FGED 소사이어티

FGED Society
FGED 소사이어티
Mged logo.png
약어FGED
포메이션1999
유형NPO
목적과학적인
공용어
영어
대통령
프랜시스 오울렛
메인 오르간
이사회
웹사이트fged.org

기능적 GENMIC 데이터 소사이어티(FGED)(구 MGED 소사이어티)는 데이터 통합을 통해 생물학적, 생물학적, 생물학적 발견을 촉진하는 것을 목적으로 하는 생물학자, 컴퓨터 과학자, 데이터 분석가들로 구성된 비영리 자원봉사 국제 조직이다.FGED의 접근방식은 주로 기능 유전체학 영역 내에서 대용량 데이터 세트를 생성하는 고투과 기술을 통해 생성된 기초 연구 데이터의 공유를 촉진하는 것이다.null

FGED Society의 구성원들은 다른 조직들과 협력하여 기능성 유전체학 데이터의 효과적인 공유와 재현성을 지원하고, 표준을 활용하는 표준과 소프트웨어 도구의 작성을 촉진하며, 생명과학과 생물 의학 공동체 내에서 주석을 잘 붙인 고품질 데이터의 공유를 촉진한다.null

1999년은"Microarray 유전자 표현 데이터(MGED)사회"로 설립된 이 조직은"기능 유전체학 데이터 협회"2010년에 이 사실은 DNA마이크로 어레이의 유전자 발현 분석을 위한 신청서를 넘어 실험해 염기 서열 결정 법 같은 기술을 포함시키기 위해 초점을 넓혔다를 반영하기 위하여 이름을 바꿨다.[표창 필요한]FGED Society의 범위는 유전자 발현, 결합, 수정 및 기타 관련 응용에 대한 게놈 척도 연구에 적용할 때 기능 유전체학 기술을 사용하여 생성된 데이터를 포함한다.null

역사

FGED Society는 1999년 마이크로어레이 유전자 표현 데이터베이스 회의에서 DNA 마이크로어레이 실험의 데이터 공유 및 저장에 관한 표준을 제정할 필요성을 인정받아 결성되었다.[citation needed]원래 "MGED Society"라고 이름 붙여진 이 사회는 DNA 미세조영과 유전자 표현 데이터에 중점을 두고 시작되었다.null

원래의 MGED 소사이어티는 2002년 '마이크로어레이 유전자 표현 데이터 소사이어티'라는 제목으로 비영리 공익단체로 편입되어 2007년 영구적인 자선 지위를 획득했다.[citation needed]MGED 명칭은 2007년 보다 넓은 범위를 강조하기 위해 Microarray와 Gene Expression Data Society로 법적으로 변경되었다.null

2008년 9월, 소사이어티는 마이크로 어레이 기술과 유전자 발현 응용을 넘어 소사이어티의 범위를 넓히기 위해 단순히 MGED Society로서 자신을 홍보하기로 결정했지만, 여전히 커뮤니티 내에서 MGED 이름의 인정된 가치를 유지한다.[citation needed]null

2010년 7월, 사회는 유전자 발현, 결합, 수정(DNA 메틸레이션 등)의 유전체 척도 연구에 적용된 어떤 기능 유전체 기술을 사용하여 생성된 데이터를 포함하는 마이크로레이와 유전자 발현을 넘어서는 현재의 사명을 반영하기 위해 "기능 유전체학 데이터(FGED) 사회"로 명칭을 바꾸기로 의결했다., 및 기타 관련 응용 프로그램.이는 2010년 7월 14일 학회 'MGED13' 연차총회에서 정식으로 발표되었다.[1]null

FGED 소사이어티 회장단

FGED Society의 이사회와 임원은 매년 5월에 선출되고 6월부터 근무를 시작한다.FGED Society의 회장 및 임기는 다음과 같다.

  • 프랜시스 오울렛(2013-현재)
  • 존 퀘켄부시(2011~2013년)
  • 크리스 스토커트(2007~2011년)
  • 캐서린 볼(2003-2007)
  • 알비스 브라스마 (1999–2003)

멤버십

FGED 이사회 및 자문 위원회는 기능 유전체학 분야에서 생성, 분석, 보관 및 출판의 단면을 대표하는 학계, 산업계, 정부 및 학술지의 자원봉사자로 구성된다.정식 회원은 없지만 매년 열리는 FGED 회의 참석자들은 FGED 커뮤니티의 일원으로 간주된다.null

표준

현재까지 FGED는 DNA 마이크로 어레이 실험과 관련된 다양한 표준 규격을 생산해 왔다.이러한 표준은 생명과학 연구 공동체 내에서 그러한 실험에서 얻은 자료와 소견의 주석, 의사소통 및 공유를 개선하기 위해 고안되었다.null

민세큐

MINSEQE(Minimum Information on high-throughput SEQuencing Experience, MINSEQE)는 결과의 해석과 복제를 목적으로 고투과 시퀀싱 실험을 적절히 문서화하는 데 필요한 필수 정보를 기술하는 데이터 콘텐츠 최소 정보 표준이다.[2]null

미아메

MIAAME(Minimal Information About a Microarray Experiment)는 결과의 해석과 복제를 목적으로 DNA 마이크로 어레이 실험을 적절히 문서화하는 데 필요한 필수 정보를 기술하는 데이터 콘텐츠 표준이다.생명과학 분야의 고투과 실험에 대한 최소 정보 표준의 첫 번째 출판 사례였으며, 이와 같이 다른 생명과학 분야에서도 유사한 표준에 대한 토대를 마련하였다.null

MAGE-OM과 MAGE-TAB

MAGE-OM(MicroArray Gene Expression Object Model)은 XML 파일을 통해 소프트웨어 도구와 데이터베이스로 수출입할 목적으로 마이크로 어레이 실험의 데이터를 인코딩하는 데 사용하기 위한 데이터 교환 및 데이터 모델링 표준이다.MAGE-OM은 XML 기반 MAGE-ML 형식으로 구현된 플랫폼 독립형 모델이다.null

새로운 버전인 MAGE-TAB는 마이크로소프트 엑셀과 같이 널리 이용 가능한 스프레드시트 소프트웨어를 사용하여 보고 편집할 수 있는 형식( 구분)이기 때문에 데이터 생산자들이 이해하고 생성하기 쉽도록 개발되었다.[3]null

MGED 온톨로지

MGED 온톨로지(MO)는 DNA 마이크로어레이 실험의 구성요소를 설명하기 위한 표준 용어를 제공한다.[4]생물학적 연구를 위한 온톨로지(OBI)가 MO를 대체하기 위해 개발되고 있다. 온톨로지 용어 MO에서 OBI로 매핑이 가능하다.[5]null

연차총회

FGED Society의 노력의 주요 구성 요소는 첨단 과학 작품을 선보이고 표준을 홍보하기 위한 FGED 연례 회의였다.[6]null

FGED Society는 1999년부터 세계 각지의 행사장에서 연례 회의를 개최하고 있으며, 회담, 포스터 세션, 워크숍, 튜토리얼 등을 위한 공간을 제공하는 국내 과학 단체와 조율하고 있다.null

FGED Society의 과거 모임

FGED Society의 연례 회의 날짜와 장소 목록 입니다.[7]2010년부터 이전의 모든 회의는 "MGED Society"라는 이름으로 개최되었다.null

날짜 위치
2013년 6월 20일 미국[8], 미국, 시애틀
2012년 1월 25일 미국[9] 보스턴, 매사추세츠 주
2010년 7월 15일 보스턴, 매사추세츠, 미국(ISMB와 연계)
2009년 10월 8일 미국 애리조나 피닉스
2008년 9월 5일 이탈리아 트렌티노 리바가르다
2007년 9월 5일 오스트레일리아 브리즈번
2006년 9월 10일 미국, 미국, 시애틀
2005년 9월 13일 노르웨이의 베르겐
2004년 9월 10일 캐나다 토론토
2003년 9월 5일 프랑스 아이ix-en-Provence
2002년 9월 27일 일본 도쿄 오다이바, 헤이세이 광장
2001년 3월 31일 미국 캘리포니아 주 스탠퍼드 대학교
2000년 5월 27일 독일 하이델베르크의 DKFZEMBL
1999년 11월 15일 영국 케임브리지 EBI

참고 항목

참조

  1. ^ FGED_Society. "Big news: MGED has a new name: FGED – Functional Genomics Data Society". Twitter. Retrieved 10 August 2010.
  2. ^ Functional Genomics Data Society (June 2012). "Minimum Information about a high-throughput SEQuencing Experiment".
  3. ^ "MAGE-TAB Homepage". FGED Website. Retrieved 2012-07-31.
  4. ^ "The MGED Ontology FAQ". MO project website. Retrieved 2008-11-23.
  5. ^ "Mapping terms between MO and Ontology for Biomedical Investigations". MGED Ontology Working Group. Retrieved 10 August 2010.
  6. ^ "List of FGED annual meetings". FGED website. Retrieved 2013-04-02.
  7. ^ "FGED Society Meetings". FGED Society. Retrieved 2 August 2016.
  8. ^ "FGED 15th International Conference: Translational Genomics: Applications of Genomics to Clinical Diagnosis and Treatment, 20–22 June 2013". FGED.org. Retrieved 24 September 2014.
  9. ^ "Data Sharing and Integration Best Practices, 25–26 Jan 2012 (invitation only)". FGED.org. Retrieved 29 October 2014.