Transcriptional 소음

Transcriptional noise

유전자 발현의 가변성(소음)동질 유전자형의 개체 수의 세포 사이에 발생하는Transcriptional 소음은 1차적 원인 전사 소음의 제기된 소스 .[1](휴대 소음을 보)은 전사 bursting[2][3][4]지만 이질성의 세포 내용물의 유사 분열에 불평등한 분리 같은 다른 공급원 알 있다.너무 t가능성이0은 상당히 기여한다.[5]전사 Bursting, 전사의 단순한 확률적 모델과는 반대로, 세포 간의 고르지 않은 단백질 식을 생성하는 유전자 활동의 주들이 불규칙적으로로 분리된 사이에 변동과 여러가지 상태를 반영한다.유전자 발현에 소음 세포 거동에, 또는 통합 완화되어야 한다 엄청난 결과를 가져온다.바이러스성 지연 시간이 설립, 미생물은 빠르게 스트레스를 받는 환경 바꾸는 생존 혹은 흩어진 차별화의 여러 종류 같은 특정 상황의 가변성 필수적인.[6][7]Variability 또한 임상 치료의 효용성에 박테리아나 이스트 균의 항생제랑 명백히non-genetic 차이에 의해 야기되는 저항력에 영향을 미친다.[8][9]유전자 발현에 Variability 또한 암 세포의 chemotherapy[10]에 sub-populations의 resistance과 에이즈 단체에 치료에 대한 장벽으로 보인다 기여할 수 있다.[11]

메모들

  1. ^ Raj, A; Van Oudenaarden, A (2008). "Nature, nurture, or chance: stochastic gene expression and its consequences". Cell. 135 (2): 216–26. doi:10.1016/j.cell.2008.09.050. PMC 3118044. PMID 18957198.
  2. ^ Golding, I; Paulsson, J; Zawilski, SM; Cox, EC (2005). "Real-time kinetics of gene activity in individual bacteria". Cell. 123 (6): 1025–36. doi:10.1016/j.cell.2005.09.031. PMID 16360033.
  3. ^ Chubb, JR; Trcek, T; Shenoy, SM; Singer, RH (2006). "Transcriptional pulsing of a developmental gene". Current Biology. 16 (10): 1018–25. doi:10.1016/j.cub.2006.03.092. PMC 4764056. PMID 16713960.
  4. ^ Raj, A; Peskin, CS; Tranchina, D; Vargas, DY; Tyagi, S (2006). "Stochastic mRNA synthesis in mammalian cells". PLOS Biology. 4 (10): e309. doi:10.1371/journal.pbio.0040309. PMC 1563489. PMID 17048983.
  5. ^ Huh, D.; Paulsson, J. (2010). "Non-genetic heterogeneity from stochastic partitioning at cell division". Nature Genetics. 43 (2): 95–100. doi:10.1038/ng.729. PMC 3208402. PMID 21186354.
  6. ^ Weinberger, L. S.; Burnett, J. C.; Toettcher, J. E.; Arkin, A. P.; Schaffer, D. V. (2005). "Stochastic gene expression in a lentiviral positive-feedback loop: HIV-1 Tat fluctuations drive phenotypic diversity". Cell. 122 (2): 169–82. arXiv:q-bio/0608002. doi:10.1016/j.cell.2005.06.006. PMID 16051143. S2CID 8061716.
  7. ^ Losick, R.; Desplan, C. (2008). "Stochasticity and cell fate". Science. 320 (5872): 65–68. Bibcode:2008Sci...320...65L. doi:10.1126/science.1147888. PMC 2605794. PMID 18388284.
  8. ^ Lewis, K. (2010). "Persister Cells". Annual Review of Microbiology. 64: 357–372. doi:10.1146/annurev.micro.112408.134306. PMID 20528688.
  9. ^ Blake, William J; Balázsi, Gábor; Kohanski, Michael A; Isaacs, Farren J; Murphy, Kevin F; Kuang, Yina; Cantor, Charles R; Walt, David R; Collins, James J (2006). "Phenotypic Consequences of Promoter-Mediated Transcriptional Noise". Molecular Cell. 24 (6): 853–865. doi:10.1016/j.molcel.2006.11.003. PMID 17189188.
  10. ^ Sharma, S. V.; Lee, D. Y.; Li, B.; Quinlan, M. P.; Takahashi, F.; Maheswaran, S.; McDermott, U.; Azizian, N.; Zou, L.; Fischbach, M. A.; Wong, K. K.; Brandstetter, K.; Wittner, B.; Ramaswamy, S.; Classon, M.; Settleman, J. (2010). "A chromatin-mediated reversible drug tolerant state in cancer cell subpopulations". Cell. 141 (1): 69–80. doi:10.1016/j.cell.2010.02.027. PMC 2851638. PMID 20371346.
  11. ^ Weinberger, A. D.; Weinberger, L. S. (2013). "Stochastic fate selection in HIV-infected patients". Cell. 155 (3): 497–9. doi:10.1016/j.cell.2013.09.039. PMID 24243007.