MAVID
MAVID |
| 개발자 | Nicolas Bray(UC Berkeley), Lior Pachter(UC Berkeley) |
|---|---|
| 안정된 릴리스 | 2.0.4 |
| 운영 체제 | UNIX, Linux, Mac |
| 유형 | 바이오 인포매틱스 툴 |
| 라이선스 | 오픈 소스 |
| 웹 사이트 | MAVID 다운로드 |
MAVID는 다수의 DNA [1][2]배열 정렬에 적합한 다중 배열 정렬 프로그램입니다.배열은 작은 미토콘드리아 유전체 또는 메가베이스까지의 큰 유전체 영역일 수 있습니다.최신 버전은 2.0.4입니다.
이 프로그램은 MAVID 웹 서버를 통해 사용하거나 소스 코드를 사용하여 설치할 수 있는 독립 실행형 프로그램으로 사용할 수 있습니다.
입력/출력
이 프로그램은 FASTA 형식의 시퀀스를 수신합니다.
출력 형식에는 FASTA 형식, 클러스터링, PHYLIP가 포함됩니다.
레퍼런스
- ^ Dewey, Colin N. (2007), "Aligning Multiple Whole Genomes with Mercator and MAVID", in Bergman, Nicholas H. (ed.), Comparative Genomics, Methods in Molecular Biology, vol. 395, Humana Press, pp. 221–235, doi:10.1007/978-1-59745-514-5_14, ISBN 978-1-58829-693-1, PMID 17993677
- ^ Bray, Nicolas; Pachter, Lior (2003-07-01). "MAVID multiple alignment server". Nucleic Acids Research. 31 (13): 3525–3526. doi:10.1093/nar/gkg623. ISSN 0305-1048. PMC 169029. PMID 12824358.
- 를 클릭합니다Bray, N.; Pachter, L. (2004), "MAVID: Constrained ancestral alignment of multiple sequences", Genome Research, 14 (4): 693–699, arXiv:q-bio/0311018, doi:10.1101/gr.1960404, PMC 383315, PMID 15060012.
