오스트레오코커스타우리

Ostreococcus tauri
오스트레오코커스타우리
O. 타우리 전지의 투과 전자 현미경 사진
과학적 분류 edit
(순위 미지정): 비리디플랜테아과
중분류: 엽록소과
클래스: 마미엘로피케아목
주문: 마미엘랄레스
패밀리: 배시콕과
속: 오스트레오코쿠스속
종류:
오타우리
이항명
오스트레오코커스타우리
C. Courties & M. J. Chrétiennot-Dinet (1995)

Ostreoccus tauri는 직경 약 0.8마이크로미터(μm)의 해양 녹조의 단세포 종으로, 지금까지 기술된 진핵 생물 중 가장 작은 자유 생물이다.매우 단순한 초미세 구조와 콤팩트한 게놈을 가지고 있습니다.

전 세계 해양 피코플랑크톤 집단의 공통적인 구성원으로서, 이 유기체는 많은 지역에서 탄소 순환에 중요한 역할을 한다.최근 O. tauri는 게놈이 콤팩트하고 녹색 혈통으로 연구자들의 관심을 끌기 때문에 비교 유전체학 및 기능 [1][2][3][4]유전체학을 이용한 연구의 대상이 되고 있다.

역사

Ostreoccus tauri는 1994년 프랑스 Tau lagoon에서 플로우 세포측정법을 사용하여 석호의 피코플랑크톤 개체군을 1년 동안 연구한 결과 발견되었다.O. tauri는 석호에서 피코플랑크톤 인구의 주요 성분으로 밝혀졌으며, 투과 전자 현미경으로 생성된 세포들의 이미지들은 가장 작으면서도 묘사된 진핵 [5]세포들을 밝혀냈다.O. tauri는 특징적인 엽록소 색소와 엽록소 관련 카로티노이드의 [5][6][7]존재에 기초하여 즉시 Prasinophyceae 분류에 포함되었습니다.그러나 마미엘레스목과 함께 마미엘로피체아목(Mamiellophyceae)으로 분류되었다(Marin and Melkonian, 2010).[8][9][10]

해부학

세포는 대략 구형(구형)이며, 평균 길이 약 1μm, 폭 0.7μm이다.세포의 초미세 구조는 매우 단순하며 세포벽이 없고 핵, 단일 미토콘드리아, 단일 엽록체, 단일 [5]골지 기기로 구성되어 있다.세포에는 편모도 없다.

처음에는 14개의 [7]염색체를 포함하는 것으로 묘사되었지만, 지금은 핵이 약 33 fg의 [5]DNA에 20개의[citation needed] 염색체를 포함하는 것으로 알려져 있다.

생태학

Ostreoccus tauri는 프랑스 남부 Thau Lagoon에 사는 지배적인 해조류 종입니다.이러한 우세로 이어진다고 생각되는 조건은 첫째, 석호가 집중적인 연체동물 재배에 사용되고 둘째, 석호의 구리 농도가 높다는 것이다.첫 번째 고려사항은 작은 세포(피코플랑크톤)를 선택한다; 더 큰 진핵 조류 종과 더 작은 조류의 많은 포식자들은 필터 공급자인 연체동물에 의해 우선적으로 소비된다.두 번째 고려사항은 O. tauri가 "부작용 조건"에 더 잘 대처하는 것으로 생각되기 때문에 시아노박테리아에 반대하는 것을 선택한다.석호의 과잉 구리는 주변 빈야드에 [11]의해 사용되는 농약에서 유래한 것으로 생각된다.

모델 유기체로 사용

1998년 초, O. tauri는 "세포 분열 [7]및/또는 게놈 배열 연구와 같은 생물학적 모델에 적합한 후보"로 확인되었다.

유전체학

2006년,[1] O.tauri 게놈은 Derelle 등에 의해 배열되었다.20개 염색체로 구성된 12.56Mb 게놈은 유전자 밀도가 매우 높고 인트론을 함유하는 유전자는 거의 없었다.외곽 특성(G+C 함량, 인트론 구조)을 가진 2개의 염색체, 즉 2번 염색체와 19번 염색체가 확인되었다.마미엘라목의 다른 종의 염기서열 분석 결과, 다른 종(O. 루시마리나누스,[2] Micromonas pusilla 및 B. prasinos[13])에서 유사한 외부 염색체의 발생이 나타났다.

레퍼런스

  1. ^ a b Derelle, E., Ferraz, C., Rombauts, S., Rouzé, P., Worden, A. Z., Robens, S.... Moreau, H. (2006)가장 작은 자유생명체 Ostreoccus tauri의 게놈 분석은 많은 독특한 특징들을 드러낸다.미국 국립과학원 회의, 103(31), 11647-52.http://doi.org/10.1073/pnas.0604795103
  2. ^ a b Palenik, B., 그림우드, J., Aerts, A., Rouzé, P., Salamov, A., Putnam, N.... 그리고리예프, I. V. (2007)작은 진핵생물 오스트레오코쿠스는 플랑크톤 분화의 역설에 대한 게놈 통찰력을 제공한다.미국 국립과학아카데미, 104(18), 7705-10.http://doi.org/10.1073/pnas.0611046104
  3. ^ 블랑-마티외, R., Verhelst, B., Derelle, E., Rombauts, S., Bouget, F.-Y., Caré, I. … Piganeau, G. (2014).일루미나 데 노보 조립체를 평가함으로써 해양성 조류인 Ostreoccus tauri 모델의 개량된 게놈이 전개된다.BMC Genomics, 15(1), 1103.http://doi.org/10.1186/1471-2164-15-1103
  4. ^ Krumholz, E. W., Yang, H., Weisenhorn, P., Henry, C. S. 및 Libourel, I. G. L. (2012)피코알가 오스트레오코쿠스의 게놈 전체 대사망 재구성.실험식물학 저널, 63(6), 2353~2362.http://doi.org/10.1093/jxb/err407
  5. ^ a b c d C. et al.(1994)가장 작은 진핵 생물이죠네이처 370: 255
  6. ^ C. et al.(1995년)새로운 해양 피코우카리오테 - Ostreoccus tauri Genet Sp-NOV (Clorophyta, Prasinophyceae).Phycologia 34 (4) : 285-292
  7. ^ a b c C. et al.(1998년)"Ostreoccus tauri(Chlorophyta, Prasinophyceae)의 계통학적 분석과 게놈 크기" J. Phycol. 34(5): 844-849.
  8. ^ NCI: Mamiellales Moestrup, 1984 (주문)
  9. ^ 마미엘로피시 B.Marin & Melkonian, 2010 (클래스)
  10. ^ WoRMS: 마미엘로피케이즈
  11. ^ Vaquer, A. et al. (1996년)타우 라군(지중해 북서부 해안)에 있는 피코피토플랑크톤의 정석 및 역동성.림놀로지 및 해양학 41 (8) : 1821-1828
  12. ^ Worden, A. Z., Lee, J.-H, Mock, T., Rouzé, P., Simmons, M. P., A. L., … 그리고리예프, I. V. (2009)해양 피코에카리오테스의 게놈에 의해 밝혀진 녹색 진화와 동적 적응.과학, 324(5924), 268~272.http://doi.org/10.1126/science.1167222
  13. ^ Moreau, H., Verhelst, B., Couloux, A., Derelle, E., Rombauts, S., 그림슬리, N.... Vandepoelle, K. (2012년)Bathycoccus Prasino의 유전자 기능과 게놈 구조는 녹색 계통의 기저에 있는 세포 분화를 반영한다.게놈 생물학, 13(8) R74.http://doi.org/10.1186/gb-2012-13-8-r74