저널 아티클 태그 스위트

Journal Article Tag Suite
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Jats-logo.jpg
약어재츠
상태출판된
초간출판2003년 3월 31일(2003-03-31)
최신 버전NISO JATS 1.2
2019년 2월 8일(2019-02-08)
조직
작가들
기준 표준XML
관련규격
  • NISO 표준 태그 세트(NISO-STS)
  • BITS(Book Interchange Tag Suite)
  • SPS(SciELO 게시 스키마)
도메인
웹사이트jats.nlm.nih.gov

저널 기사 태그 스위트(JATS)는 온라인에서 출판되는 과학 문헌을 기술하는 데 사용되는 XML 형식이다. NISO(National Information Standards Organization)가 개발하고 미국 국가표준연구소가 Z39.96-2012 코드를 승인한 기술표준이다.

NISO 프로젝트는 NLM/NCBI가 수행한 작업의 연속이었고, NLM의 PubMed Central에 의해 과학 오픈 액세스 저널 및 그 내용을 XML과 교환하기 위한 사실상의 표준으로 대중화되었다.

NISO 표준화를 통해 NLM 이니셔티브는 더 넓은 범위를 얻었으며, SciELO와 Redalyc와 같은 몇몇 다른 리포지토리는 과학 기사의 XML 형식을 채택했다.

JATS는 저널 기사의 텍스트 및 그래픽 내용과 편지, 사설, 책 및 제품 리뷰와 같은 일부 비기사 자료를 설명하기 위한 XML 요소 및 속성 세트를 제공한다.[1] JATS는 전체 기사 내용 또는 기사 헤더 메타데이터에 대한 설명을 허용하며, 연구 및 비연구 기사, 서신, 사설, 도서 및 제품 리뷰를 포함한 다른 종류의 콘텐츠도 허용한다.

역사

NCBI의 NLM 아카이빙 및 인터체인지 DTD 제품군은 도입 이후 학술지 논문 표기의 사실상의 표준이 되었다.[2] NISO JATS의 도입으로 진정한 표준으로 격상되었다.[3] 공공 데이터 교환이 없더라도 NISO JATS 채택의 이점은 생산 워크플로우의 효율화와 시스템 상호운용성 최적화 측면에서 출판사에 유리하다.[4][5]

타임라인

NLM JATS
NLM JATS, 버전 1
  • 2003년 3월 31일(2003-03-31): NLM DTD v1.0 도입.[6]
  • 2003년 11월 5일(2003-11-05): 버전 1.1 업데이트가 릴리스됨[6]
NLM JATS, 버전 2
  • 2004년 12월 30일 (2004-12-30): 버전 2.0 주요 업데이트 발표. 그것은 맞춤화 베스트 프랙티스를 지원하도록 설계되었다.[6]
  • 2005년 11월 14일 (2005-11-14): 기사 Authoring DTD가 추가된 버전 2.1 업데이트.[6][7]
  • 2006년 6월 8일(2006-06-08): 버전 2.2 업데이트가 릴리스됨.[6]
  • 2007년 3월 28일(2007-03-28): 버전 2.3 업데이트가 릴리스됨[6]
NLM JATS, 버전 3
  • 2008년 11월 21일(2008-11-21): 버전 3.0 주요 업데이트가 릴리스됨.[6][7]
NISO JATS
NISO JATS 버전 1.0
  • 2011년 3월 30일(2011-03-30) – 2011년 9월 30일(2011-09-30): 초안, NISO Z39.96.201x 버전 0.4 공개; 6개월의 의견 제출 기간.[8]
  • 2012년 7월 15일(2012-07-15): NISO JATS, v1.0은 NISO 승인을 받았다.[9]
  • 2012년 8월 9일(2012-08-09): NISO JATS, v1.0은 ANSI 승인을 받았다.[9]
  • 2012년 8월 22일(2012-08-22): ANSI/NISO Z39.96-2012, JATS: 저널 기사 태그 스위트(버전 1.0) 발행 NLM JATS v3.0과의 완전 역호환성을 지원한다.[6][9]
NISO JATS 버전 1.1
  • 2013년 12월 9일(2013-12-09): 초안 NISO JATS v1.1d1 공개.[10]
  • 2014년 12월 29일(2014-12-29): 2차 드래프트, NISO JATS v1.1d2 공개[11]
  • 2015년 4월 14일(2015-04-14): 3차 드래프트, NISO JATS, v1.1d 공개.[12]
  • 2015년 10월 22일(2015-10-22): NISO JATS, v1.1은 NISO 승인을 받았다.[13]
  • 2015년 11월 19일(2015-11-19): NISO JATS, v1.1이 ANSI 승인을 받았다.[13]
  • 2016년 1월 6일(2016-01-06): ANSI/NISO Z39.96-2015, JATS: Journal 아티클 태그 스위트 버전 1.1 출판.[13]
NISO JATS 버전 1.2
  • 2017년 7월 20일(2017-07-20): 초안 NISO JATS v1.2d1 공개.[14]
  • 2018년 5월 23일(2018-05-23): 초안, NISO JATS, v1.2d2 공개.[15]
  • 2019년 2월 8일 (2019-02-08) : ANSI/NISO Z39.96-2019, JATS: Journal 기사 Tag Suite 버전 1.2 출판.[16]
NISO JATS 버전 1.3
  • 2021년 7월 7일(2021-07-07): ANSI/NISO Z39.96-2021, JATS: Journal 기사 태그 스위트 버전 1.3.[17]

기술 범위

설계상 이것은 STM 저널에서 발견되는 전형적인 연구 기사와 같은 저널 기사의 모델이며, 완전한 저널의 모델이 아니다.[18]

태그 집합

3가지 사양. 그들의 색상 코드 문서 때문에, 구어체로 색상으로 언급된다.

세 가지 태그 세트가 있다.

저널 아카이빙 및 교환(녹색)
"태그 세트의 가장 허용 가능한 기능"[19]은 주로 기존의 저널 데이터를 캡처하고 보관하기 위한 것이다.
저널 게시(파란색)
저널 제작 및 출판에서 일반 용도로 사용되는 "적절하게 규범적인 태그 세트".[19]
공식적으로 이 모델은 아카이빙 모델의 하위 집합이다. 이것은 가장 자주 사용되는 JATS 변종이다.
기사 작성(오렌지)
JATS에 유효한 저널 기사를 비교적 경량하게 작성하기 위한 "태그 세트 중 가장 규범적인[최소]".[19]
공식적으로 이 모델은 출판 모델의 서브셋이다.

문서 유형 정의(REACE NG와 XML 스키마 형태로도 공개됨)는 각 세트를 정의하고 MathML 및 XHTML 테이블과 같은 다른 표준을 통합한다(XHTML 네임스페이스에는 없지만).

문서 구조

JATS Publishing set(JATS 출판 세트)는 기사, 책 또는 제품 리뷰, 편집자에게 보내는 편지 등 저널의 최상위 구성요소인 문서를 정의한다. 이러한 각 문서는 전면 물질(필수)과 최대 3개의 선택적 부분으로 구성된다.[18] 다음 순서에 따라 표시되어야 한다.

앞면 물질
기사 앞부분에는 기사 제목, 기사 제목, 해당 저널의 발행일 및 발행일, 저작권 성명 등 기사의 메타데이터가 포함되어 있다. 문서 수준 및 이슈 수준 메타데이터 모두(요소 내) <article-meta>) 및 저널 레벨 메타데이터(요소 내) <journal-meta>)은 포획할 수 있다.
본문(기사)
기사의 본문은 기사의 주요 텍스트 및 그래픽 내용이다. 이것은 일반적으로 그림, 표, 사이드바(상자 텍스트) 등을 포함할 수 있는 단락과 섹션으로 구성된다. 기사 본문은 기사 헤더 정보를 보관하고 텍스트 내용에 태그를 지정하지 않는 리포지토리를 수용하기 위해 선택사항이다.
뒷물
기사 뒷면은 용어집, 부록 또는 인용 참조 목록과 같이 본문에 부수되는 정보를 포함한다.
부유물질
출판사는 기사의 모든 부유물 및 그 뒷물(표, 그림, 상자형 텍스트 사이드바 등)을 서사 흐름 밖의 별도 용기 요소에 배치하여 처리의 편의를 도모할 수 있다.[18]

앞·몸·뒤·부재에 이어 기사에 대한 대응이 1개 이상 있거나 부하 기사에 1개 이상 있을 수 있다.[18]

예

이건 최소한의 기사 구조지만 

<?xml 버전="1.0" 인코딩="UTF-8"?> <!DOCTYPE article   PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.0 20120330//EN"          "JATS-journalpublishing1.dtd" > <article dtd-version="1.0" article-type="article" specific-use="migrated" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" > <front>...</앞쪽> <몸>...</몸> <뒤로>...</뒤로> </기사>

그 DOCTYPE 헤더는 SGML 및 DTD 지향 검증자의 레거시인 선택 사항이다. 그 dtd-version 속성은 DTD 헤더 없이도 사용될 수 있다.

루트 요소 article NLM DTD로서 JATS 또는 "JATS 제품군"의 모든 버전에 공통적이다. 에 대한 규칙. front, body 그리고 back 태그 검증은 JATS 버전에 따라 다르지만, 모든 버전은 유사한 구조를 가지며, 몇 년 내에 호환성이 양호하다. 스키마의 진화는 전체적인 안정성을 보존한다.

덜 일반적인, "만" front", "만" front 그리고 back"변형은 전체 내용 표현 이외의 다른 최종 결정에도 사용된다. 일반적인 기사 구성(DTD-내용 표현으로서)은 다음과 같다. 

   (전면, 신체?, 등?, 부유 그룹?, (하위 조항* 응답*)

도구들

JATS 생성, 편집, 변환 및 변환을 위한 다양한 도구가 있다. 단순한 양식에서[20] 완전한 변환 자동화에 이르는 다양한 기능:

JATS로의 변환

과학 문서를 입력하여 JATS 출력을 생성하십시오.

  • JATS에 대한 OpenOffice(LibreOffice) 및 MS Word 문서:
    • 유형 집합: MS-Word에서 JATS XML로 변환할 수 있는 자동 변환기 세트 제공
    • OxGarage:[21] 다양한 형식의 문서를 "NLM(National Library of Medicine) DTD 3.0"으로 변환할 수 있다.
    • MeTypeset: meTypeset은[22] "OxGarage 스택의 포크" "Microsoft Word .docx 형식에서 NLM/JATS-XML 형식으로 변환".
    • eXtyles:[23] Microsoft Word의 문서 편집 및 JATS XML(다른 많은 DTD와 마찬가지로)으로 내보내기 위해 시간이 많이 소요되는 측면을 자동화한다.
  • JATS로 인하: Pandoc 2.0은 여러 입력 형식을 JATS로 변환할 수 있다.[24]
  • PDF to JATS: 이것은 해결하기 매우 어려운 문제다. 성공 여부는 PDF의 구조와 배치 변환을 위해 PDF가 얼마나 일관성 있게 구성되었는지에 따라 결정된다.
    • 샤바시 메롭스[25]
    • Typeset의 PDF-JATS XML 변환기
    • Public Knowledge Project는[26] PDF를 JATS로 변환하기 위한 파이프라인을 개발하고 있다. 여기에는 pdfx의 사용이 포함될 것이다.[27]
    • CERMINE 컨텐츠 ExtRactor 및 MINR

JATS에서 변환

JATS를 입력으로 사용하고, 출력물로 다른 종류의 문서를 작성한다.

  • JATS에서 HTML로
    • JATS Preview Stylesheets(카논어 XSLT 변환)는 클래식(2013) 변환기를 참조하십시오.[29]
    • eLife Lens는[30] HTML과 Javascript를 사용하여 표시하기 위해 NLM XML을 JSON으로 변환한다.
  • JATS에서 PDF로: 일부 JATS 미리보기 스타일시트, XSLT + XSL-FO 변환.
  • JATS에서 [31]EPUB까지요
  • 일반(JATS DTD: DtdAnalyzer[32]): DtdAnalyzer — JATS를 다른 DTD와 비교하고 XML 표현, XSLT 및 Schematron 생성 및 기타 도구를 만드는 데 도움이 된다.

편집자

  • Typeset은 학술적인 기사를 위한 WYSIWIM 편집기를 제공한다. NISO JATS 및 NLM JATS 표준에서 XML 엑스포트를 지원한다. 저자가 제출한 MS-Word 파일을 XML, PDF, HTML, ePuB로 변환하려는 저널스와 퍼블리셔가 주로 사용한다. [33]
  • JATS Framework for oXygen XML Editor: oXygen XML Editor 및 oXygen XML Author의 사용자는 현재 버전의 NISO JATS(그리고 보너스로 NLM BITS)에 대한 지원을 설치할 수 있다. DOCTYPE 선언에 제공된 식별자에 따라 oXygen은 사용자가 JATS 문서를 편집하고 있음을 감지하고 스타일시트와 유틸리티를 제공한다.[34]
  • FontoXML for JATS: WYSIWYS 편집기: JATS 콘텐츠 편집 및 검토:[35]
  • PubRef "Pipeline": 브라우저 기반 실시간 미리 보기 JATS 편집기:[36]
  • Annotum:[37] WYSIWYG의 JATS(Kipling subset), 동료 검토 및 편집 관리, 게시 등이 포함된 WordPress 테마.[38]
  • 웹 기반 XML 편집기 Xeditor용 JATS 버전.
  • 물질 컨소시엄의 텍스처 편집자[39].[40] 첫 번째 온라인 "JATS에서 출생" 편집자.[41]
  • eLife가 개발한 Libero Editor는 스스로를 '고품질 JATS XML의 생산을 위해 출판사 직원과 저자를 위해 설계된 사용자 친화적인 편집 인터페이스'라고 설명한다.

미리보기

일반적으로 즉시 JATS를 HTML로 렌더링하는 도구.

  • JATS Preview Stylesheets: [42]JATS Preview Stylesheets는 유효한 NISO Z39.96-2012 JATS 1.0 파일의 .html 또는 .pdf 버전을 생성하는 .xsl, .xpl, .css 및 .sch 파일의 시리즈다. 그것은 주로 출판사에 의한 내부적인 사용을 위한 것이며 맞춤 제작을 위한 기초가 된다.[43]
  • 유형 집합 - 클릭 한 번으로 JATS XML에서 HTML을 생성할 수 있음. 또한, 저널의 요구사항에 따라 사용자 정의 HTML을 생성할 수 있는 용량을 제공한다. [44]
  • PubReader – "PubReader 보기는 대체 웹 프레젠테이션... 특히 태블릿과 기타 소형 스크린 기기에서 가독성을 높이기 위해 설계된 PubReader는 데스크톱, 노트북 및 다중 웹 브라우저에서도 사용할 수 있다.[45]

사용자 지정

  • Jatsdoc - 특정 JATS 사용자 정의에 대한 문서 작성. 자츠닥은 NCBI의 DtdAnalyzer와 통합되어 있다.[46][47]

JATS 중앙 저장소

NISO JATS가 오픈 액세스 저널에 대한 사실상의, 그리고 de jure 표준을 시작함에 따라, 과학계는 JATS 저장소를 일종의 법적 보증금으로서, 때로는 PDF 버전만 저장되어 있는 기존의 디지털 도서관보다 더 가치 있는 것으로 여겨지고 있다. 개방형 지식은 JATS처럼 풍부하고 구조화된 포맷이 필요하다: PDF와 JATS는 "동일한 콘텐츠"로 인증되어야 하고, 법적 보증금 단위를 형성하는 "PDF+JATS" 세트는 "PDF+JATS"로 인증되어야 한다. JATS 리포지토리 목록 및 포함된 목록:

이러한 리포지토리는 중복되며 동일한 기사가 둘 이상의 리포지토리에 의해 보관될 수 있다.

대안 및 의미

JATS 커뮤니티에는 영향이 없는 2012년 RDF 전환을 이용한 노력과 실험이 있다.[51]

이후 ~2016년, 시멘틱 웹 컨텍스트의 경우 SchemaOrg 이니셔티브로 ScholarLyPriter 클래스가 정의되어 더 좋은 수신률을 받았다. 그것은 RDF 이용 상황에 대한 초기 "JATS와 유사한 표준화"이다.

참고 항목

관련

사용(디지털 보존)

사용(게시)

와 유사하다.

참조

  1. ^ ANSI/NISO Z39.96-2012 ISSN1041-5653. www.niso.org/standards/z39-96-2012에서 z39.96-2012.pdf를 참조하십시오.
  2. ^ Beck, J (2011). "NISO Z39.96The Journal Article Tag Suite (JATS): What Happened to the NLM DTDs?". The Journal of Electronic Publishing. 14 (1). doi:10.3998/3336451.0014.106. PMC 3227009. PMID 22140303.
  3. ^ Zimmerman, Sara (2012). "The new NISO journal Article Tag Suite standard". Zeeba.tv.
  4. ^ Donohoe, Paul; Sherman, Jenny; Mistry, Ashwin (2015). "The Long Road to JATS". Journal Article Tag Suite Conference (JATS-Con) Proceedings 2015. JATS-Con 2015. Bethesda, MD: National Center for Biotechnology Information.
  5. ^ Usdin, Tommie; Lapeyre, Deborah Aleyne; Glass, Carter M. (2015). "Superimposing Business Rules on JATS". Journal Article Tag Suite Conference (JATS-Con) Proceedings 2015. JATS-Con 2015. Bethesda, MD: National Center for Biotechnology Information.
  6. ^ a b c d e f g h "NLM Journal Archiving and Interchange Tag Suite". National Center for Biotechnology Information. 13 September 2012. Archived from the original on 27 August 2016.
  7. ^ a b "JATS and the NLM DTDs". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information. 8 January 2016. Archived from the original on 7 March 2016.
  8. ^ "NISO JATS v0.4: Draft Standard for Trial Use". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information.
  9. ^ a b c "ANSI/NISO Z39.96-2012 JATS: Journal Article Tag Suite". National Information Standards Organization. 26 July 2013.
  10. ^ "JATS v1.1d1 (DRAFT)". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information. 14 April 2015.
  11. ^ "JATS v1.1d2 (DRAFT)". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information. 14 April 2015.
  12. ^ "JATS v1.1d3 (DRAFT)". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information. 14 April 2015.
  13. ^ a b c "ANSI/NISO Z39.96-2015 JATS: Journal Article Tag Suite". National Information Standards Organization. 8 January 2016.
  14. ^ "JATS v1.2d1". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information.
  15. ^ "JATS v1.2d2". Journal Article Tag Suite. National Center for Biotechnology Information.
  16. ^ "ANSI/NISO Z39.96-2019, JATS: Journal Article Tag Suite, version 1.2". National Information Standards Organization. 8 February 2019.
  17. ^ "ANSI/NISO Z39.96-2021, JATS: Journal Article Tag Suite, version 1.3". National Information Standards Organization. 7 July 2021.
  18. ^ a b c d "General Introduction". Journal Publishing Tag Library NISO JATS Version 1.0. National Center for Biotechnology Information. August 2012.
  19. ^ a b c "JATS: Journal Article Tag Suite". National Center for Biotechnology Information.
  20. ^ 2012년 의미 출판.wordpress.com JATS 메타데이터 입력 양식.
  21. ^ 아마존닷컴(http://www.oucs.ox.ac.uk/oxgarage/)
  22. ^ "MartinPaulEve/meTypeset". GitHub. 2019-06-20.
  23. ^ "eXtyles".
  24. ^ https://pandoc.org/MANUAL.html#general-options
  25. ^ "Merops: Powerful AI for publishers and copy editors".
  26. ^ "Public Knowledge Project".
  27. ^ Constantin, S.Pettifer (2013). "PDFX: fully-automated PDF-to-XML conversion of scientific literature". Proceedings of the 2013 ACM Symposium on Document Engineering - DocEng 13: 177–180. doi:10.1145/2494266.2494271.
  28. ^ "CERMINE".
  29. ^ 2013년 https://github.com/ncbi/JATSPreviewStylesheets
  30. ^ "eLife Lens".
  31. ^ biglist.com/mulberrytech msg 및 ncbi.nlm.nih.gov/books 문서 설명
  32. ^ "ncbi/DtdAnalyzer". GitHub. 2019-04-19.
  33. ^ "Journal archiving schema and tag libraries". Typeset.
  34. ^ "wendellpiez/oXygenJATSframework". GitHub. 2019-06-24.
  35. ^ https://fontoxml.com/jats/
  36. ^ https://pubref.org
  37. ^ "Annotum".
  38. ^ Carl Leubsdorf, Jr (2011). Annotum: An open-source authoring and publishing platform based on WordPress. Journal Article Tag Suite Conference (JATS-Con) Proceedings 2011 - NCBI Bookshelf.
  39. ^ "GitHub - substance/Texture: A visual editor for research". 2019-06-25.
  40. ^ "Substance Consortium".
  41. ^ "혼합물 - 개방형 과학 원고 편집자", https://elifesciences.org/labs/8de87c33
  42. ^ "ncbi/JATSPreviewStylesheets". GitHub. 2019-02-11.
  43. ^ Wendell Piez (2010). Fitting the Journal Publishing 3.0 Preview Stylesheets to Your Needs: Capabilities and Customizations. Journal Article Tag Suite Conference (JATS-Con) Proceedings 2010 - NCBI Bookshelf.
  44. ^ "Typeset for Journals and Publishers". Typeset For Publishers. 4 January 2020.
  45. ^ 소스 코드가 있는 NCBI/PubReader(github.com/ncbi/PubReader
  46. ^ Maloney, Chris (2017-09-08). "Jatsdoc Documentation Browser". GitHub.
  47. ^ "DtdAnalyzer: A tool for analyzing and manipulating DTDs". Journal Archiving and Interchange Tag Suite. National Center for Biotechnology Information.
  48. ^ PMC 홈, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
  49. ^ PMC 유럽, "정보" 페이지, http://europepmc.org/About
  50. ^ SciELO 홈, http://www.scielo.org/php/index.php?lang=en
  51. ^ From Markup to Linked Data: Mapping NISO JATS v1.0 to RDF using the SPAR (Semantic Publishing and Referencing) Ontologies. National Center for Biotechnology Information (US). 2012.

추가 읽기

외부 링크