MvirDB

MvirDB
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내용
묘사독소, 독성 인자 및 항생제 내성 유전자 데이터베이스
데이터형
발동.		독소, 독성인자 및 항생제 내성 유전자
유기체박테리아
연락
주요 인용문PMID 17090593
접근
웹 사이트mvirdb.llnl.gov
여러가지 종류의
북마크 가능
엔티티		네.

분자생물학에서 MvirDB는 독소, 독성 인자 및 항생제 내성 유전자에 [1]대한 정보를 저장하는 공개 데이터베이스입니다.이 데이터베이스가 DNA 및 단백질 정보에 사용하는 소스는 다음과 같습니다.Tox-Prot,[2] [3]SCOPRITION, PRINTS Virulence [4][5]Factors, VFDB,[6] TVFAC, Islander,[7] ARGO[8] 및 VIDA.[9]이 데이터베이스는 사용자가 MvirDB의 모든 DNA 및 단백질 염기서열을 조회할 수 있는 BLAST 도구를 제공합니다.독성 인자에 대한 정보는 제공된 브라우저 도구를 사용하여 얻을 수 있습니다.브라우저 도구를 사용하면 결과는 읽기 쉬운 표로 반환되고 E-Values 오름차순으로 정리되며 각 표는 관련 페이지에 하이퍼링크됩니다.MvirDB는 Oracle 10g 관계형 데이터베이스에 [1]구현됩니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b Zhou, C. E.; Smith, J.; Lam, M.; Zemla, A.; Dyer, M. D.; Slezak, T. (2007-01-03). "MvirDB--a microbial database of protein toxins, virulence factors and antibiotic resistance genes for bio-defence applications". Nucleic Acids Research. 35 (Database): D391–D394. doi:10.1093/nar/gkl791. ISSN 0305-1048. PMC 1669772. PMID 17090593.
  2. ^ Jungo, Florence; Bairoch, Amos (March 2005). "Tox-Prot, the toxin protein annotation program of the Swiss-Prot protein knowledgebase". Toxicon. 45 (3): 293–301. doi:10.1016/j.toxicon.2004.10.018. ISSN 0041-0101. PMID 15683867.
  3. ^ Srinivasan, K.N.; Gopalakrishnakone, P.; Tan, P.T.; Chew, K.C.; Cheng, B.; Kini, R.M.; Koh, J.L.Y.; Seah, S.H.; Brusic, V. (January 2002). "SCORPION, a molecular database of scorpion toxins". Toxicon. 40 (1): 23–31. doi:10.1016/s0041-0101(01)00182-9. ISSN 0041-0101. PMID 11602275.
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  5. ^ Attwood, Teresa K.; Bradley, Paul M.; Gaulton, Anna; Maudling, Neil; Mitchell, Alexander L.; Moulton, Georgina (2005-04-15), "The PRINTS protein fingerprint database: functional and evolutionary applications", Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics and Bioinformatics, John Wiley & Sons, Ltd, doi:10.1002/047001153x.g306301, ISBN 047001153X
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  8. ^ Scaria, Joy; Chandramouli, Umamaheswaran; Verma, Sanjay Kumar (2005-02-01). "Antibiotic Resistance Genes Online (ARGO): A Database on vancomycin and b-lactam resistance genes". Bioinformation. 1 (1): 5–7. doi:10.6026/97320630001005. ISSN 0973-8894. PMC 1891619. PMID 17597841.
  9. ^ Yeats, C.; Lees, J.; Reid, A.; Kellam, P.; Martin, N.; Liu, X.; Orengo, C. (2007-12-23). "Gene3D: comprehensive structural and functional annotation of genomes". Nucleic Acids Research. 36 (Database): D414–D418. doi:10.1093/nar/gkm1019. ISSN 0305-1048. PMC 2238970. PMID 18032434.