mtDNA 제어 영역
mtDNA control region미토콘드리아 DNA 조절 영역 2차 구조 A | |
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식별자 | |
기호. | mtDNAsA |
르팜 | RF01853 |
기타자료 | |
RNA형 | 안티센스 RNA |
도메인 | 포유류 |
PDB 구조 | PDBe |
mtDNA 제어 영역은 비코딩 DNA인 미토콘드리아 게놈의 영역입니다.이 영역은 RNA와 DNA [1]합성을 조절합니다.인간 mtDNA [2]게놈에서 가장 다형성된 영역이며, 다형성은 초가변 영역에 집중되어 있습니다.이 지역의 평균 뉴클레오티드 다양성은 1.7%[3]입니다.이러한 가변성에도 불구하고, 이 지역의 RNA 전사체는 선택적 [4]압력을 받는 것으로 밝혀진 보존된 2차 구조(사진)를 가지고 있습니다.
mtDNA 제어 영역에는 한 가닥의 복제 원점과 두 [5]가닥의 전사 원점이 포함됩니다.또한 인간의 7s 리보솜 RNA를 암호화하는 것으로 생각되는 개방형 읽기 프레임이 있지만,[6] 삭제된 쥐나 소에서는 그렇지 않습니다.
D-루프와의 구별
제어 영역과 mtDNA D-루프는 때때로 [3]문헌에서 동의어로 사용됩니다. 특히 제어 영역은 인접한 전사 촉진 영역과 함께 D-루프를 포함합니다.이러한 이유로 제어 영역은 D-Loop [7]및 관련 Promoters를 나타내는 약어 DLP로도 알려져 있습니다.
지구력 연구
mtDNA 조절 영역 하플로타입은 인간 [8]피험자의 지구력 능력과 관련이 있습니다.2002년 연구는 55명의 피험자의 대조군 영역을 시퀀싱하고 8주간의 훈련 프로그램 후 그들의 하플로타입을 VOmax의 증가와2 비교했습니다.그들은 서로 다른 하플로타입이 피실험자들의 인내력과 상당히 관련이 있다는 것을 발견했습니다.이것은 조절 영역이 미토콘드리아의 [4][8]복제와 전사에 영향을 미치기 때문이라고 추측되었습니다.
참고 항목
레퍼런스
- ^ 콜드 스프링 하버 연구소 미토콘드리아 게놈 DNA 학습 센터의 구조
- ^ Stoneking M, Hedgecock D, Higuchi RG, Vigilant L, Erlich HA (February 1991). "Population variation of human mtDNA control region sequences detected by enzymatic amplification and sequence-specific oligonucleotide probes". Am. J. Hum. Genet. 48 (2): 370–82. PMC 1683035. PMID 1990843.
- ^ a b Aquadro CF, Greenberg BD (February 1983). "Human Mitochondrial DNA Variation and Evolution: Analysis of Nucleotide Sequences from Seven Individuals". Genetics. 103 (2): 287–312. PMC 1219980. PMID 6299878. Retrieved 2010-07-29.
- ^ a b Pereira F, Soares P, Carneiro J, et al. (December 2008). "Evidence for variable selective pressures at a large secondary structure of the human mitochondrial DNA control region". Mol. Biol. Evol. 25 (12): 2759–70. doi:10.1093/molbev/msn225. PMID 18845547.
- ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, et al. (April 1981). "Sequence and organization of the human mitochondrial genome". Nature. 290 (5806): 457–65. doi:10.1038/290457a0. PMID 7219534.
- ^ Ojala D, Montoya J, Attardi G (April 1981). "tRNA punctuation model of RNA processing in human mitochondria". Nature. 290 (5806): 470–4. doi:10.1038/290470a0. PMID 7219536.
- ^ Michikawa Y, Mazzucchelli F, Bresolin N, Scarlato G, Attardi G (October 1999). "Aging-dependent large accumulation of point mutations in the human mtDNA control region for replication". Science. 286 (5440): 774–9. doi:10.1126/science.286.5440.774. PMID 10531063.
- ^ a b Murakami H, Ota A, Simojo H, Okada M, Ajisaka R, Kuno S (June 2002). "Polymorphisms in control region of mtDNA relates to individual differences in endurance capacity or trainability". Jpn. J. Physiol. 52 (3): 247–56. doi:10.2170/jjphysiol.52.247. PMID 12230801.
진일보한 내용
- Stoneking M (October 2000). "Hypervariable Sites in the mtDNA Control Region Are Mutational Hotspots". Am. J. Hum. Genet. 67 (4): 1029–32. doi:10.1086/303092. PMC 1287875. PMID 10968778.
- Sachidanandam R, Weissman D, Schmidt SC, et al. (February 2001). "A map of human genome sequence variation containing 1.42 million single nucleotide polymorphisms". Nature. 409 (6822): 928–33. doi:10.1038/35057149. PMID 11237013.
외부 링크
- EMPOP - 미토콘드리아 DNA 대조군 데이터베이스
- Rfam의 미토콘드리아 DNA 조절 영역 2차 구조 A 페이지