고리형 뉴클레오티드 결합 도메인

Cyclic nucleotide-binding domain
고리형 뉴클레오티드 결합 도메인
PDB 1cgp EBI.jpg
CAP-DNA 복합체 구조.[1]
식별자
기호.cNMP_바인딩
PF00027
인터프로IPR000595
스마트SM00100
프로 사이트PDOC00691
SCOP21 cgp / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00038

고리형 뉴클레오티드(cAMP 또는 cGMP)를 결합하는 단백질은 약 120개의 잔류물의 구조적 영역을 공유한다.이러한 단백질 중 가장 잘 연구된 것은 원핵생물 이화물질 유전자 활성화제(cAMP 수용체 단백질이라고도 함)이며, 여기서 이러한 도메인은 세 개의 알파-헬리스크와 독특한 여덟 가닥의 반팔레알 베타-배럴 구조로 구성되어 있는 것으로 알려져 있다.이 도메인에는 6개의 불변 아미노산이 있으며, 그 중 3개는 베타 바렐의 구조적 무결성을 유지하는 데 필수적인 글리신 잔기이다. cAMP- 및 cGMP 의존성 단백질 키나아제(cAPK 및 cGPK)는 고리형 뉴클레오티드 결합 도메인의 2개의 탠덤 복사본을 포함한다.cAPK는 두 개의 서로 다른 서브유닛, 즉 촉매 사슬과 조절 사슬로 구성되며, 두 개의 서브유닛은 도메인의 복사본을 모두 포함합니다.cGPK는 N 말단 부분에 도메인의 두 복사본을 포함하는 단일 사슬 효소입니다.척추동물의 고리형 뉴클레오티드 게이트 이온 채널도 이 도메인을 포함한다.이러한 양이온 채널은 두 개가 완전히 특성화되었으며, 하나는 시각 신호 전달에 역할을 하는 로드 셀에서 발견되었습니다.

이 영역을 포함하는 인간 단백질

CNBD1; CNGA1; CNGA2; CNGA3; CNGB1; CNGB3; HCN1; HCN2; HCN3; HCN4; KCNH1; KCNH2; KCNH3; KC4

레퍼런스

  1. ^ Schultz SC, Shields GC, Steitz TA (August 1991). "Crystal structure of a CAP-DNA complex: the DNA is bent by 90 degrees". Science. 253 (5023): 1001–7. Bibcode:1991Sci...253.1001S. doi:10.1126/science.1653449. PMID 1653449. S2CID 19723922.

추가 정보

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