세팔로디스크과 미토콘드리아 코드
Cephalodiscidae mitochondrial code세팔로디스크대 미토콘드리아 코드(번역표 33)는 세팔로디스크대(Pterobranchia)의 미토콘드리아 게놈에서 사용하는 유전자 코드다.프테로브란치아는 헤미코르다타에 있는 두 집단 중 하나로, 에치노데르마타, 코다타와 함께 중수체질의 주요 집단을 이루고 있다.
코드 33은 또한 헤미코르다타에 속하는 프테로브란치아의 미토콘드리아 코드 24와 매우 유사하지만, 정지 코돈으로 사용하기보다는 타이로신용으로 UAA를 사용한다.[1]
이 코드는 많은 다른 미토콘드리아 코드와 함께 Tryptophan에 대한 UGA STOP의 재할당, 아르기닌 이외의 아미노산에 대한 AGG와 AGA를 공유한다.그러나, pterovranchian mitogenome에서 리신에 대한 AGG의 배정은 중수체 미토콘드리아에서는 다른 곳에서 발견되지 않지만 Arthropoda의 일부 taxa에서 발생한다.[2]
코드
AAs = FFLLSSSSYYY*CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSSKVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M-------*-------M---------------M---------------M------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
베이스: 아데닌(A), 시토신(C), 구아닌(G), 티민(T) 또는 우라실(U)
아미노산:Alanine (Ala, A), Arginine (Arg, R), Asparagine (Asn, N), Aspartic acid (Asp, D), Cysteine (Cys, C), Glutamic acid (Glu, E), Glutamine (Gln, Q), Glycine (Gly, G), Histidine (His, H), Isoleucine (Ile, I), Leucine (Leu, L), Lysine (Lys, K), Methionine (Met, M), Phenylalanine (Phe, F), Proline (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonine (Thr, T), Tryptophan(Trp, W), Tyrosine(Tyr, Y), Valine(Valine)
표준 코드와의 차이
DNA 코돈 | RNA 코돈 | 이 코드(33) | 표준코드(1) | |
---|---|---|---|---|
TAA | UAA | Tyr (Y) | STOP = Ter (*) | |
TGA | UGA | Trp (W) | STOP = Ter (*) | |
AGA | AGA | Ser (S) | Arg (R) | |
AGG | AGG | Lys (K) | Arg (R) |
참고 항목
참조
이 기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다. [3]
- ^ Li, Yuanning; Kocot, Kevin M.; Tassia, Michael G.; Cannon, Johanna T.; Bernt, Matthias; Halanych, Kenneth M. (2019-01-01). "Mitogenomics Reveals a Novel Genetic Code in Hemichordata". Genome Biology and Evolution. 11 (1): 29–40. doi:10.1093/gbe/evy254. PMC 6319601. PMID 30476024.
- ^ Perseke M, Hetmank J, Bernt M, Stadler PF, Schlegel M, Bernhard D (May 2011). "The enigmatic mitochondrial genome of Rhabdopleura compacta (Pterobranchia) reveals insights into selection of an efficient tRNA system and supports monophyly of Ambulacraria". BMC Evol Biol. 11 (134): 134. doi:10.1186/1471-2148-11-134. PMC 3121625. PMID 21599892.
- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "The Genetic Codes". Taxonomy browser. National Center for Biotechnology Information (NCBI), U.S. National Library of Medicine. Retrieved 7 January 2019.