오픈 소스 약물 검색

Open Source Drug Discovery

오픈 소스 약물 발견(Open Source Drug Discovery)은 인도 과학 및 산업 연구 협회(CSIR)가 주도하는 팀 인도 컨소시엄으로 글로벌 참여가 가능하다.[1][2][3][4][5] 연구 기반 제약 기업의 제한된 관심을 끌고 있는 Leishmaniasis와 같은 방치된 열대성 질병에 대한 공동의약품 발견 플랫폼을 제공한다.[1][5][6][7][8] 이 프로그램은 연구자, 학계, 학생, 산업계, 교육기관 등으로 구성된 130개국에서 7500명 이상의 참여자가 참여하는 글로벌 커뮤니티를 갖추고 있다.[7][9] 오픈소스 모드에서 방치된 질병의 약물 발견에 전념하는 사람이라면 누구나 참여할 수 있다.[10] OSDD는 다양한 배경을 가진 전문가들이 모여 열대성 감염에 적합한 약물을 발견하고 개발하는 데 집중함으로써 기능한다.

역사

CSIR-OSDD는 2008년 9월에 출시되었다.[9][11] 이 프로젝트는 사미르 K교수에 의해 구상되었다. CSIR의 11차 5개년 계획 프로젝트로서 CSIR-Genomics and Integative Biology의 설립자인 브라흐마차리.[12] 이것은 Rs 45.96 크로아(약 1200만 달러)의 총 지출로 인도 정부에 의해 승인되었다.[13] 프로젝트 모토는 "모두를 위한 적절한 의료"이며 오픈 소스 철학, 크라우드 소싱 개념 및 협업 연구 모델을 활용하여 혁신을 촉진하고 새로운 치료법을 발견하기 위한 웹 기반 도구를 활용한다.[14][13][15] 커뮤니티에서 생성되는 모든 데이터와 자원은 이러한 목적을[5][16][17] 위해 특별히 설계된 웹 기반 포털인 Sysborg 2.0을 통해 공개적으로 공유된다.

이 프로젝트에는 특허화 정책과 오픈소스 연구 정책이 한데 어우러진 헬스케어 모델이 있는데, 이는 새로운 의약품을 지적재산권 제한 없이 [18]일반 의약품으로 사용할 수 있게 해 저렴성과 접근성을 확보하는 것을 목표로 한다.[1][5][19]

첫 번째 작용은 결핵균(TB) 치료제 개발이었다.[20] 이 프로젝트에는 두 가지 단계가 있다.

  1. 1단계(2008~2012년)는 신약의 발견과 개발을 수반한다.
  2. 임상시험을 수반하는 2단계(2012~2017년)

과정

OSDD는 참여기관이 쉽게 웹사이트의 내용에 기여하거나 수정할 수 있도록 웹사이트의 위키 모델을 기반으로 하는 웹 포털의 설치부터 시작했다. 업로드된 정보는 동료 검토가 가능하다. 개발 중인 신약이 공공영역에 포함될 것이다. 일반 의약품은 제약회사들이 차지해 합리적인 가격으로 상용화된다.[21]

운영 방법론

약물 발견의 과정은 10가지 작업 패키지, 즉[21] 10가지로 나뉜다.

  1. WP1 - 약물 표적 식별. 이것은 잠재적인 약물 목표의 식별을 위한 시스템 생물학 연구를 포함한 컴퓨터 활동을 촉진한다. 오픈소스에 대한 성향이 강한 학계, 기관, 산업계의 참여를 개방한다.
  2. WP2 - 대상의 표현. 여기에는 잠재적인 약물 표적에 대한 실험 결과를 공유하고 검사 결과를 개발하는 것이 포함된다.
  3. WP3 - 화면 개발. 여기에는 대형 화학 복합 라이브러리를 선별하기 위해 서로 다른 표적에 대해 개발된 특정 검사를 사용하는 것이 포함된다.
  4. WP4 - 실리카 도킹 중. 여기에는 아날로그 합성을 위한 히트 컴파운드 내 잠재적 현장의 목표 결정 및 식별이 포함되며, 따라서 최대 효력 및 최소 독성이 달성된다.
  5. WP5 - 최고의 억제제를 가진 인간 세포와 조직에 대한 마이크로 배열 유전자 발현. 여기에는 호스트 셀의 표현 프로파일을 변경하지 않고 대상에 대한 결합 친화력이 높은 화합물의 식별이 포함된다.
  6. WP6 - 약용 화학. 이것은 개선된 화합물의 합성을 포함한다.
  7. WP7 - 리드 최적화. 숙주를 방해하지 않으면서 바람직한 효과로 납 화합물을 생산하는 것이다.
  8. WP8 - 인간 세포 단백질 결합을 확인하기 위한 단백질학 기반 납 친화 칼럼
  9. WP9 - 납 화합물의 임상 전 독성
  10. WP10 - 새로운 분자 실체의 임상 개발

1-8단계는 1단계, WP9과 10단계는 2단계에 있다.

조직

OSDD는 공동 프로젝트로서 CSIR. Professor의 한 단위다.사미르 K. 브라흐마차리 전 CSIR 국장은 오픈소스 마약 발굴 프로젝트의 '최고 멘토'이다. 인도국립과학아카데미 원장 M.비자얀, 인도 의학연구회(ICMR) 이사장인 V.M.카토흐, ICMR 전 국장 N.K.강글리가 멘토다. 개별 사업은 참여기관이 맡고 주임 조사관이 관리한다.[21] 이 프로젝트들은 CSIR의 Sarala Balachandran OSDD 프로젝트 책임자에 의해 중앙에서 감독된다.

자금조달

OSDD의 핵심 자금은 인도 정부로부터 나온다. 2008년 9월부터 2012년 3월까지 인도 정부는 이 프로젝트에 Rs 45.96 크로아티아(약 1200만 달러)를 할당했다.[22] 이 기금은 과학 프로젝트의 자금 지원, 기반 시설 설치, 프로젝트의 지속적인 활동 지원에 사용된다.[23] 2012년까지 OSDD는 CSIR의 '국가 연구소 제도'에 따른 프로젝트였다. 2013~2017년 제12차 5개년 계획에 대해, 기획 위원회는 CSIR의 개방형 혁신 계획의 일환으로 OSDD의 존속을 승인했다.

업적

OSDD는 세계 각지에서 등록된 7,500명의 참가자가 참가한다. 현재 110여개의 연구과제가 진행되고 있다. 이번 협력 작업에서 60개 이상의 잠재적인 M. 결핵 표적들이 확인되었다. 조사 대상자는 7명이다. 컨소시엄의 첫 국제공표는 2009년 M. 결핵 통합유전체 지도에 게재됐다.[24] 그 이후로 12개 이상의 연구가 발표되었다.[25] OSDD는 현재 OSDD 화학 홍보 프로그램(OSDDChem)을 운영하고 있다. 이 시스템 하에서 학생들은 합성화학 교육을 받고 OSDDChem 센터에 있는 대학, 연구소, 대학에서 합성된 화합물들은 OSDDChem 데이터베이스에 제출되어 CSIR-CDRI로 보내진다. 그런 다음 이러한 분자들은 항 TB 및 말라리아 활동을 위해 CSIR-CDRI에서 선별 검사를 위해 채택된다.[26] [27]

참조

  1. ^ a b c Bhardwaj, Anshu; Scaria, Vinod; Raghava, Gajendra Pal Singh; Lynn, Andrew Michael; Chandra, Nagasuma; Banerjee, Sulagna; Raghunandanan, Muthukurussi V.; Pandey, Vikas; Taneja, Bhupesh; Yadav, Jyoti; Dash, Debasis; Bhattacharya, Jaijit; Misra, Amit; Kumar, Anil; Ramachandran, Srinivasan; Thomas, Zakir; Brahmachari, Samir K.; Brahmachari, S. K. (2011). "Open source drug discovery– A new paradigm of collaborative research in tuberculosis drug development". Tuberculosis. 91 (5): 479–486. doi:10.1016/j.tube.2011.06.004. PMID 21782516.
  2. ^ Årdal, Christine; Røttingen, John-Arne (2012-09-20). "PLOS Neglected Tropical Diseases: Open Source Drug Discovery in Practice: A Case Study". PLOS Neglected Tropical Diseases. Plosntds.org. 6 (9): e1827. doi:10.1371/journal.pntd.0001827. PMC 3447952. PMID 23029588.
  3. ^ Pallava Bagla (2012-02-24). "Crowd-Sourcing Drug Discovery". Science. Sciencemag.org. 335 (6071): 909. doi:10.1126/science.335.6071.909. PMID 22362985.
  4. ^ Deepa Kurup (2010-12-17). "Embrace open source philosophy, Kalam tells scientists, researchers". The Hindu. Thehindu.com. Retrieved 2015-04-30.
  5. ^ a b c d "OPEN SOURCE DRUG DISCOVERY: A GLOBAL COLLABORATIVE DRUG DISCOVERY MODEL FOR TUBERCULOSIS" (PDF). Scienceandculture-isna.org\accessdate=2015-04-30.
  6. ^ Dhruba Jyoti Purkait. "Where are the drugs for tropical diseases? Business Line". Thehindubusinessline.com. Retrieved 2015-04-30.
  7. ^ a b "Virtual collaboration by researchers could reduce cost of developing life-saving drugs - Business Today". Businesstoday.intoday.in. 2013-01-06. Retrieved 2015-04-30.
  8. ^ "Open Source Drug Discovery (OSDD)". Openhealthnews.com. Retrieved 2015-04-30.
  9. ^ a b "Govt to rope in young minds to invent cheaper drugs - timesofindia-economictimes". Articles.economictimes.indiatimes.com. 2007-12-20. Retrieved 2015-04-30.
  10. ^ "Join the movement - Open Source Drug Discovery". Osdd.net. Retrieved 2015-04-30.
  11. ^ Seema Singh (April 2008). "India Takes an Open Source Approach to Drug Discovery". Cell. 133 (2): 201–203. doi:10.1016/j.cell.2008.04.003. PMID 18423188.
  12. ^ "Samir Brahmachari - Fierce's Top 10 Biotech Techies". FierceBiotechit.com. 2012-03-23. Retrieved 2015-04-30.
  13. ^ a b "About Us - Open Source Drug Discovery". Osdd.net. Retrieved 2015-04-30.
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  15. ^ Sachin S Rawat (2013-03-05). "Open Source Drug Discovery Dreamer Biologist". Dreamerbiologist.wordpress.com. Retrieved 2015-04-30.
  16. ^ "OSDD – Single Sign-On Service". Sysborg2.osdd.net. Retrieved 2015-04-30.
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  18. ^ "Pvt pharma firms knock CSIR to develop TB drug". The Times of India. 2011-04-15. Archived from the original on 2014-01-07. Retrieved 2015-04-30.
  19. ^ "Open Source Drug Discovery (OSDD)". Zunia.org. 2012-03-02. Retrieved 2015-04-30.
  20. ^ Press Information Bureau (15 September 2008). "CSIR launches Open Source Drug Discovery: A Path-Breaking Research Of The People, By The People, For The People". dst.gov.in. Department of Science and Technology, India. Retrieved 7 January 2014.
  21. ^ a b c Project Director, Open Source Drug Discovery. ""OPEN SOURCE DRUG DISCOVERY" AN OPEN COLLABORATIVE DRUG DISCOVERY MODEL FOR TUBERCULOSIS" (PDF). www.who.int. World Health Organization, Geneva. Retrieved 7 January 2014.
  22. ^ "Centre commits Rs.150 cr funding to CSIR's Open Source Drug Discovery project CSIR in the news". Csirindia.wordpress.com. 2011-05-27. Retrieved 2015-04-30.
  23. ^ "Forbes India Magazine - How Open Source Drug Discovery Is Helping India Develop New Drugs". Forbesindia.com. Retrieved 2015-04-30.
  24. ^ Bhardwaj, A; Bhartiya, D; Kumar, N; Open Source Drug Discovery Consortium; Scaria, V (2009). "TBrowse: An integrative genomics map of Mycobacterium tuberculosis". Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). 89 (5): 386–7. doi:10.1016/j.tube.2009.07.005. PMID 19683474.
  25. ^ NCBI. "Open Source Drug Discovery Consortium [Corporate Author]". www.ncbi.nlm.nih.gov. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Retrieved 7 January 2014.
  26. ^ Himanshi Dhawan (18 September 2013). "CSIR pushes for TB, malaria drug finds". The Times of India. Bennett, Coleman & Co. Ltd. Archived from the original on 20 September 2013. Retrieved 7 January 2014.
  27. ^ "Open Pharma Project". open-pharma.org. Retrieved 2021-06-25.

외부 링크

참고 항목