타임트리
TimeTree | |
| 안정적 해제 | v4.0 |
|---|---|
| 유형 | 생물정보학 |
| 면허증 | 프리웨어 |
| 웹사이트 | www |
타임트리(TimeTree)는 S. Blair Hedges와 현재 템플 대학교에 재학 중인 수디르 쿠마르가 생명의 나무에서 발산하는 시기를 제시하기 위해 개발한 무료 공공 데이터베이스다.[1][2] 기본 개념은 현재 3,998명에 달하는 출판된 연구에서 삶의 시간표에 대한 커뮤니티의 합의를 도출하고 제시하며, 웹이나 모바일 기기에서 그 정보에 쉽게 접근할 수 있도록 하는 것이었다.[2] 데이터베이스는 두 종 이상의 종 사이의 평균 노드 시간을 검색하고 더 높은 종에 대한 수명 시간표를 작성하는 것을 허용한다. 타임트리(TimeTree)는 고등학교 설정과 같이 삶의 진화를 개념화하기 위해 공교육에 이용되어 왔다.[5] TimeTree의 초기 개발은 NASA AstroBiology Institute의 초기 지원을 받아 1990년대 후반으로 거슬러 올라간다. 그 이후 NASA와 NSF, NIH로부터 추가 보조금을 지원받았다.
특징들
타임트리 사용자들은 고양이와 개와 같은 두 종의 이름을 검색하여 수백만 년 안에 이들의 다양성에 대한 평균과 중간 시간 추정치를 얻을 수 있다. 또한 각 연구에서 얻은 모든 개별 시간 추정치를 지질학적 시간 척도 옆에 표시하여 지질학적 기간을 나타낸다. 별도로 표에는 각 스터디에서 스프레드시트로 다운로드할 수 있는 시간 추정치와 함께 원본 기사의 개요 및 링크가 나열되어 있다. 데이터베이스는 또한 작성자 이름별로 시간표 기사를 검색할 수 있다. 현장에는 《삶의[3] 시간표》 전집도 소개되어 있다.
참조
- ^ Hedges SB, Dudley J, Kumar S (2006). "TimeTree: A public knowledge-base of divergence times among organisms". Bioinformatics. 22 (23): 2971–2. doi:10.1093/bioinformatics/btl505. PMID 17021158.
- ^ a b Kumar S, Hedges, SB (2011). "TimeTree2: species divergence times on the iPhone". Bioinformatics. 27 (14): 2023–4. doi:10.1093/bioinformatics/btr315. PMC 3129528. PMID 21622662.
{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크) - ^ a b Hedges SB, Kumar S (2009). The TimeTree of Life. New York: Oxford University Press. ISBN 978-0199535033.
- ^ a b Hedges SB, Marin J, Suleski M, Paymer M & Kumar S (2015). "Tree of Life Reveals Clock-Like Speciation and Diversification". Mol. Biol. Evol. 32 (4): 835–845. arXiv:1412.4312. doi:10.1093/molbev/msv037. PMC 4379413. PMID 25739733.
{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크) - ^ Metzger KJ (2011). "Helping Students Conceptualize Species Divergence Events using the Online Tool "TimeTree: The Timescale of Life"". The American Biology Teacher. 73 (2): 106–108. doi:10.1525/abt.2011.73.2.9. S2CID 85026876.
