Barton GJ (February 2004). "The Jalview Java alignment editor". Bioinformatics. 20 (3): 426–7. doi:10.1093/bioinformatics/btg430. PMID 14960472.
- ^ Waterhouse AM, Procter JB, Martin DM, Clamp M, Barton GJ (May 2009). "Jalview Version 2--a multiple sequence alignment editor and analysis workbench". Bioinformatics. 25 (9): 1189–91. doi:10.1093/bioinformatics/btp033. PMC 2672624. PMID 19151095.
