국제 신경정보학 조정 시설

International Neuroinformatics Coordinating Facility
국제 신경정보학 조정 시설
International Neuroinformatics Coordinating Facility logotype, abbreviation-only style.
약어INCF
포메이션2005; 17년 전(2005)[1]
본부INCF 사무국
위치
좌표59°20′54.46세기 18°1′25.78″E/59.3484611°N 18.0238278°E/ 59.3484611; 18.0238278
이사회 의장
마리안 마르톤[2]
웹사이트incf.org

국제신경정보조정시설(International Neuro Informatics Coording Facility, INCF)은 개방형, FARE [5]및 Citable 신경과학의 원칙을 수용하는 표준과 모범 사례를 개발, 평가 및 승인하는 임무를[4] 가진 국제 비영리 단체다.또한 INCF는 표준과 모범 사례가 재현성을 촉진하고 데이터와 코드를 포함한 전체 연구 결과물을 출판할 수 있는 방법에 대한 교육을 제공한다.INCF는 2005년 OECD의 세계과학포럼 실무그룹의 권고로 설립됐다.[6]INCF는 스웨덴 스톡홀름에 있는 카롤린스카 연구소가 주최한다.[7]INCF 네트워크는 신경정보학, 신경과학, 데이터 과학, 기술, 과학 정책 및 출판 분야에서 활동하는 기관, 조직, 회사 및 개인으로 구성된다.네트워크는 표준과 베스트 프랙티스의 개발과 보증을 안내하고 감독하는 글로벌 신경정보학 활동의 다양한 범주를 조정하는 관리 기관과 작업 그룹으로 구성되며, 표준과 베스트 프랙티스가 재현성을 촉진하고 출판이 가능하도록 하는 방법에 대한 교육을 제공한다.데이터 및 코드를 포함한 전체 연구 결과.[8]현재 이사회는 매튜 에이브럼스와 헬레나 레드미르,[9] 이사회는 메리안 마르톤이다.

INCF 네트워크는 뇌를 이해하기 위한 컴퓨터 접근법의 적용을 촉진하고, 다양한 데이터를 규모, 기법, 종에 걸쳐 통합하고 분석하기 위해 필요한 컴퓨팅 방법을 사용하여 두뇌를 이해하고 사회의 건강과 복지에 긍정적인 영향을 미치는 인프라를 개발하는 것을 목표로[10] 한다.null

배경

참고 항목:신경정보학

신경계를 성공적으로 이해하는 핵심 요소는 신경과학과 정보과학의 통합이다.신경계, 신경과학을 연구하는 분야는 게놈 연구에서부터 인간과 다른 종의 행동의 뇌 영상화에 이르기까지, 서로 다른 기능적 상태 하에서, 그리고 전혀 다른 분석적 개입에 이르기까지, 우리의 뇌가 가장 정교한 기술을 사용하여 어떻게 작용하는가를 이해하는 환상적인 도전에 대응해 왔다.al레벨이러한 노력의 결과로 대량의 데이터가 생성되었고, 이는 더 높은 수준의 복잡성으로 증가해 왔다.생성된 데이터는 서로 다른 수준의 연구와 분석 양식에서 나오는 이기종이다.이러한 통합의 도전에 직면하고, 이러한 데이터의 효율적이고 최대 활용을 보장하기 위해서는 이제 다음과 같은 공유 리소스를 개발하고 생성해야 한다.

  1. 신경과학 데이터 및 지식 데이터베이스
  2. 분석 및 모델링 도구
  3. 컴퓨터 모델

이러한 도전은 신경과학과 정보과학의 융합, 즉 신경정보학의 분야를 통해 충족되고 있다.null

역사

창세기

신경정보학의 새로운 분야에서 국제적인 노력을 조정하기 위한 권고안은 1998년 당시 OECD 메가사이언스 포럼의 보호 아래 상세히 기술된 생물정보학 보고서에서 처음 만들어졌다.[11]Dr. Global Science Forum의 Neuro informatics Working Group에서 광범위한 논의를 거쳐.스티븐 H. 코슬로는 2002년에 국제 신경정보학 조정 위원회와 신경정보학 연구에 대한 보조금 지원 시스템을 만들자는 제안이 발표되었다.[12]이 프로젝트는 2004년 1월 OECD 과학장관 회의에서 승인되었다.Sixteen countries (Australia, Canada, China, the Czech Republic, Denmark, Finland, France, Germany, India, Italy, Japan, the Netherlands, Norway, Sweden, Switzerland, the United Kingdom, the United States and Victoria, Australia), as well as the European Commission, then elaborated the working documents that form the legal basis for the INCF and t그는 국제 신경정보학(PIN)에 프로그램했다.[13]null

설립

INCF[14] 창설을 위한 조건은 2005년 7월 7개국(체코, 핀란드, 독일, 노르웨이, 스웨덴, 스위스, 미국)이 양해각서에 서명하고 재정기여를 서약했다.INCF 사무국을 유치하기 위한 입찰이 시작되었다.두 개의 제안이 접수되었고, 11월 3일, OECD는[15] 전문가 위원회를 소집하여 그 제안들을 검토하고 순위를 매겼다.위원회는 스웨덴의 제안에 더 높은 순위를 배정했고, 이 권고안은 11월 28일 OECD 본부에서 만났을 때 INCF 이사회에 의해 승인되었다.광범위한 국제적 논의에 이어 2007년 2월 스톡홀름에 있는 카롤린스카 연구소에 본부를 두고 INCF가 공식 출범했다.null

INCF는 신경정보학 협업을 촉진하고 뇌 연구의 재현성을 촉진한다.

  • 개방형 및 FAIR(Findable Accessible Interoperability Reusable Reusable) 신경과학(FAIR 데이터)을 지원하는 표준 및 모범 사례의 개발 및 승인을 통해 글로벌 신경과학 인프라의 조정 제공
  • 신경정보학이 엄격함과 재현성, 개방적이고 공정한 과학을 촉진하는 방법에 대해 연구자, 관리자 및 학생들을 훈련시키고 연구 결과물 전체를 발표한다: 서술, 데이터, 코드
  • FORES(FAIR, Open, Research-object 기반 및 Citable 에코시스템)로 이동하도록 신경과학을 훈련으로 장려한다.
  • 과학 분야로서 신경정보학의 진보와 지속적인 발전을 촉진한다.

주요 프로그램 결과물

포함시키다

  • 설치류 두뇌의 좌표 기반 기준 공간인 왁스홀름 공간(WHS)
  • 확장 가능한 Brain Atlas,[19] 브레인 아틀라스(Brain Atlas), 브레인 아틀라스(Brain Atlas), 브레인 아틀라스, 영상
  • 일반 모델 설명 언어인 [20]NineML
  • 대규모 뉴런 시뮬레이터 및 기타 애플리케이션이 런타임 동안 통신할 수 있도록 하는 멀티 시뮬레이션 코디네이터(MUSIC)[21]
  • 검증 정보를 포함한 메타데이터의 생성, 저장 및 조회를 위한 프레임워크인 [22]NI-DM(Neuroimizing Informatics Data Model)
  • 지식공간([23]KnowledgeSpace)은 뇌 연구 개념을 세계 각국의 데이터, 모델, 문헌과 연계한 커뮤니티 기반의 백과사전이다.
  • TrainingSpace는 [24]INCF, 파트너 및 기존 커뮤니티 리소스 모두에 의해 개발된 신경정보학 교육 자원을 연결하는 온라인 저장소다.

참고 항목

참조

  1. ^ "History". KI.se. Retrieved 9 October 2019.
  2. ^ a b "Contact". INCF. Retrieved 9 October 2019.
  3. ^ "About us". INCF. Retrieved 9 October 2019.
  4. ^ "Mission INCF". www.incf.org. Retrieved 2019-10-09.
  5. ^ Hagstrom, Stephanie (2014-09-03). "The FAIR Data Principles". FORCE11. Retrieved 2017-12-04.
  6. ^ "About". Neuroscience Peer Review Consortium. Retrieved 19 September 2017.
  7. ^ "Location INCF". www.incf.org. Retrieved 2019-10-09.
  8. ^ "INCF Network INCF". www.incf.org. Retrieved 2019-10-09.
  9. ^ "Key personal INCF". www.incf.org. Retrieved 2019-10-08.
  10. ^ "What we do INCF". www.incf.org. Retrieved 2017-12-04.
  11. ^ Megascience Forum Working Group on Biological Informatics (January 1999). Final Report (Report). Organisation for Economic Co-operation and Development. pp. 3–4, 49–50, 70–72. Retrieved 19 September 2017 – via INCF ownCloud.
  12. ^ Global Science Forum Neuroinformatics Working Group (June 2002). Report on Neuroinformatics (Report). Organisation for Economic Co-operation and Development. pp. 5, 11–15, 46. Retrieved 19 September 2017 – via ICNF ownCloud.
  13. ^ "Luanch of the project INCF". www.OECD.org. Retrieved 2019-10-09.
  14. ^ "Incf INCF". www.incf.org. Retrieved 2017-12-04.
  15. ^ "OECD.org - OECD". www.oecd.org. Retrieved 2017-12-04.
  16. ^ Wilkinson M, Dumontier M, Aalbersberg I, et al. (March 2016). "The FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship". Scientific Data. 3 (160018): 160018. Bibcode:2016NatSD...360018W. doi:10.1038/sdata.2016.18. PMC 4792175. PMID 26978244.
  17. ^ Breeze JL, Poline JB, Kennedy DN (July 2012). "Data sharing and publishing in the field of neuroimaging". GigaScience. 1 (9): 9. doi:10.1186/2047-217x-1-9. PMC 3626511. PMID 23587272.
  18. ^ Johnson GA, Badea A, Brandenburg J, Cofer G, Fubara B, Liu S, Nissanov J (Nov 2010). "Waxholm Space: An image-based reference for coordinating mouse brain research". NeuroImage. 53 (2): 365–372. doi:10.1016/j.neuroimage.2010.06.067. PMC 2930145. PMID 20600960.
  19. ^ "Scalable Brain Atlas - Neuroanatomy at your fingertips". scalablebrainatlas.incf.org. Retrieved 2017-12-04.
  20. ^ "NineML". Retrieved 2017-12-04.
  21. ^ MUSIC, the MUltiSimulation Coordinator, International Neuroinformatics Coordinating Facility (INCF), 2017-11-14, retrieved 2017-12-04
  22. ^ "- Neuroimaging Data Model". Retrieved 2017-12-04.
  23. ^ "KnowledgeSpace - Home". knowledge-space.org. Retrieved 2017-12-04.
  24. ^ "TrainingSpace - Home". training.incf.org. Retrieved 2018-04-24.

외부 링크