레드톨
RedToL
레드톨(RedToL) 또는 레드 알갈(Red Algal Tree of Life)은 생물과학부 환경생물학부(Division of Environmental Biology for Biological Sciences)를 통해 자금을 지원받은 국립과학재단(AToL)의 일부다.AToL의 전반적인 목표는 생명 역사를 통틀어 대규모 유기체 그룹에 대한 진화적 관계를 해결하는 것인데, 이 연구는 종종 큰 팀이 기관과 학문을 넘나들며 작업하는 것을 포함한다.일반적으로 조사자는 데이터 획득, 분석, 알고리즘 개발 및 컴퓨터 유전체학 및 식물정보학 분야의 프로젝트에서 지원된다.
생명의 붉은 녹갈나무 재구성을 위한 유전학 및 유전학적 접근법은 12억년 전 방기알 화석 증거가 있는 가장 오래된 진핵 식물 중 하나인 로도피타(붉은 해조류)에 초점을 맞추고 있다.적조류는 해양과 민물 수생 환경의 주요 구성원이며 덜스나 초밥 랩과 같은 중요한 인간 식품의 공급원이며, 제약 및 산업 용도가 다양하다(예: Agarose, carragargarose, carragenan).아마도 가장 중요한 것은 공생에서 적조류가 하는 역할이다.붉은 알가는 페미안이 끝난 후 해양 생태계에서 두각을 나타내게 된 엽록소 c 함유 조류(헤테로콘타 또는 스트라메노플라일)에 플라스티드를 기증한 고대 (>10억년 전)로 현재 전지구 고정 탄소의 20%를 공급하고 있다.
목표
RedToL의 목적은 1) 2개의 핵, 4개의 플라스티드, 2개의 미토콘드리아 인코딩 유전자 표식기로 이루어진 결합된 데이터세트를 사용하여 471종의 적조류의 강력한 유전체를 재구성하고, 2) 플라스티드 게놈을 시퀀싱하고 적조류의 계통생성(예: 등급 및 순서 수준) 범위를 나타내는 16개의 핵심 세제에 대한 성적표 데이터베이스 생성, 3이다.)은 GenBank 및 프로젝트별 웹 사이트에 릴리즈를 통해 자유롭게 사용할 수 있는 적조 다진 및 게놈 데이터를 만든다.홍보 및 학생 멘토링 프로그램은 RedToL 이니셔티브의 중요한 구성 요소다.
294개 제네라에서 471개 종은 ca의 다양성을 나타낸다. 6,000개의 붉은 해조류 종(즉, 모든 현존하는 질서를 나타내는 모든 붉은 해조류 생성종의 35%가 포함될 것이다.)본 연구에서 도출된 강력한 계통발생학적 프레임워크는 홍조류의 종합적인 분류법 개정에 대한 기초가 되며, 적조 진화 중 핵심 혁신을 해석할 수 있는 기초를 제공한다.선택된 마커 유전자는 서로 다른 생명의 나무 조립(AToL) 프로젝트에서 공유되기 때문에, 미래 종합 진핵 나무의 공통된 틀을 제공할 것이다.16개 주요 적색조류세자의 완전한 플라스티드 게놈과 성적증명서 데이터는 적색조 진화의 이해를 용이하게 하는 게놈 인벤토리를 제공할 뿐만 아니라, 풍부한 세트의 수직 유전자를 이용한 혈전 분석의 기초를 제공할 것이다.게놈 데이터는 특히 홍조류의 주요 계급과 질서 사이의 관계를 시험할 것이다.RedToL 팀원은 외국인 협력자 2명과 자문위원 15명을 포함한 8개 기관에서 왔으며, 적조 생물학에 대한 이해를 높이기 위해 다양한 방법(분류학에서 혈류학까지)을 사용하는 다양한 세대의 가장 뛰어난 국내외 적조 전문가들을 대표한다.
