누출형 스캐닝

Leaky scanning

누출형 스캐닝은 진핵 변환의 개시 단계에서 사용되는 메커니즘으로 유전자 발현 조절이 가능하다.개시 중, 소형 40S 리보솜 서브 유닛(43S PIC로서) "scan" 또는 5' -> 3' 방향으로 5를 따라 이동한다.UTR은 장정을 시작하기 위한 출발 코돈을 찾는다.때때로 스캔 리보솜은 초기 AUG 시작 코돈을 우회하여 더 하류 AUG 시작 코돈에서 번역을 시작한다.[1]대부분의 스캔 메커니즘에 따른 진핵 세포의 번역은 mRNA의 5' 끝의 근위부 AUG 시작 코돈에서 발생하지만, 스캔 리보솜은 시작 코돈 주변에서 "불호한 뉴클레오티드 컨텍스트"에 직면하고 계속 스캔할 수 있다.[2]

개시가 비 AUG 코돈에서 업스트림에서 발생하는 것으로 확인된 특정 사례가 있다.일관된 G-C 풍부한 리더 시퀀스를 포함하는 진핵 유전자가 이 메커니즘을 수행하는 것이 자주 관찰된다.Met-tRNA와 불일치 코돈의 결합을 가능하게 하는 2차 구조 때문에 스캔이 느려진다는 가설이 있다.[3]

몇몇 바이러스는 누출형 스캐닝 메커니즘을 사용하여 중요한 단백질을 생성하는데, 누출형 스캐닝은 불충분한 결과물이 아니라 오히려 바이러스가 호스트와 경쟁하는 높은 선택적 압력을 극복할 수 있도록 한다.[4]분자생물학자들은 번역의 시작을 위한 이상적인 뉴클레오티드 환경, 그리고 바이러스가 복제되는 메커니즘에 대한 검색을 좁혀가고 있다.[1]

디스커버리

여러 연구를 통해 Marilyn Kozak은 포유류 세포에서 번역을 시작하는 동안 스캔의 주요 역할을 처음으로 인식했다.포유류에서 AUG 코돈은 "코자크 컨센서스 시퀀스"로도 알려진 GCCRCCAUG의 맥락에서 최적으로 인식된다.[5]푸린(R)과 이 시퀀스 내의 각 뉴클레오티드는 보존성이 뛰어나며 많은 40S 리보솜 하위 유니트에 대한 인식과 번역 개시에서 중요한 기능을 제공한다.AUG 시작 코돈에서 최적의 컨텍스트를 가진 리보솜은 그 시점에서 시작을 시작할 것이다.AUG 시작 코돈에 인접한 시퀀스가 컨센서스 시퀀스에서 이탈한 경우 약한 컨텍스트가 발생한다.몇몇 리보솜은 여전히 약한 위치에서 번역을 시작할 것이지만 대다수는 누출된 스캔을 수행하고 하류를 시작할 것이다.그 결과, 다른 단백질들이 생성될 가능성이 있다.[3]

참고 항목

참조

  1. ^ a b 코작, 마릴린."원핵생물 및 진핵생물에서의 번역 개시"진 234(1999년) : 187-208.학술 검색 완료.웹. 2014년 6월 10일.
  2. ^ 헤르조그, 에티엔 등"누출 스캔 인 체외에서 땅콩 클럼프 바이러스 RNA 2의 두 번째 유전자 번역이 일어난다."비뇨기과 208. (1995년): 215-225.학술 검색 완료.웹. 1014년 6월 10일.
  3. ^ a b 코작, 마릴린."번역 개시라는 스캐닝 메커니즘의 한계를 밀어내는 것."유전자 299(2002년): 1-34.학술 검색 완료.웹. 2014년 6월 11일.
  4. ^ 랴보바, 류보프 등"식물 바이러스의 번역 재활성화 및 누출형 스캐닝바이러스 연구 119(2006년): 52-62 학술 검색 완료.웹. 2014년 6월 23일.
  5. ^ 히네부쉬, 앨런 "유카리오테에서 스캔의 분자 메커니즘과 코돈 선택을 시작하라"미국미생물학회 제75권 제3호(2011년): 434-467호.웹. 2014년 6월 11일.