인터그론

Integron

인터그론은 새로운 유전자의 비축과 발현을 통해 박테리아가 빠르게 적응하고 진화할 수 있도록 하는 유전적 메커니즘이다.[1]이러한 유전자들은 유전자 카세트(최근 정수 카세트로 변화하고 있는 용어)라는 특정한 유전자 구조에 내장되어 있는데, 일반적으로 재조합 사이트(atC)와 함께 하나의 발기인 없는 개방형 독서 프레임(ORF)을 운반한다.Integron 카세트는 통합 물질에 의해 매개되는 사이트별 재결합 반응에 의해 Integron 플랫폼의 attI 사이트에 통합된다.null

디스커버리

인터그론은 처음에는 항생제 내성에 대한 역할을 통해 결합 플라스미드에서 발견되었다.[2]실제로 이러한 이동형 정자는 현재 알려진 바와 같이 항생제 내성과 거의 독점적으로 관련된 유전자를 함유한 다양한 카세트를 운반할 수 있다.더 많은 연구들은 정수가 염색체 원소라는 결론에 도달했고, 플라스미드로의 이동은 트랜스포존에 의해 촉진되었고 항생제의 집중적인 사용에 의해 선택되었다.염색체 정수에서 발견된 카세트의 대다수의 기능은 여전히 알려져 있지 않다.null

구조

정수(integron)는 최소한 다음과 같이 구성된다.[3][4]

  • 사이트별 재조합에 대한 유전자 인코딩: intI, 통합효소 계열에 속함
  • 근위부 재조합 사이트: atTI, 통합에[5] 의해 인식되며 유전자 카세트를 삽입할 수 있는 위치
  • 프로모터: 카세트 인코딩 유전자의 전사 지시 pc

유전자 카세트

주요 기사:유전자 카세트

또한, 정자는 보통 그것에 통합된 하나 이상의 유전자 카세트를 포함할 것이다.유전자 카세트는 항생제 내성을 위한 유전자를 암호화할 수 있지만, 정점에 있는 대부분의 유전자는 특징이 없다.attC 시퀀스(59-be라고도 함)는 측면 카세트를 반복하는 것으로, 카세트를 attI 사이트에서 통합하고 분해하여 수평 유전자 전이를 거치게 한다.null

발생

인터그론은 플라스미드와 트랜스폰스와 같은 이동 유전 요소의 일부로 발견될 수 있다.인터그론은 염색체에서도 발견될 수 있다.null

용어.

슈퍼인테그론이라는 용어는 비브리오콜레라의 작은 염색체에 긴 카세트 배열을 가진 정수기에 1998년(그러나 정의가 없음) 처음 적용되었다.[6][7]이 용어는 이후 다양한 카세트 배열 길이의 정수 또는 박테리아 염색체(예: 플라스미드)의 정수(intergron)에 사용되어 왔다."초정수론"의 사용은 그것의 의미가 불명확하기 때문에 현재 금지되어 있다.[6]null

좀 더 현대적인 용어로 박테리아 염색체에 위치한 정자를 좌식 염색체 정수라고 하며, 트랜스폰스나 플라스미드와 관련된 정수를 이동형 정수라고 부른다.[8]null

참조

  1. ^ Antonio Escudero, José; Mazel, Didier; Nivina, Aleksandra; Loot, Céline (2015). "ASMscience The Integron: Adaptation On Demand". Microbiology Spectrum. 3 (2): MDNA3–0019–2014. doi:10.1128/microbiolspec.mdna3-0019-2014. PMID 26104695.
  2. ^ Mazel (2006). "Integrons: agents of bacterial evolution". Nature Reviews Microbiology. 4 (8): 608–620. doi:10.1038/nrmicro1462. PMID 16845431. S2CID 4407151.
  3. ^ Kovalevskaya, N. P. (2002). "Mobile Gene Cassettes and Integrons". Molecular Biology. 36 (2): 196–201. doi:10.1023/A:1015361704475. S2CID 2078235.
  4. ^ 홀 R, 콜리스 C, 킴 M, 파트리지 S, 레키아 G, 스톡스 H(1999) 이동 유전자 카세트 및 정수 진화 중.
  5. ^ Hall, RM; Collis, CM (1995). "Mobile gene cassettes and integrons: Capture and spread of genes by site-specific recombination". Molecular Microbiology. 15 (4): 593–600. doi:10.1111/j.1365-2958.1995.tb02368.x. PMID 7783631.
  6. ^ a b Hall, R. M.; Stokes, HW (2004). "Integrons or super integrons?". Microbiology. 150 (Pt 1): 3–4. doi:10.1099/mic.0.26854-0. PMID 14702391.
  7. ^ Mazel, D.; Dychinco, B; Webb, VA; Davies, J (1998). "A Distinctive Class of Integron in the Vibrio cholerae Genome". Science. 280 (5363): 605–8. Bibcode:1998Sci...280..605M. doi:10.1126/science.280.5363.605. PMID 9554855.
  8. ^ Loot, Céline; Nivina, Aleksandra; Cury, Jean; Escudero, José Antonio; Ducos-Galand, Magaly; Bikard, David; Rocha, Eduardo P. C.; Mazel, Didier (3 May 2017). "Differences in Integron Cassette Excision Dynamics Shape a Trade-Off between Evolvability and Genetic Capacitance". mBio. 8 (2). doi:10.1128/mBio.02296-16. PMC 5371416. PMID 28351923.

추가 읽기

외부 링크


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