COMPLETAT (생물정보학 도구)
COMPLEAT (Bioinformatics tool)단백질 복합 농축 분석 도구는 단백질 복합 농축 [1]분석을 사용하여 높은 처리량의 데이터 세트(또는 소규모 데이터 세트)를 분석하는 데 사용되는 온라인 생물 정보학 도구입니다.이 도구는 기존의 유전자 온톨로지 또는 경로 기반 주석 대신 단백질 복합 리소스를 백엔드 주석 데이터로 사용합니다.이 도구는 네트워크 기반 시각화 및 대화형 쿼리 옵션을 포함한 포괄적인 데이터 마이닝 환경을 제공하기 위해 몇 가지 유용한 기능을 통합합니다.
COMPLEAT는 RNAi 화면, 단백질 데이터 세트, 유전자 발현 데이터 및 단백질 복합 정보가 관련된 기타 높은 처리량 데이터 세트를 분석하는 데 사용될 수 있습니다.
적용들
다음을 식별하기 위해 COMPLET이 성공적으로 적용되었습니다.
- 인슐린에 [1]대한 세포 반응에서 브라흐마 복합체의 역할을 포함하는 인슐린 및 표피 성장 인자 신호에 의해 조절되는 동적 단백질 복합체.
- 복잡한 구성 요소가 RNA [2]간섭의 표적이 되었을 때 핵자 크기를 조절하는 진화적으로 보존된 분자 복합체.
- Hippo Signaling [3]Pathway에서 엔도사이토시스와 소포 수송 복합체의 새로운 역할.
레퍼런스
- ^ a b Vinayagam, A; Hu, Y; Kulkarni, M; Roesel, C; Sopko, R; Mohr, SE; Perrimon, N (Feb 26, 2013). "Protein complex-based analysis framework for high-throughput data sets". Science Signaling. 6 (264): rs5. doi:10.1126/scisignal.2003629. PMC 3756668. PMID 23443684.
- ^ Neumüller, R.A; Gross, T; Samsonova, A; Vinayagam, A; Buckner, M; Founk, K; Hu, Y; Sharifpoor, S; Rosebrock, AP; Andrews, B; Winston, F; Perrimon, N (Aug 20, 2013). "Conserved Regulators of Nucleolar Size Revealed by Global Phenotypic Analyses". Science Signaling. 6 (289): ra70. doi:10.1126/scisignal.2004145. PMC 3964804. PMID 23962978.
- ^ Kwon, Y; Vinayagam, A; Sun, X; Dephoure, N; Gygi,S.P; Hong, P; Perrimon, N (2013). "The Hippo Signaling Pathway Interactome". Science. 342 (6159): 737–40. doi:10.1126/science.1243971. PMC 3951131. PMID 24114784.
