PDLIM3

PDLIM3
PDLIM3
Protein PDLIM3 PDB 1v5l.png
식별자
에일리어스PDLIM3, ALP, PDZ과 림 도메인 3.
외부 IDOMIM:605889 HomoloGene:8710 GeneCards:PDLIM3.
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

27295

없음

앙상블

ENSG00000154553

없음

유니프로트

Q53GG5

없음

RefSeq(mRNA)

NM_001114107
NM_001257962
NM_001257963
NM_014476

없음

RefSeq(단백질)

NP_001107579
NP_001244891
NP_001244892
NP_055291

없음

장소(UCSC)Chr 4: 185.5~185.54 Mb없음
PubMed 검색[2]없음
위키데이터
인간 보기/편집

PDZ 및 LIM 도메인 단백질 3이라고도 하는 Actin-associated LIM 단백질(ALP)은 인간에서 PDLIM3 [3][4][5]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.ALP는 심근과 골격근에서 많이 발현되며, Z-디스크와 중간 디스크로 국소화된다.ALP는 α-actin-2에 의한 액틴의 가교성을 높이는 기능을 하며 우심실 형성 및 수축 기능에 필수적인 것으로 보인다.

구조.

ALP는 주로 골격근의 39.2kDa(364개의 아미노산) 단백질과 심장근과 [6][7][8]평활근의 34.3kDa(316개의 아미노산) 단백질의 두 가지 대체 결합 변종으로 존재한다.ALP는 N 말단 PDZ 도메인과 C 말단 LIM 도메인을 가진다.또한 단백질 키나제 C 컨센서스 [9]배열을 포함한 ALP상 모티브라고 하는 특정 34개의 아미노산 도메인을 포함한다.ALP의 PDZ 도메인은 알파 액티닌-2, 특히 스펙트린 유사 [10]반복에 결합한다.PDZ 도메인은 보존된 4개의 잔류 GLGF 서열을 가진 80-120개의 아미노산으로 구성된 모티브로, 전형적으로 세포골격 [11]단백질의 C-termini와 상호작용한다.두 아이소폼의 이종성 영역은 PDZ 도메인과 LIM [8]도메인 사이에 있습니다.ALP는 염색체 [10]4q35에 국소화되어 있다.마우스에서 근육맹과 같은 1이 결실되면 PDLIM3의 스플라이싱 패턴을 변경할 수 있는 것으로 나타났다.[12]

기능.

연구에 따르면 ALP는 알파 악티닌-2와 결합하는 근섬유 생성의 첫 번째 단계에서 존재하며, 이 연관성은 ALP가 Z-디스크와 중간 디스크에 국재화된 성숙한 근섬유에서 그대로 남아 있다.단, ALP에서 [13]Z라인을 대상으로 하는 경우에는 알파 액티닌-2가 필요하지 않습니다.ALP 녹아웃 마우스에 대한 연구는 ALP가 α 악티닌-2에 의한 액틴 필라멘트의 가교 연결을 촉진하고, ALP의 부재는 비정상적인 우심실실 형성, 이형성 및 [14]심근증을 유발한다는 것을 보여주었다.이들 동물에서 우심실심외수축기주 및 기하학적 리모델링 분석을 이용한 추가 연구는 ALP의 부재가 우심실 수축 기능을 저하시키고 심장 비대성 [15]리모델링 패턴을 변화시킨다는 것을 밝혔다.콜라겐[16] 증착 또는 내인성 유산소 실행 능력(ARC)[17]의 유전자 수식자를 조사하기 위해 통합 게놈 접근법을 사용한 두 연구는 PDLIM3를 각각의 정량적 특성 위치에 매핑하여 ALP가 이러한 심장 현상과 관련된 분자 네트워크에 관여할 수 있음을 시사한다.

임상적 의의

10명의 환자에게서 4번 염색체 주심실 반전이 관찰되었으며, 관련 심장 기형은 PDLIM3에 [18]영향을 미칠 수 있는 말기 4q35.1 결손과 관련이 있다.

상호 작용

ALP의 상호 작용:

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000154553 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ Bouju S, Piétu G, Le Cunff M, Cros N, Malzac P, Pellissier JF, Pons F, Léger JJ, Auffray C, Dechesne CA (Jan 1999). "Exclusion of muscle specific actinin-associated LIM protein (ALP) gene from 4q35 facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) candidate genes". Neuromuscular Disorders. 9 (1): 3–10. doi:10.1016/S0960-8966(98)00087-X. PMID 10063829. S2CID 24449614.
  4. ^ Piétu G, Alibert O, Guichard V, Lamy B, Bois F, Leroy E, Mariage-Sampson R, Houlgatte R, Soularue P, Auffray C (Jun 1996). "Novel gene transcripts preferentially expressed in human muscles revealed by quantitative hybridization of a high density cDNA array". Genome Research. 6 (6): 492–503. doi:10.1101/gr.6.6.492. PMID 8828038.
  5. ^ "Entrez Gene: PDLIM3 PDZ and LIM domain 3".
  6. ^ "Protein sequence for human PDZ and LIM domain protein 3 (Uniprot: Q53GG5-2)". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Retrieved 22 June 2015.
  7. ^ "Protein sequence for human PDZ and LIM domain protein 3 (Uniprot: Q53GG5)". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Retrieved 22 June 2015.
  8. ^ a b Pomiès P, Macalma T, Beckerle MC (Oct 1999). "Purification and characterization of an alpha-actinin-binding PDZ-LIM protein that is up-regulated during muscle differentiation". The Journal of Biological Chemistry. 274 (41): 29242–50. doi:10.1074/jbc.274.41.29242. PMID 10506181.
  9. ^ Te Velthuis AJ, Isogai T, Gerrits L, Bagowski CP (7 February 2007). "Insights into the molecular evolution of the PDZ/LIM family and identification of a novel conserved protein motif". PLOS ONE. 2 (2): e189. doi:10.1371/journal.pone.0000189. PMC 1781342. PMID 17285143.
  10. ^ a b c Xia H, Winokur ST, Kuo WL, Altherr MR, Bredt DS (Oct 1997). "Actinin-associated LIM protein: identification of a domain interaction between PDZ and spectrin-like repeat motifs". The Journal of Cell Biology. 139 (2): 507–15. doi:10.1083/jcb.139.2.507. PMC 2139795. PMID 9334352.
  11. ^ Ponting CP, Phillips C (Mar 1995). "DHR domains in syntrophins, neuronal NO synthases and other intracellular proteins". Trends in Biochemical Sciences. 20 (3): 102–3. doi:10.1016/s0968-0004(00)88973-2. PMID 7535955.
  12. ^ Dixon DM, Choi J, El-Ghazali A, Park SY, Roos KP, Jordan MC, Fishbein MC, Comai L, Reddy S (12 March 2015). "Loss of muscleblind-like 1 results in cardiac pathology and persistence of embryonic splice isoforms". Scientific Reports. 5: 9042. doi:10.1038/srep09042. PMC 4356957. PMID 25761764.
  13. ^ Henderson JR, Pomiès P, Auffray C, Beckerle MC (Mar 2003). "ALP and MLP distribution during myofibrillogenesis in cultured cardiomyocytes". Cell Motility and the Cytoskeleton. 54 (3): 254–65. doi:10.1002/cm.10102. PMID 12589684.
  14. ^ a b Pashmforoush M, Pomiès P, Peterson KL, Kubalak S, Ross J, Hefti A, Aebi U, Beckerle MC, Chien KR (May 2001). "Adult mice deficient in actinin-associated LIM-domain protein reveal a developmental pathway for right ventricular cardiomyopathy". Nature Medicine. 7 (5): 591–7. doi:10.1038/87920. PMID 11329061. S2CID 1781328.
  15. ^ Lorenzen-Schmidt I, McCulloch AD, Omens JH (Jul 2005). "Deficiency of actinin-associated LIM protein alters regional right ventricular function and hypertrophic remodeling". Annals of Biomedical Engineering. 33 (7): 888–96. doi:10.1007/s10439-005-3604-y. PMC 4482468. PMID 16060528.
  16. ^ Lodder EM, Scicluna BP, Beekman L, Arends D, Moerland PD, Tanck MW, Adriaens ME, Bezzina CR (Dec 2014). "Integrative genomic approach identifies multiple genes involved in cardiac collagen deposition". Circulation: Cardiovascular Genetics. 7 (6): 790–8. doi:10.1161/CIRCGENETICS.114.000537. PMID 25217174.
  17. ^ Lee SJ, Ways JA, Barbato JC, Essig D, Pettee K, DeRaedt SJ, Yang S, Weaver DA, Koch LG, Cicila GT (Sep 2005). "Gene expression profiling of the left ventricles in a rat model of intrinsic aerobic running capacity". Physiological Genomics. 23 (1): 62–71. doi:10.1152/physiolgenomics.00251.2004. PMID 16033863.
  18. ^ Maurin ML, Labrune P, Brisset S, Le Lorc'h M, Pineau D, Castel C, Romana S, Tachdjian G (Feb 2009). "Molecular cytogenetic characterization of a 4p15.1-pter duplication and a 4q35.1-qter deletion in a recombinant of chromosome 4 pericentric inversion". American Journal of Medical Genetics Part A. 149A (2): 226–31. doi:10.1002/ajmg.a.32603. PMID 19161154. S2CID 205310317.

추가 정보

*

  • Arola AM, Sanchez X, Murphy RT, Hasle E, Li H, Elliott PM, McKenna WJ, Towbin JA, Bowles NE (Apr 2007). "Mutations in PDLIM3 and MYOZ1 encoding myocyte Z line proteins are infrequently found in idiopathic dilated cardiomyopathy". Molecular Genetics and Metabolism. 90 (4): 435–40. doi:10.1016/j.ymgme.2006.12.008. PMID 17254821.