코로컬라이제이션 벤치마크 소스

Colocalization Benchmark Source
코로컬라이제이션 벤치마크 소스
Colocalization Benchmark Source.png
콘텐츠
묘사형광 현미경 검사에서 혈소 침착성을 검증하기 위한 벤치마크 이미지의 무료 소스
연락
작가들Vadim Zinchuk, Yong Wu, Olga Grossenbacher-Zinchuk
발매일2012
접근
data 형식무손실 태그 부착 이미지 파일 형식(TIFF)
웹 사이트www.colocalization-benchmark.com
여러가지 종류의
면허증.공짜
버전1.1.1

CBS(Colocalization Benchmark Source)는 형광 현미경 검사 연구에서 마커의 혈소 침착 정도를 테스트하고 검증하기 위한 다운로드 가능한 이미지의 무료 모음이다.혈소 집중은 관심 있는 두 분자가 세포 내의 동일한 구조와 연관되고 잠재적으로 공통적인 기능적 [1][2][3]특성을 공유할 때 나타나는 시각적 현상이다.

CBS는 정량적 열량화 [4]측정 결과를 검증하기 위한 참조 도구를 연구자에게 제공한다.정확히 알려진(사전 정의된) 혈소 초점 값을 가진 컴퓨터 시뮬레이션 영상의 특수 생체 영상 정보학 데이터베이스 역할을 한다.이미지 시뮬레이션 알고리즘을 사용하여 생성되었습니다.이러한 벤치마크 이미지는 세트로 다운로드하거나 개별적으로 다운로드할 수 있습니다.연구자는 영상의 계수 값을 계산하고 벤치마크 영상과 비교함으로써 정량적 콜칼리제이션 연구 결과를 검증할 수 있습니다.CBS 이미지의 사용은 많은 연구에서 [5][6][7][8]설명되었다.

연구자는 벤치마크 이미지를 사용하여 사용자 지정 이미지의 콜로컬라이제이션(colocalization)을 검증할 때 사용자 지정 이미지의 예를 제출할 수 있습니다.제출된 영상은 Pearson의 상관 계수(Rr), 중첩 계수(R) 등과 같은 계수 값과 특성에 대한 설명과 함께 CBS 사이트에 게시됩니다.커스텀 이미지에 관한 정보를 송신하기 위한 템플릿은, CBS 사이트에서 다운로드할 수 있습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Bolte S & Cordelieres FP (2006)"빛 현미경 검사에서 세포 내 열량 분석 가이드 투어." J 현미경 224:213–232.
  2. ^ Comeau JW 등(2006)."정확한 형광 현미경 혈중 초점 측정 가이드"바이오피스 J 91:4611~4622.
  3. ^ Zinchuk V & Grossenbacher-Zinchuk O (2009년)."최근 양적 열원소 분석의 발전: 신경과학에 초점을 맞춘다."프로그 조직화학 세포화학 44:125-172.
  4. ^ Manders E et al.(1993)"듀얼 컬러 공초점 영상에서 물체의 열초점 측정." J Microwd 169:375–382.
  5. ^ Wu Y et al. (2010년)"형광 공초점 현미경 검사에서 공간 단백질-단백질 상관의 정량적 측정"바이오피스 J 98:493-504.
  6. ^ Zinchuk V 등 (2011년)"단백질 근접지수 및 상관계수 추정으로 향상된 배경 감소를 이용하여 형광표지자의 공간적 상관관계를 정량화합니다."NAT Protoc 6:1554-1567
  7. ^ Zinchuk V & Grossenbacher-Zinchuk O (2011)."공초점 형광 현미경 영상의 정량적 열원소 분석"Curr Protoc Cell Biol 유닛 4.19.Wayback Machine에서 2009-11-28 아카이브 완료
  8. ^ Zinchuk V 등 (2013년)"질적 및 양적 열원소화 사이의 차이를 메우는 것은 형광 현미경 연구로 귀결됩니다."Sci Rep 3:1365 doi:10.1038/srep01365.

외부 링크