격자 모형(생물 물리학)

Lattice model (biophysics)

생물물리학에서 격자 모델은 생물학적 고분자(DNA, 단백질, 액틴 등)를 단위 격자로 간주하는 통계-기계 모델의 클래스를 나타내며, 각 단위는 서로 다른 상태 또는 구성에 있다.

예를 들어 염색질의 DNA는 1차원 격자로 표현될 수 있으며, 그 기본 단위는 뉴클레오티드, 염기쌍 또는 뉴클레오솜이다.단위의 다른 상태는 화학적 변형(예: DNA 메틸화 또는 DNA 결합 히스톤의 변형) 또는 양자화된 내부 자유도(예: 두 인접 단위가 결합하는 다른 각도) 또는 주어진 단위와 관련된 결합 이벤트(예: 작은 리간드의 가역 결합)에 의해 실현될 수 있다.DNA에 [1]대한 단백질 또는 DNA 염기쌍에서 두 개의 상보적 뉴클레오티드의 결합/결합 해제).

DNA배위자결합모델

DNA 이중나선 용해 모델

DNA코일글로불/프랙탈모델

레퍼런스

  1. ^ Teif VB, Rippe K. (2010). "Statistical-mechanical lattice models for protein-DNA binding in chromatin". J. Phys.: Condens. Matter. 22 (41): 414105. arXiv:1004.5514. Bibcode:2010JPCM...22O4105T. doi:10.1088/0953-8984/22/41/414105. PMID 21386588. S2CID 103345.

추가 정보

  • Ewans J. W. (1993)무작위적이고 협력적인 순차 흡착.모드 목사님물리, 65, 1281-1329]
  • 폴란드 D., 셰라가 H.A.(1970).생체고분자에서의 나선-코일 전이 이론: 생물학적 고분자에서의 질서-무질서 전이 통계역학 이론.학술 출판사, 797쪽.
  • 호클로프 A.R., 그로스버그 A.1997년.고분자 통계물리학ISBN 1563960710