칸토(유전자 큐레이션 도구)
Canto (gene curation tool)| 내용 | |
|---|---|
| 묘사 | Canto는 유전자 고유 데이터를 위한 웹 기반 커뮤니티 큐레이션 도구입니다. |
| 데이터형 발동. | 여러가지 |
| 유기체 | 여러가지 |
| 연락 | |
| 연구소 | 케임브리지 대학교 유니버시티 칼리지 런던 |
| 주요 인용문 | PMID 24574118 |
| 접근 | |
| 웹 사이트 | curation |
| 여러가지 종류의 | |
| 북마크 가능 엔티티 | 네. |
Canto는 전문 바이오쿨레이터와 출판 [1]저자의 유전자 특이적 과학 데이터 큐레이션을 지원하는 웹 기반 도구입니다.Canto는 PomBase 프로젝트의 일환으로 개발되었으며 Wellcome Trust에서 자금을 조달하고 있습니다.
Canto는 전문가(바이오쿨레이터 및 출판 저자)가 연구 출판물에서 상세하고 표준화된 공유 가능한 주석을 제공할 수 있도록 하며, 원래 핵분열 효모 커뮤니티를 위해 만들어졌다.Canto는 다른 유기체 및 다른 데이터베이스와 함께 사용할 수 있도록 쉽게 구성할 수 있는 범용 도구이며, 이제 PHI 기반(Rothamsted 연구)과 FlyBase(캠브리지 대학)에서의 표현형 및 유전자 상호작용 큐레이션 및 새로운 모델 종인 Shochosac에 대한 모든 유전자 특정 데이터형을 지원한다.JaponicusDB의 charomyces japonicus.
온톨로지 용어를 사용한 큐레이션
Canto는 유전자 생성물의 속성을 설명하기 위해 바이오온톨로지(Gene Ontology, 단백질 Ontology, 핵분열 효모 표현형 Ontology FYPO 및 Sequence Ontology 포함)의 사용을 지원합니다.복잡한 온톨로지 구조는 직관적인 검색, 찾아보기 및 드릴다운 워크플로에 의해 숨겨집니다.Canto 워크플로우는 필요한 한정자 및 메타데이터(예: 증거(증거), 주석 확장 및 실험 조건)에 대한 프롬프트로 큐레이션 프로세스를 안내합니다.프롬프트는 다양한 데이터 유형 및 개별 도메인 및 범위에 맞게 조정됩니다.
커뮤니티 큐레이션
Canto는 커뮤니티 큐레이션을 지원하는 데 성공했으며, PomBase의 새로운 큐레이션의 대부분은 핵분열 효모인 Shychoscaromyces Pombe를 모델 유기체로 사용하는 연구자 커뮤니티에 의해 제공됩니다.PomBase 팀은 출판 저자 및 전문 큐레이터에 의한 공동 큐레이션이 과학적 [3]연구의 가치와 영향을 극대화하기 위해 고품질 큐레이션을 제공한다는 것을 증명합니다.
레퍼런스
- ^ [1] 러더포드, K.M., 해리스, M.A., 록, A., 올리버, S.G. 및 우드, V. (2014년)Canto: 커뮤니티 문학 큐레이션을 위한 온라인 도구.생물정보학, 30(12), 1791~1792.doi:10.1093/btu103
- ^ [2] Lock, A., Rutherford, K., Harris, M. A., & Wood, V. (2018)폼베이스:핵분열 효모를 위한 과학적 자원.분자생물학에서의 방법(클리프턴, 뉴저지), 1757, 49–68. doi:10.1007/978-1-4939-7737-6_4
- ^ [3] Lock, A., Harris, M. A., Rutherford, K. M., Hayles J & Wood, V. (20)PomBase 커뮤니티 큐레이션: 핵분열 효모 전문가가 연구 간행물 데이터베이스(Oxford)에서 상세하고 표준화된 공유 가능한 주석을 제공할 수 있습니다.2020년; 2020년: baaa028. doi: 10.1093/104/baaa028
