키스 스템루프

Kissing stem-loop
RNA 스템 루프의 예.이제 두 번째 RNA 스템 루프가 상보적인 염기서열을 갖는 경우, 두 개의 루프가 키스 루프를 발생시키는 염기쌍을 형성할 수 있습니다.
이 애니메이션 GIF는 키싱 루프라고 불리는 구조에서 두 개의 RNA 루프(주황색과 녹색)가 서로 결합하는 것을 보여준다.두 개의 RNA 루프는 적층 상호작용과 수소 결합(공간 채우기 표현에 표시된 상호작용 염기)[1]을 통해 상호작용합니다.

유전학에서 키스 스템 루프 또는 키스 스템 루프 상호작용은 두 헤어핀 루프 쌍 사이에 두 개의 염기가 있을 때 리보핵산(RNA)에 형성된다.이러한 분자 내 및 분자 간 키스 상호작용은 많은 RNA의 [2]3차 또는 4차 구조를 형성하는데 중요하다.

또한 루프 루프 유사 노트로 불리는 RNA 키스 상호작용은 한 헤어핀 고리에 짝을 이루지 않은 뉴클레오티드가 있고 다른 헤어핀 [3]고리에 짝을 이루지 않은 뉴클레오티드가 있을 때 일어납니다.헤어핀 루프가 별도의 RNA 분자에 위치할 때, 그들의 분자간 상호작용은 키스 복합체라고 불립니다.이러한 상호작용은 일반적으로 줄기 고리 사이에서 형성된다.단, 2개의 분자간 왓슨-크릭 [4][5]염기쌍만을 포함하는 안정적인 복합체가 관찰되었다.

생물학적 의의

RNA 분자는 특이하고 매우 복잡한 3차원 구조를 채택함으로써 살아있는 세포에서 그 기능을 수행한다.재조합은 키스루프에 의해 시작된다고 믿어진다.재조합은 특히 [6]바이러스의 적응과 생존에 있어 성공적인 진화에 매우 중요합니다.또한 키싱 복합체는 E에서 CoLE1 플라스미드의 조절제로서 기능하는 2개의 헤어핀 루프로 구성되어 있다.대장균.이 조절은 E의 안티센스 RNA가 있을 때 일어난다.DNA 복제를 담당하는 대장균과 RNA 프라이머가 교배하여 키스 콤플렉스를 형성한다.[7]

레트로바이러스로

레트로바이러스는 구조가 매우 유사한 바이러스입니다.이것에 의해, 호스트내에서 사일런트하게 복제해, 복제가 완료해, 호스트가 필요 없게 될 때까지 생명을 유지할 수 있습니다.레트로바이러스의 게놈 RNA는 5' UTR의 비코드 영역인 이합체 연결 구조(DLS)에 비공유적으로 연결되어 있다.키싱루프 상호작용이 일어나려면 상보적 가닥에 5'-플랭킹 푸린과 2개의 집중 염기를 포함하는 3중 상호작용이 있다.이 상호작용은 키싱 루프 [8]조광기의 주요 홈에 기록된다.

인간면역결핍바이러스(HIV)는 체액의 상호작용을 통해 전염될 수 있는 레트로바이러스이다.HIV 바이러스에는 인간 면역 결핍 바이러스 타입 1(HIV-1)과 인간 면역 결핍 바이러스 타입 2(HIV-2)의 두 종류가 있습니다.인간면역결핍바이러스 변종 중 HIV-1이 가장 흔한 변종이다.HIV-1 바이러스의 RNA는 이중화를 형성하기 위한 이합체 개시 부위(DIS)의 상호작용의 주요 단계인 키싱 스템루프 상호작용을 인식 수단으로 사용한다.키스 스템-루프 상호작용을 연구하기 위해 진핵세포에서 HIV Type 1 바이러스의 복제에 이합체화 개시부위(DIS) 복합체가 필수적이며, 스템루프 구조의 변경은 이합체화 상호작용을 감소시키는 것으로 나타났다.실험적으로 생체 내에서는 이합체화 개시 부위(DIS)의 돌연변이가 [9]DIS 복합체의 이합체화를 방해한다는 것이 확인되었다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Proteopedia 페이지에서 수정.
  2. ^ Forsdyke DR (September 1995). "A stem-loop "kissing" model for the initiation of recombination and the origin of introns". Molecular Biology and Evolution. 12 (5): 949–958. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a040273. PMID 7476142.
  3. ^ Nowakowski J, Tinoco Jr I (1997). "Semin". Virology. 8: 153–165. doi:10.1006/smvy.1997.0118.
  4. ^ Kim CH, Tinoco I (August 2000). "A retroviral RNA kissing complex containing only two G.C base pairs". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (17): 9396–9401. doi:10.1073/pnas.170283697. PMC 16875. PMID 10931958.
  5. ^ Andersen AA, Collins RA (July 2001). "Intramolecular secondary structure rearrangement by the kissing interaction of the Neurospora VS ribozyme". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (14): 7730–7735. Bibcode:2001PNAS...98.7730A. doi:10.1073/pnas.141039198. PMC 35410. PMID 11427714.
  6. ^ Chen Y, Varani G (June 2010). "RNA Structure". Encyclopedia of Life Sciences. Chichester: John Wiley & Sons Ltd. doi:10.1002/9780470015902.a0001339.pub2. ISBN 978-0-470-01617-6.
  7. ^ Chang KY, Tinoco I (August 1994). "Characterization of a "kissing" hairpin complex derived from the human immunodeficiency virus genome". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (18): 8705–8709. Bibcode:1994PNAS...91.8705C. doi:10.1073/pnas.91.18.8705. PMC 44675. PMID 8078946.
  8. ^ Paillart JC, Westhof E, Ehresmann C, Ehresmann B, Marquet R (July 1997). "Non-canonical interactions in a kissing loop complex: the dimerization initiation site of HIV-1 genomic RNA". Journal of Molecular Biology. 270 (1): 36–49. doi:10.1006/jmbi.1997.1096. PMID 9231899.
  9. ^ Paillart JC, Skripkin E, Ehresmann B, Ehresmann C, Marquet R (May 1996). "A loop-loop "kissing" complex is the essential part of the dimer linkage of genomic HIV-1 RNA". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 93 (11): 5572–5577. Bibcode:1996PNAS...93.5572P. doi:10.1073/pnas.93.11.5572. JSTOR 39474. PMC 39288. PMID 8643617.

추가 정보

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