ATUM

ATUM
ATUM
유형사적인
산업생명공학
설립.2003
설립자스리다르 고빈다라잔, 클라스 구스타프손, 제레미 민슐, 존 네스
본사
뉴어크 (캘리포니아 주)
,
미국
상품들유전자 합성, 단백질 엔지니어링, 단백질 생산, 생물정보학, 세포주 개발, 도약형 트랜스포지

ATUM은 최적화된 DNA의 설계 및 합성부터 단백질 생산 및 GMP 세포주 개발까지 생명과학에 필요한 도구를 제공하는 미국 생명공학 회사입니다.

그 회사.

ATUM(구 DNA2.0)은 2003년 캘리포니아 멘로 파크에서 설립되었습니다.이 회사는 비공개로[1] 운영되고 있으며 현재 50,000평방피트의 뉴어크 [2]시설에 있는 캘리포니아의 모든 연구, 개발 및 생산을 계속하고 있습니다.이 회사는 학계, 정부 및 제약, 화학, 농업 및 생명공학 산업에 유전자 합성 및 단백질 엔지니어링 제공업체로 시작되어 현재에 이르고 있습니다.유전자 합성은 "생명공학 시대의 기초"가 생물학적 [3]연구를 위한 주문형 유전자를 가능하게 하면서 많은 학술 및 기업 연구실에서 분자 복제를 빠르게 대체했다.

DNA2.0은 노바사이언스나우라는[4] 프로그램에서 유전자가 어떻게 실험실에서 합성적으로 만들어지는지를 보여주기 위해 소개되었다.2008년, 이 회사는 합성 박테리아 [5]게놈을 만드는데 사용되는 DNA의 일부를 공급했다.

댄 래더 리포트는 합성[6] 생물학에 대한 그들의 에피소드에 DNA2.0과 그것이 "세상이 [6]직면한 가장 중요한 문제들 중 몇 가지"를 어떻게 해결하고 있는지를 포함시켰다.

2009년 The Scientist는 DNA2.0에 의해 개발된 코돈 설계[7] 알고리즘(현재는 GeneGPS 상표)을 생명과학의 [8]10대 혁신 중 하나로 선정했습니다.ATUM은 IIS형 제한 효소인 SapI와 T4 DNA 연결효소를 이용한 범용 [9]복제 시스템인 Electra Vector System을 개발했다.ATUM은 합성 형광 단백질과 같은 일부 분자 성분을 DNA 부품의 공개 접근 컬렉션에서 사용할 수 있도록 만들었습니다(BioBricks Foundation).[10]Atum은 유전자 합성 [11][12]산업의 생물 보안을 촉진하기 위한 국제 유전자 합성 컨소시엄(IGSC)의 창립 멤버입니다.DNA2.0 제품 및/또는 서비스를 사용한 1,200개[13] 이상의 과학 기사가 발표되었으며, 이[14] 중 44개에는 저자로 회사 직원이 포함되어 있습니다.

조사 도구

  • Gene Designer는 무료 바이오 인포매틱스 소프트웨어 [15][16]패키지입니다.이것은 분자생물학자들이 유전자 [18]서열을 설계,[17] 복제 및 검증하는 데 사용됩니다.
  • CRISPR의 스코어링 알고리즘을 갖춘 무료 gRNA 설계 도구입니다.
  • DNA ATLAS는 모든 DNA 벡터 시퀀스에서 프로모터, 마커, 제한 부위 및 개방형 판독 프레임과 같은 특징을 보여주는 무료 플라스미드 매핑 도구입니다.
  • 온라인 생물정보학 툴박스는 유전공학 [19]뉴스가 선정한 베스트 오브 더 웹에 선정되었다.

파트너십

  • 펜실베니아 대학의 Perelman 의과대학은 주로 ATUM에 의해 개발된 GeneGPS 기술을 사용하여 생체 내 [20][21]단백질 발현을 최적화함으로써 HIV-1 백신 개발에 대한 Gene Therapy Program의 연구를 지원할 것이다.
  • 세인트루이스의 감염 및 면역 연구 센터. George's, University of London 및 Atum은 식물성 의약품 [22]개발을 위해 협력했습니다.
  • Adimab LLC.와 ATUM은 항체 라이브러리의 설계 및 구축을 통한 항체 발견 및 생물 제조 분야에서 제휴를 맺고 있습니다.
  • Cytorvance Biologics는 성공적인 바이오 제조를 위한 미생물 균주 개발을 위한 키스톤 발현 시스템의 일부로 ATUM의 GeneGPS를 활용합니다.
  • Archer Daniels Midland Company는 ATUM의 독점 단백질 엔지니어링 기술인 ProtineGPS를 ADM의 산업 효소 엔지니어링 [23]프로세스에 적용합니다.
  • ATUM은 중고등학생과 교사를 위한 합성생물학 관련 체험활동 및 유익한 애니메이션 자원인 BioBuilder의 스폰서입니다.MIT의 Nataly Kuldell 박사가 설립했습니다.

레퍼런스

  1. ^ Duan, Mary (October 18, 2009). "Gene synthesis: It's no strain for DNA 2.0". Silicon Valley Business Journal. San Jose, CA.
  2. ^ "DNA2.0 Builds State of the Art Bioproduction Facility in Newark, California". MercuryNews.com. The San Jose Mercury News. Retrieved 22 March 2016.
  3. ^ Pollack (September 12, 2007). "How Do You Like Your Genes? Biofabs Take Orders". The New York Times. New York.
  4. ^ "Artificial Life". Nova ScienceNow. October 18, 2005. PBS.
  5. ^ Pollack (January 24, 2008). "Scientists Take New Step Toward Man-Made Life". The New York Times. New York.
  6. ^ a b "Cutting Edge". Dan Rather Reports. April 30, 2013. AXS TV.
  7. ^ Welch; Govindarajan; Ness; Villalobos; Gurney; Minshull; Gustafsson (September 14, 2009). "Design parameters to control synthetic gene expression in Escherichia coli". PLOS ONE. 4 (9): e7002. doi:10.1371/journal.pone.0007002. PMC 2736378. PMID 19759823.
  8. ^ "2009 Top 10 Innovations". The Scientist. 23 (12): 41–52. December 1, 2009.
  9. ^ Whitman; Gore; Ness; Theodorou; Minshull (June 2013), "Rapid, Scarless Cloning of Gene Fragments Using SapI, T4 DNA Ligase and the DNA2.0 Electra Vector System" (PDF), NEB Expressions, II: 8
  10. ^ Ledford, Heidi (July 4, 2013). "Bioengineers Look Beyond Patents". Nature. Macmillan Publishers Limited. 499 (7456): 16–17. doi:10.1038/499016a. PMID 23823774.
  11. ^ Hayden, Erika Check (November 18, 2009). "Gene-makers form security coalition". Nature. doi:10.1038/news.2009.1095.
  12. ^ "Gene-Synthesis Firms Set Up Biosecurity Protocol", Genetic Engineering & Biotechnology News, November 18, 2009
  13. ^ "Literature Database Search All". April 29, 2016.
  14. ^ "Literature Database Search Author Affiliation:DNA2.0". April 29, 2016.
  15. ^ Villalobos, Alan; Ness, Jon E; Gustafsson, Claes; Minshull, Jeremy; Govindarajan, Sridhar (2006). "Gene Designer: A synthetic biology tool for constructing artificial DNA segments". BMC Bioinformatics. 7: 285. doi:10.1186/1471-2105-7-285. PMC 1523223. PMID 16756672.
  16. ^ Villalobos, Alan; Welch, Mark; Minshull, Jeremy (2012). In Silico Design of Functional DNA Constructs. Gene Synthesis. Methods in Molecular Biology. Vol. 852. pp. 197–213. doi:10.1007/978-1-61779-564-0_15. ISBN 978-1-61779-563-3. PMID 22328435.
  17. ^ Welch, M; Villalobos, A; Gustafsson, C; Minshull, J (2011). "Designing genes for successful protein expression". Methods in Enzymology. 498: 43–66. doi:10.1016/B978-0-12-385120-8.00003-6. ISBN 9780123851208. PMID 21601673.
  18. ^ Dance, Amber (July 1, 2012). "Mover Over, Mother Nature". The Scientist.
  19. ^ "Best of the Web". Genetic Engineering News. April 15, 2007.
  20. ^ "Optimizing Gene Expression with DNA2.0 Technology". GEN. November 14, 2012.
  21. ^ McEnery, Regina (February 4, 2013), "Delivering the DNA", VAX: The Bulletin on AIDS Vaccine Research, 11 (1), archived from the original on November 29, 2014, retrieved November 19, 2014
  22. ^ Cohen, Bryan (December 24, 2013). "DNA2.0 Announces Biopharmaceutical Partnership with St. George's". Vaccine News.
  23. ^ "ADM and DNA2.0 Enter Into Protein Engineering Technology Access and Service Agreement". San Jose Mercury News. San Jose, CA. November 17, 2014.