엑소닉 스플리싱 엔핸서
Exonic splicing enhancer분자생물학에서 이질적인 핵RNA(hnRNA)나 사전 mRNA(mRNA)를 메신저 RNA(mRNA)로 정확하게 스플라이싱하도록 지시하거나 강화시키는 엑손 내 6개의 베이스로 구성된 DNA 시퀀스 모티브를 말한다.
소개.
DNA의 짧은 염기서열은 RNA로 옮겨지고, 그 다음 이 RNA는 단백질로 번역된다.DNA에 위치한 유전자는 인트론과 엑손들을 포함할 것이다.RNA를 준비하는 과정 중 일부는 단백질을 코드화하지 않는 RNA의 부분인 인트론을 분리하는 것을 포함한다.외음 스플라이싱 인핸서의 존재는 세포 기계에 의한 스플라이스 부위의 적절한 식별을 위해 필수적이다.
스플라이싱의 역할
SR 단백질은 EISE가 있는 지역에서 엑손 스플리싱을 결합하고 촉진하는 반면, 이질적인 리보뉴클레오프로틴 입자(hNNP)는 엑손 스플리싱(exon splising)이 있는 지역에서 결합하고 차단한다.두 가지 유형의 단백질은 모두 스플라이소솜의 조립과 적절한 기능에 관여한다.[1]
RNA 스플라이싱 중에 U2 소형 핵 RNA 보조 인자 1(U2AF35)과 U2AF2(U2AF65)가 지점부 및 인트론의 3' 스플라이스 부위와 상호작용하여 애벌레가 된다.EISE에 결합하는 SR 단백질은 U2AF35, U2AF65와의 상호작용을 증가시켜 엑손 스플라이싱을 촉진한다고 생각된다.[2]
외음 스플리싱 강화제 모티브의 돌연변이는 유전적 질환과 일부 암의 원인이 된다.EISE의 단순한 포인트 돌연변이는 스플리싱 인자에 대한 친화력을 억제하고 대체 스플리싱을 변경하여 mRNA 시퀀스 및 단백질 변환을 변경할 수 있다.유전학 연구 분야는 체내 EESE 모티브의 위치와 의의 파악에 전념하고 있다.[3]
리서치
238명의 EESE 지원자를 식별하기 위해 계산 방법이 사용되었다.[4]EISE는 임상적으로 중요한데, 이는 이전에 EISE에 위치한 무성 돌연변이로 생각되었던 동의어 포인트 돌연변이가 엑손 줄넘기와 기능하지 않는 단백질의 생산으로 이어질 수 있기 때문이다.
MLH1 유전자의 exon 3에서 exon splacing enhancer의 붕괴는 퀘벡의 한 가족에서 HNPCC(유아 비종양성 대장암)의 원인이다.[5]
스플라이싱 신호를 보내는 이 236 육각체는 진화적으로 보존되어 있다는 증거가 있다.[6]
참고 항목
- 엑소닉 스플리싱 소음기(ESS)
참조
- ^ Zhu, Jun; Mayeda, Akila; Krainer, Adrian R. (December 2001). "Exon Identity Established through Differential Antagonism between Exonic Splicing Silencer-Bound hnRNP A1 and Enhancer-Bound SR Proteins". Molecular Cell. 8 (6): 1351–1361. doi:10.1016/S1097-2765(01)00409-9. PMID 11779509.
- ^ Cartegni, Luca; Chew, Shern L.; Krainer, Adrian R. (1 April 2002). "Listening to silence and understanding nonsense: exonic mutations that affect splicing". Nature Reviews Genetics. 3 (4): 285–298. doi:10.1038/nrg775. PMID 11967553. S2CID 15307589.
- ^ Fairbrother, William G.; Yeo, Gene W.; Yeh, Rufang; Goldstein, Paul; Mawson, Matthew; Sharp, Phillip A.; Burge, Christopher B. (2004-07-01). "RESCUE-ESE identifies candidate exonic splicing enhancers in vertebrate exons". Nucleic Acids Research. 32 (Web Server issue): W187–W190. doi:10.1093/nar/gkh393. ISSN 0305-1048. PMC 441531. PMID 15215377.
- ^ "Predictive Identification of Exonic Splicing Enhancers in Human Genes". 297 (5583): 1007–1013. PMID 12114529.
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(도움말) - ^ McVety, S; Li, L; Gordon, P H; Chong, G; Foulkes, W D (17 June 2005). "Disruption of an exon splicing enhancer in exon 3 of MLH1 is the cause of HNPCC in a Quebec family". Journal of Medical Genetics. 43 (2): 153–156. doi:10.1136/jmg.2005.031997. PMC 2564635. PMID 15923275.
- ^ Carlini, David B.; Genut, Jordan E. (30 November 2005). "Synonymous SNPs Provide Evidence for Selective Constraint on Human Exonic Splicing Enhancers". Journal of Molecular Evolution. 62 (1): 89–98. doi:10.1007/s00239-005-0055-x. PMID 16320116. S2CID 30031983.