트랜스크립트옴의 불안정성

Transcriptome instability

트랜스스크립텀 불안정성은 특정 암의 게놈 전체, mRNA 전 스플라이싱 관련 특성이다.일반적으로 mRNA 전 스플라이싱은 높은 [1][2][3]비율의 암세포에서 조절이 잘 안 된다.대장암과 전립선암과 같은 특정 유형의 암의 경우, 암당 스플라이싱 오류의 수는 개별 암마다 크게 달라지는데, 이는 전사체 불안정이라고 [4][5]한다.전사체 불안정성은 스플라이싱 인자 유전자의 발현 수준 감소와 유의한 상관관계를 가진다.DNMT3A의 돌연변이는 혈액학적 악성종양의 발생에 기여하며, DNMT3A 변이 세포주는 이성질 야생형에 [6]비해 트랜스스크립텀 불안정성을 보인다.

레퍼런스

  1. ^ Skotheim, R I; Nees, M (2007). "Alternative splicing in cancer: noise, functional, or systematic?". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 39 (7–8): 1432–49. doi:10.1016/j.biocel.2007.02.016. PMID 17416541.
  2. ^ Bauer, Joseph Alan; He, Chunjiang; Zhou, Fang; Zuo, Zhixiang; Cheng, Hanhua; Zhou, Rongjia (2009). Bauer, Joseph Alan (ed.). "A Global View of Cancer-Specific Transcript Variants by Subtractive Transcriptome-Wide Analysis". PLOS ONE. 4 (3): e4732. Bibcode:2009PLoSO...4.4732H. doi:10.1371/journal.pone.0004732. PMC 2648985. PMID 19266097.
  3. ^ Sveen, A; Kilpinen, S; Ruusulehto, A; Lothe, RA; Skotheim, RI (2015). "Aberrant RNA splicing in cancer; expression changes and driver mutations of splicing factor genes". Oncogene. 35 (19): 2413–2427. doi:10.1038/onc.2015.318. PMID 26300000.
  4. ^ Sveen, A; Ågesen, TH; Nesbakken, A; Rognum, TO; Lothe, RA; Skotheim, RI (2011). "Transcriptome instability in colorectal cancer identified by exon microarray analyses: Associations with splicing factor expression levels and patient survival". Genome Medicine. 15: 672. doi:10.1186/1471-2164-15-672. PMC 3219073. PMID 25109687.
  5. ^ Sveen, A; Johannessen, B; Teixeira, MR; Lothe, RA; Skotheim, RI (2014). "Transcriptome instability as a molecular pan-cancer characteristic of carcinomas". BMC Genomics. 3 (5): 32. doi:10.1186/gm248. PMC 4137096. PMID 21619627.
  6. ^ Banaszak, LG; Giudice, V; Zhao, X; Wu, Z; Gao, S; Hosokawa, K; Keyvanfar, K; Townsley, DM; Gutierrez-Rodrigues, F; Ibanez, MdPF; Kajigaya, S; Young, NS (2018). "Abnormal RNA splicing and genomic instability after induction of DNMT3A mutations by CRISPR/Cas9 gene editing". Blood Cells, Molecules and Diseases. 69: 10–22. doi:10.1016/j.bcmd.2017.12.002. PMC 6728079. PMID 29324392.