ModBase
ModBase | |
|---|---|
| 내용 | |
| 묘사 | 비교단백질구조모델 |
| 연락 | |
| 연구소 | 캘리포니아 대학교 샌프란시스코 |
| 실험실. | 생명공학 및 치료과학부 |
| 작가들 | Ursula Pieper, Eswar Narayanan, Ben Webb, Andrej Sali |
| 주요 인용문 | 파이퍼 & al. (2011년)[1] |
| 발매일 | 1998 |
| 접근 | |
| 웹 사이트 | http://salilab.org/modbase |
| 다운로드 URL | ftp://salilab.org/databases/modbase |
| 웹 서비스 URL | http://salilab.org/modweb |
ModBase는 주석이 달린 비교 단백질 구조 모델의 데이터베이스로, 380만 개 이상의 고유한 단백질 [1]배열에 대한 모델을 포함합니다.모델은 MODELLER 프로그램에 의존하는 비교 모델링 파이프라인 ModPipe에 의해 생성됩니다.
ModBase는 UCSF의 Andrej Sali 연구실에서 개발되었습니다.ModBase 모델은 단백질 모델 포털에서도 액세스할 수 있습니다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ a b Pieper, Ursula; Webb Benjamin M; Barkan David T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberg Hannes; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E; Burley Stephen K; Sali Andrej (Jan 2011). "ModBase, a database of annotated comparative protein structure models, and associated resources". Nucleic Acids Res. England. 39 (Database issue): D465-74. doi:10.1093/nar/gkq1091. PMC 3013688. PMID 21097780.
외부 링크
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