결정 정보 파일

Crystallographic Information File
결정 정보 파일
파일 이름 확장명
.cif
인터넷 미디어 유형
화학/x-cif
형식 유형화학 파일 형식
연장 위치자체 정의 텍스트 보관 및 검색
까지 확장mmCIF
웹사이트www.iucr.org/resources/cif

CIF(Crystalographical Information File, CIF)는 국제결정학연맹(IUCr)에서 공포한 결정학적 정보를 나타내기 위한 표준 텍스트 파일 형식이다.CIF는 IUCr Committee on Crystalographical Information과 IUCr Committee on Journals가 후원하는 노력으로 IUCr의 Crystalographic Information에 의해 개발되었다.이 파일 형식은 홀, 앨런, 브라운에[1] 의해 처음 출판되었고 그 이후로 가장 최근에 1.1과 2.0 버전으로 개정되었다.[2]포맷에 대한 전체 사양은 IUCr 웹사이트에서 구할 수 있다.분자 보기를 위한 많은 컴퓨터 프로그램들은 Jmol을 포함하여 이 형식과 호환된다.

고분자 결정 정보 파일
파일 이름 확장명
.cif
인터넷 미디어 유형
화학/x-mmcif
형식 유형화학 파일 형식
연장 위치결정 정보 파일
웹사이트mmcif.wwpdb.org/pdbx-mmcif-home-page.html

[3]

밀접하게 관련된 것은 mmmCIF, 고분자 CIF로, [4]PDB(단백질 데이터 뱅크) 형식의 대안으로 의도된 것이다.현재 단백질 데이터 뱅크에서 사용하는 기본 형식이다.[5]

또한 Crystalographical Information Framework는 결정학적 정보 파일과 XML을 포함하되 이에 국한되지 않고 기계 판독이 가능한 다른 표현으로 표현 가능한 데이터 사전과 관계형 규칙에 기반한 광범위한 교환 프로토콜 시스템이다.

참조

  1. ^ Hall SR, Allen FH, Brown ID (1991). "The Crystallographic Information File (CIF): a new standard archive file for crystallography". Acta Crystallographica Section A. 47 (6): 655–685. doi:10.1107/S010876739101067X.
  2. ^ Brown ID, McMahon B (2002). "CIF: the computer language of crystallography". Acta Crystallographica Section B Structural Science. 58 (Pt 3 Pt 1): 317–24. doi:10.1107/s0108768102003464. PMID 12037350.
  3. ^ Bichler, Martin (1997), "Grundlegende WWW-Techniken", Aufbau unternehmensweiter WWW-Informationssysteme, Wiesbaden: Vieweg+Teubner Verlag, pp. 8–32, retrieved 2021-09-17
  4. ^ Bourne, PE; Berman, HM; McMahon, B; Watenpaugh, KD; Westbrook, JD; Fitzgerald, PM (1997). "Macromolecular Crystallographic Information File". Methods in Enzymology. 277: 571–90. doi:10.1016/s0076-6879(97)77032-0. PMID 18488325.
  5. ^ Adams, PD; Afonine, PV; Baskaran, K; Berman, HM; Berrisford, J; Bricogne, G; Brown, DG; Burley, SK; Chen, M; Feng, Z; Flensburg, C; Gutmanas, A; Hoch, JC; Ikegawa, Y; Kengaku, Y; Krissinel, E; Kurisu, G; Liang, Y; Liebschner, D; Mak, L; Markley, JL; Moriarty, NW; Murshudov, GN; Noble, M; Peisach, E; Persikova, I; Poon, BK; Sobolev, OV; Ulrich, EL; Velankar, S; Vonrhein, C; Westbrook, J; Wojdyr, M; Yokochi, M; Young, JY (1 April 2019). "Announcing mandatory submission of PDBx/mmCIF format files for crystallographic depositions to the Protein Data Bank (PDB)". Acta Crystallographica Section D. 75 (Pt 4): 451–454. doi:10.1107/S2059798319004522. PMC 6465986. PMID 30988261.

외부 링크