트리베이스

TreeBASE

트리베이스[1](TreeBASE)는 과학 저널에 게재된 계통생성 데이터의 보고다.계통학 연구에서는 세자의 집합에 대해 이루어지는 비교 관측(예: 문자 상태 행렬 또는 다중 시퀀스 정렬)과 같은 연구 데이터를 수집하거나 생성하며, 이러한 세자에 대한 메타데이터, 그리고 세자 사이의 진화 관계를 가장 잘 설명하기 위해 유추되는 계통학 나무 등이 있다.

미션

TreeBASE 프로젝트의 목적은 이러한 데이터에 대한 안정적인 기록과 식별자를 제공하는 것으로, 다른 작업자가 자신의 출판물에 축적된 데이터를 참조할 수 있도록 하고, 다른 과학자가 데이터를 찾아내어 원본 연구를 검증하거나 추가 분석에 포함하거나 확장하는 데 사용할 수 있도록 하는 것이다.

역사 및 자금조달성

이 프로젝트는 1994년 미국 국립과학재단의 자금 지원을 받아 시작되었다.[2][3]이 프로토타입 이후, CIPRES[4] 프로젝트에 따라 재설계가 시작되었다.이 새로운 버전은 2010년 3월에 출시되었으며,[5] 그 중에서도 CQL 검색 시설과의 RESTful 웹 서비스 인터페이스를 추가하는 [6]pPOD 프로젝트와 데이터베이스와 웹 서버를 호스트하는 NESCent(National Evolutional Composition Center)의 지원을 받아왔다.

2010년 겨울부터 TreeBASE가 재정비되어 식물정보학 연구재단과[7] 연계되었다.

참조

  1. ^ "TreeBASE". Retrieved 5 April 2011.
  2. ^ Sanderson, M. J.; M. J. Donoghue; W. Piel; T. Eriksson (1994). "TreeBASE: a prototype database of phylogenetic analyses and an interactive tool for browsing the phylogeny of life". American Journal of Botany. 81 (6): 183. doi:10.2307/2445447. JSTOR 2445447.
  3. ^ Piel, W. H.; M. J. Donoghue; M. J. Sanderson (2002). "TreeBASE: a database of phylogenetic knowledge". To the Interoperable "Catalog of Life" with Partners Species 2000 Asia Oceanea. Research Report from the National Institute for Environmental Studies (171): 41–47.
  4. ^ "CyberInfrastructure for Phylogenetic Research". Retrieved 5 April 2011.
  5. ^ "processing PhylOData". Retrieved 5 April 2011.
  6. ^ Vos, Rutger A.; Hilmar Lapp; William H. Piel; Val Tannen (2010). "TreeBASE2: Rise of the Machines". Nature Precedings. doi:10.1038/npre.2010.4600.
  7. ^ "Phyloinformatics Research Foundation". Retrieved 5 April 2011.


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