핵자기공명 스펙트럼 데이터베이스

Nuclear magnetic resonance spectra database

핵자기공명 스펙트럼 데이터베이스는 핵자기공명(NMR) 스펙트럼에 관한 정보의 전자 저장소이다.이러한 리포지토리는 자체 포함 데이터 세트로 다운로드하거나 온라인에서 사용할 수 있습니다.데이터가 저장되는 형식은 그래픽으로 표시할 수 있는 라인 리스트부터 원시 자유 유도 붕괴(FID) 데이터까지 다양합니다.데이터는 일반적으로 스펙트럼 데이터와 관련된 분자 구조를 연관시키는 방식으로 주석을 달았다.

data 형식

회선 리스트

대부분의 NMR이 문헌 논문에 기술되어 있는 형태.데이터베이스는 처리된 스펙트럼이 나타나는 방식과 유사한 방식으로 라인 리스트를 그래픽으로 표시하는 것이 일반적이다.그러나 이러한 선 목록은 1차 이상의 고차 분할, 탄소나 백금과 같은 저농축 동위원소 위성뿐만 아니라 선폭 및 선 모양의 기타 유익한 측면에 대한 정보가 부족하다.회선 리스트의 장점은 최소한의 메모리만 필요로 한다는 것입니다.

처리된 이미지

FID가 스펙트럼으로 처리되면 FID보다 메모리를 적게 사용하는 이미지로 변환할 수 있습니다.이 방법에서는, 회선 리스트보다 많은 메모리가 필요하지만, 유저에게 대량의 정보를 제공합니다.처리된 이미지는 원시 FID에 대한 정보는 적지만 메모리도 적게 들고 브라우저에 쉽게 표시되며 특별한 데이터 처리 소프트웨어가 필요하지 않습니다.

원시 FID 파일

실험을 수행할 때 얻은 원시 자유 유도 붕괴 데이터는 계측기 제조업체의 형식 설정에 따라 저장됩니다.이 데이터 형식에는 가장 많은 정보가 포함되어 있으며 스토리지 공간이 가장 많이 필요합니다.FID 데이터가 다운로드되면 다양한 상용 및 소프트웨어 프로그램을 통해 사용자는 FID 데이터를 유용한 스펙트럼으로 처리할 수 있다.

일반적인 검색 방법

일반적으로 다음과 같은 데이터베이스 검색 방법을 사용할 수 있습니다.

  • 복합명 - 공식 IUPAC 이름 및 일반 이름을 포함할 수 있습니다.
  • 분자식 - 정확한 공식 또는 범위 중 하나입니다.
  • 분자 구조 - 이 방법에는 분자 편집기 인터페이스가 필요합니다.
  • Registration Number : 보통 CAS 레지스트리 번호이지만 대부분의 데이터베이스에는 독자적인 번호부여 방식도 있습니다.
  • 피크 범위 또는 기타 스펙트럼 특성: 사용자가 미지의 화합물의 스펙트럼과 관련된 데이터를 수치로 입력합니다. 이 데이터는 지정된 제약 조건 내에서 이동을 공유하는 화합물에 사용됩니다. 이를 통해 사용자는 유사한 기능 그룹을 가진 정확한 화합물 또는 분자를 찾을 수 있습니다.
  • 스펙트럼 검색 - 제출된 스펙트럼과 유사한 스펙트럼을 데이터베이스에서 검색하기 위해 소프트웨어를 사용한다.

데이터베이스 목록

다음은 핵자기공명 스펙트럼 데이터베이스의 일부 목록이다.

ACD/랩

Advanced Chemistry Development(ACD/labs)[1]는 NMR 데이터 처리 및 NMR 스펙트럼 예측에 사용되는 소프트웨어를 생산하는 화학정보학 회사이다.ACD/Labs는 Aldrich 라이브러리를 일반 스펙트럼 처리 소프트웨어 및 특수 NMR 소프트웨어 제품의 추가 기능으로 제공합니다.NMR 예측 변수를 사용하면 사용자 훈련 데이터베이스에 데이터를 추가하여 NMR 스펙트럼의 예측을 개선할 수 있다.예측 알고리즘을 훈련하는 데 사용되는 콘텐츠 데이터베이스(HNMR DB, CNMR DB, FNMR DB, NNMR DB 및 PNMR DB)에는 계측기와 문헌에 대한 참조도 포함되어 있습니다.이러한 데이터베이스는 개별 또는 그룹 계약을 통해 라이브러리로 구입하거나 임대할 수 있습니다.

Aldrich NMR 라이브러리

이 데이터베이스의 일부는 Aldrich의 3권 인쇄 버전으로 여전히 제공됩니다.완전한 전자 버전은 논문 버전에 포함되지 않은 스펙트럼의 보완을 포함한다.전체적으로 이 데이터베이스는 관련된 300MHz H 및 75MHz C 스펙트럼을 가진 15,000개 이상의 화합물을 포함한다.제품에는 NMR 데이터를 보고 처리하는 데 필요한 소프트웨어가 포함되어 있습니다.이 데이터베이스는 개별 또는 그룹 계약을 통해 라이브러리로 구입할 수 있습니다.스펙트럼 데이터는 처리된 FID 데이터의 영상으로 저장되는 것으로 보입니다.

생체 자기 공명 데이터 뱅크

생체 자기 공명 데이터 뱅크(BioMagResBank 또는 BMRB)는 위스콘신 매디슨 대학 생화학부의 후원을 받고 있으며 단백질, 펩타이드, 핵산 및 기타 생체 분자에 전념하고 있습니다.여기에는 다양한 원시 NMR 데이터가 저장됩니다.

Wiley KnowItAll NMR 스펙트럼 라이브러리

와일리는 새들러 표준 스펙트럼을 포함한 스펙트럼 데이터의 포괄적인 수집을 제공한다.이들의 NMR 스펙트럼 데이터 수집에는 CNMR, HNMR 및 XNMR([2]F-19 NMR, P-31 NMR, N-15 NMR 등) 스펙트럼이 포함된다.

ChemGate

퍼블리셔 John Wiley & Sons에 의해 개발 및 유지보수된 데이터베이스.이 데이터베이스에는 700,000개 이상의 NMR, IR 및 MS 스펙트럼이 포함되었으며, NMR 스펙트럼에 특정한 통계는 나열되지 않았다.NMR 데이터는 H,13 C, B, N, O, F, Si 및 P를 포함한다.데이터는 그래픽으로 표시된 라인 리스트의 형태였습니다.데이터베이스에 대한 액세스는 개별 또는 그룹 계약을 통해 단편적으로 구입하거나 전체 라이브러리로 임대할 수 있습니다.이러한 데이터는 이제 Wiley Online Library를 통해 제공됩니다.

켐스파이더

ChemSpider 화학 데이터베이스는 사용자가 제출한 원시 NMR 데이터를 받아들입니다.JSpecView 애플릿을 사용하여 온라인으로 볼 수 있는 JCAMP-DX 형식으로 받아들여진 데이터 또는 다른 소프트웨어 패키지로 처리할 수 있는 데이터를 다운로드 할 수 있습니다.

NMRSiftDB

NMRDSshiftDB에는 그래프에 표시되는 라인 리스트 데이터가 있습니다.그 데이터는 쾰른 대학에서 주최한다.온라인 접속은 무료이며 사용자의 참여를 권장합니다.데이터는 GNU FDL 라이선스로 이용할 수 있습니다.2021년 3월 4일 현재 C, H, N, B, F, Si 및 P NMR의 측정된 스펙트럼이 포함되어 있다.

인터넷상의 Spec Info

Wiley Online[3] Library(John Wiley & Sons)를 통해 이용 가능한 인터넷 NMR의 SpecInfo는 약 440,000개의 NMR 스펙트럼(C, H, F, P 및 Si NMR 데이터베이스로 구성됨) 모음입니다.데이터는 Java 인터페이스를 사용하여 인터넷을 통해 액세스되며 BASF와 공동으로 개발한 서버에 저장됩니다.이 소프트웨어에는 PDF 보고서 생성, 스펙트럼 예측(데이터베이스 훈련 및/또는 알고리즘 기반), 구조 도면, 구조 검색, 스펙트럼 검색, 텍스트 필드 검색 등이 포함됩니다.데이터베이스에 대한 액세스는 가입자에게 NMR로만 제공되거나 질량분석 및 FT-IR 데이터와 조합되어 제공됩니다.이러한 데이터의 대부분은 아래에 설명된 ChemGate를 통해 이용할 수 있었다.적용범위는 Compound Search에서 자유롭게 확인할 수 있습니다.STN International을 통해 이러한 데이터의 더 적은 컬렉션을 이용할 수 있습니다.

유기 화합물 스펙트럼 데이터베이스

유기화합물 스펙트럼 데이터베이스(SDBS)는 일본 산업기술종합연구소에 의해 개발 및 관리되고 있다.SDBS에는 FT-IR, 라만, ESR 및 MS 데이터뿐만 아니라 14700H NMR 스펙트럼과 13000C NMR 스펙트럼이 포함된다.데이터는 처리된 데이터의 영상으로 저장 및 표시됩니다.주석은 분자선 도면에 라벨을 붙이는 데에도 사용되는 문자와 관련된 화학적 이동 목록을 통해 달성됩니다.비상업적인 용도로는 무료로 데이터베이스에 액세스할 수 있습니다.사용자는 하루에 50개 이상의 스펙트럼 및/또는 복합 정보를 다운로드하지 않아야 한다.1997년부터 2008년 2월까지 데이터베이스 접속 횟수는 2억 회 이상입니다.T. 사이토, K.하야미즈, M. 야나기사와, O.야마모토는 NMR 데이터에 대한 재현성으로 간주됩니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ "ACD/Labs.com :: NMR Spectroscopy Software". www.acdlabs.com. Retrieved 2016-06-11.
  2. ^ "Wiley's NMR Spectral Libraries".
  3. ^ Chemical Concepts (16 September 2004). Specinfo on the Internet - Nmr. John Wiley & Sons Canada, Limited. ISBN 978-0-471-22169-2.

외부 링크

Curlie에서의 핵자기공명