서열화된 고고학 게놈 목록

List of sequenced archaeal genomes

이 서열화된 고고학 게놈 목록에는 공공데이터베이스에 조립, 주석 달기, 축적된 완전한 게놈 서열을 공개적으로 이용할 수 있는 것으로 알려진 모든 고고자가 포함되어 있다.Methanococcus jannaschii는 1996년에 게놈 서열이 조사된 최초의 고고학자였다.[1]null

현재 이 목록에는 크레나카게오타 종에 속하는 39종의 게놈, 에우리카게오타에 속하는 105종의 게놈, 코라카게오타와 나노카게오타에 속하는 게놈 1종, 타우마카게오타에 속하는 게놈 3종, 미분류 아고세아에 속하는 게놈 1종 등 총 150종의 고고 게놈들이 있다.null

크레나카게오타

아틸로바목

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
아키딜로부스 사카로보란스 345-15 1,496,000 1,547 [2] CP001742 2010

데술포로코칼레스

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
에어로피럼 퍼닉스 K1 1,669,695 2,694 [3] NC_000854(NCBI 참조 시퀀스) 1999
데술푸로코쿠스 캄차텐시스 1221n 1,365,000 1,521 [4] CP001140 2009
초열병 부틸리쿠스 DSM 5456 1,667,000 1,669 [5] CP000493 2007
이그니코쿠스 병원이 있는 KIN4/I, DSM 18386 1,297,000 1,496 [6] CP000816 2008
이그니스파에라 집산인 AQ1.S1, DSM 17230 1,875,000 2,042 [7] CP002098 2010
피롤로부스 후마리 1A, DSM 11204 1,843,000 2,038 [8] CP002838 2011
포도상구균 헬레니쿠스 P8, DSM 12710 1,580,000 1,716 [9] CP002051 2011
포도상구균 양념장 F1, DSM 3639 1,570,000 1,659 [10] CP000575 2011
테르모인세라 집산인 M11TL, DSM 11486 1,316,000 1,457 [11] CP001939 2010

설포목

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
아키디아누스 병원이 있는 W1 2,137,000 2,424 [12] CP002535 2011
메탈인페라 큐브리나 AR-4 1,840,000 2,077 [13] CP002656 2011
메탈인페라 석굴라 DSM 5348 2,191,000 2,347 [14] CP000682 2008
술포오부스 산도칼다리우스 DSM 639 2,225,959 2,223 [15] CP000077 2005
술포오부스 섬모양의 HVE10/4 2,655,000 [16] CP002426 2011
술포오부스 섬모양의 L.D.8.5 2,722,000 2,996 [17] CP001731 염색체

플라스미드 pLD8501 CP001732

 2009
술포오부스 섬모양의 L.S.2.15 2,736,000 3,068 [17] CP001399 2009
술포오부스 섬모양의 M.14.25 2,608,000 2,900 [17] CP001400 2009
술포오부스 섬모양의 M.16.27 2,692,000 2,956 [17] CP001401 2009
술포오부스 섬모양의 M.16.4 2,586,000 2,869 [17] CP001402 2009
술포오부스 섬모양의 레이15A 2,522,000 [16] CP002425 2011
술포오부스 섬모양의 Y.G.57.14 2,702,000 3,079 [17] CP001403 2009
술포오부스 섬모양의 Y.N.15.51 2,812,000 3,318 [17] CP001404 염색체

플라스미드 pYN01 CP001405

 2009
술포오부스 섬모양의 LAL14/1 2,465,177 2,601 [18] CP003928 2013
술포오부스 솔파타리쿠스 P2 2,992,245 2,995 [19] AE006641 2001
술포오부스 솔파타리쿠스 98/2 2,668,000 2,728 DOE 공동 게놈 연구소 CP001800 2009
술포오부스 토코다이이 7 2,694,765 2,826 [20] BA000023 2001

테르모프로테아목

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
칼디비르가 마퀴링엔시스 IC-167 2,077,000 2,011 DOE 공동 게놈 연구소 CP000852 2007
파이로바쿨룸속 에어로필럼 IM2 2,222,430 2,605 [21] AE009441 2002
파이로바쿨룸속 비소의 PZ6, DSM 13514 2,121,000 2,410 DOE 공동 게놈 연구소 CP000660 2007
파이로바쿨룸속 칼리디폰티스 JCM 11548 2,009,000 2,213 DOE 공동 게놈 연구소 CP000561 2007
파이로바쿨룸속 섬모양의 DSM 4184 1,826,000 2,063 DOE 공동 게놈 연구소 CP000504 2006
열로바쿨럼 sp. 1860 게시되지[22] 않음 CP003098 2011
테르모필룸속 움푹 패다 Hrk 5 1,781,000 1,930 [23] CP000505 염색체

플라스미드 pTPEN01 CP000506

 2008
테르모프로테우스속 중성미자 V24Sta 1,769,000 2,053 DOE 공동 게놈 연구소 CP001014 2008
테르모프로테우스속 테낙스 크라1 1,841,000 2,100 [24] FN869859 2011
테르모프로테우스속 우조니엔시스 768-20 1,936,000 2,229 [25] CP002590 2011
벌카니사에타 유통시키다 DSM 14429 2,374,000 2,592 [26] CP002100 2010
벌카니사에타 망토브스키아 768-28 2,298,000 2,393 [27] CP002529 2011

에우리아카에오타

아르케오글로비

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
아르케오글로부스 풀지두스 DSM4304 2,178,400 2,407 [28] AE000782 1997
아르케오글로부스 베니피쿠스 SNP6, DSM 11195 1,901,000 2,194 DOE 공동 게놈 연구소 CP002588 2011
아르케오글로부스 다방면의 Av18, DSM 5631 1,563,000 1,911 [29] CP001857 염색체

플라스미드 parcpr01 CP001858

 2010
페로글로부스속 태연자약. AEDII12DO, DSM 10642 2,196,000 2,622 [30] CP001899 2011

할로박테리아

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
할랄칼리코쿠스 저트갈리 B3, DSM 18796 3,690,000 3925 [31] 염색체 I CP002062

플라스미드 1 CP002063
플라스미드 2 CP002064
플라스미드 3 CP002065
플라스미드 4 CP002066
플라스미드 5 CP002067
플라스미드 6 CP002068

2010
할로아르쿨라 히스파니카 CGMCC 1.2049 3,484,000 3,561 [32] 염색체 I CP002921

염색체 II CP002922
플라스미드 pH400 CP002923

2011
할로아르쿨라 마리스모투이 ATCC 43049 3,131,724 3,131 [33] 염색체 I AY596297

염색체 II AY596298
플라스미드 pNG100 AY596290
플라스미드 pNG200 AY596291
플라스미드 pNG300 AY596292
플라스미드 pNG400 AY596293
플라스미드 pNG500 AY596294
플라스미드 pNG600 AY596295
플라스미드 pNG700 AY596296

2004
할로박테리움살리나룸 R1, DSM 671 2,000,000 2,801 [34] NC_010364 염색체

플라스미드 PHS1 NC_010366
플라스미드 PHS2 NC_010369
플라스미드 PHS3 NC_010368
플라스미드 PHS4 NC_010367

2008
할로박테리움 종 NRC-1 2,014,239 2,058 [35] NC_002607 염색체

플라스미드 pNRC100 NC_002607
플라스미드 pNRC200 NC_002608

2000
넙치목 라키살시 AJ5, JCM 12983 4,320,000 4,682 [36] AGFZ00000000 2011
헤일로페락스 화산 DS2 [37] CP001956 염색체

플라스미드 pHv1 CP001957
플라스미드 pHv2 CP001954
플라스미드 pHv3 CP001953
플라스미드 pHv4 CP001955

2010
할로게오메트리움속 붕어빵 PR3, DSM 11551 3,920,000 4,059 [38] CP001690 염색체

플라스미드 pHBOR01 CP001691
플라스미드 pHBOR02 CP001692
플라스미드 pHBOR03 CP001693
플라스미드 pHBOR04 CP001694
플라스미드 pHBOR05 CP001695

2009
할로미크로비움 무코하타이 arg-2, DSM 12286 3,332,000 3,475 [39] CP001688 염색체

플라스미드 pHmuk01 CP001689

 2009
할로피거 사나두엔시스 SH-6 3,668,000 3,685 DOE 공동 게놈 연구소 CP002839 염색체

플라스미드 pHALXA01 CP002840
플라스미드 pHALXA02 CP002841
플라스미드 pHALXA03 CP002842

2011년 (크로모솜)
할로카드라툼 월스비 C23, DSM 16854 3,148,000 [40] FR746099 염색체

플라스미드 PL6A FR746101
플라스미드 PL6B FR746102
플라스미드 PL100 FR746100

2011
할로카드라툼 월스비 HBSQ001, DSM 16790 3,132,000 2,914 [41] AM180088 염색체

플라스미드 PL47 AM180089

 2006
할로하브두스 티아마테아 SARL4B 3,840,000 4,034 [42] AFNT00000000 2011
할로하브두스 우타헨시스 AX-2, DSM 12940 3116Kb 3076 [43] CP001687 2009
할로루브럼 라쿠스프로펀디 ATCC 49239 4,300,000 3,725 DOE 공동 게놈 연구소 1 CP001365 염색체

염색체 2 CP001366
플라스미드 pHLAC01 CP001367

2009년 (크로모솜 1, 2)
할로테리게나 투르크메니카 VKM B-1734, DSM 5511 5,440,000 5,351 [44] CP001860 염색체

플라스미드 pHTUR01 CP001861
플라스미드 pHTUR02 CP001862
플라스미드 pHTUR03 CP001863
플라스미드 pHTUR04 CP001864
플라스미드 pHTUR05 CP001865
플라스미드 pHTUR06 CP001866

2010
나트리알바아시아속 ATC 700177 [45] 조사 2004
나트리알바 마가디이 ATCC 43099 3,751,000 4,364 DOE 공동 게놈 연구소 CP001932 2010
나트로노모나스속 파라오니스 DSM2160 2,595,221 2,675 [46] CR936257 염색체

플라스미드 PL131 CR936258
플라스미드 PL23 CR936259

2005

메타노박테리아

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
메타노박테리움 sp.AL-21 2,583,000 DOE 공동 게놈 연구소
우르바나 샴페인 일리노이 주의 유니브		 CP002551 2011
메타노박테리움 sp.SWAN-1 2,546,000 2,500 DOE 공동 게놈 연구소
우르바나 샴페인에서 유니브 일리노이 주		 CP002772 2011
메타노박테리움 보온성 종양 델타-H 1,751,377 1,869 [47] AE000666 1997
메타노브레비박터 루미난튬 M1 2,937,000 2,283 [48] CP001719 2010
메타노브레비박터 스미시이 DSM 2375 1,704,000 1,748 워싱턴 대학교 ABYW00000000 2008
메타노브레비박터 스미시이 F1, DSM 2374 1,707,000 1,749 워싱턴 대학교 ABYV00000000 2010
메타노브레비박터 스미시이 PS, ATCC 35061 1,853,000 1,841 [49] CP000678 2007
메타노브레비박터 스미시이 TS94A 1,889,000 1,808 [50] AELU00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS94B 1,886,000 1,856 [50] AELV00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS94C 1,910,000 1,812 [50] AELW00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS95A 1,992,000 1,961 [50] AELX00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS95B 1,972,000 1,895 [50] AELY00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS95C 1,978,000 1,874 [50] AELZ00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS95D 2,011,000 1,860 [50] AEMA00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS96A 1,975,000 1,852 [50] AEMB00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS96B 1,869,000 1,742 [50] AEMC00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS96C 1,818,000 1,764 [50] AEMD00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS145A 1,782,000 1,786 [50] AEKU00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS145B 1,797,000 1,880 [50] AELL00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS146A 1,792,000 1,823 [50] AELM00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS146B 1,794,000 1,814 [50] AELN00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS146C 1,947,000 2,355 [50] AELO00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS146D 1,713,000 1,693 [50] AELP00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS146E 1,952,000 1,887 [50] AELQ00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS147A 2,008,000 1,969 [50] AELR00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS147B 1,965,000 1,911 [50] AELS00000000 2011
메타노브레비박터 스미시이 TS147C 1,973,000 2,014 [50] AELT00000000 2011
메타노세라속 스타드마네아과 DSM 3091 1,767,403 1,534 [51] CP000102 2005
메타노르모박터 마부르겐시스 마르부르크 DSM 2133 1,634,000 1,806 [52] CP001710 2010
메타노토르무스 정열적인 V24S, DSM 2088 1,243,000 1,361 [53] CP002278 2010

메타나노코치

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
메타노칼도코쿠스 열성 AG86 1,485,000 1,663 DOE 공동 게놈 연구소 CP001696 염색체

플라스미드 pMEFER01 CP001697

 2009년 (크로모썸)
메타노칼도코쿠스 추론하다 ME 1,328,000 1,513 DOE 공동 게놈 연구소 CP002009 2010
메타노칼도코쿠스 야나스키 DSM 2661 1,664,970 1,715 [54] 염색체: L77117

대형 플라스미드:L77118
소형 플라스미드:L77119

1996
메타노칼도코쿠스 불카니우스 M7, DSM 12094 1,746,000 1,808 DOE 공동 게놈 연구소 CP001787 염색체

플라스미드 pMETVU01 CP001788
플라스미드 pMETVU02 CP001789

2009
메타노칼도코쿠스 sp.FS406-22 1,760,000 1,893 DOE 공동 게놈 연구소 CP001901 염색체

플라스미드 pFS01 CP001902

 2010년 (크로모솜)
메타노코쿠스 애오리쿠스 난카이 3호 1,569,000 1,554 DOE 공동 게놈 연구소 CP000743 2007
메타노코쿠스 마리팔루디스 C5 1,780,000 1,896 DOE 공동 게놈 연구소 CP000609 2007
메타노코쿠스 마리팔루디스 C6 1,744,000 1,874 DOE 공동 게놈 연구소 CP000867 2007
메타노코쿠스 마리팔루디스 C7 1,772,000 1,858 DOE 공동 게놈 연구소 CP000745 2007
메타노코쿠스 마리팔루디스 S2 1,661,137 1,722 [55] NC_005791(NCBI 참조 시퀀스) 2004
메타노코쿠스 마리팔루디스 X1 1,746,000 1,892 [56] CP002913 2011
메타노코쿠스 반니엘리야 SB 1,720,000 1,755 DOE 공동 게놈 연구소 CP000742 2007
메타노코쿠스 볼태 A3 1,936,000 1,768 DOE 공동 게놈 연구소 CP002057 2010
메타노테모코쿠스 오키나우엔시스 IH1 1,662,000 1,662 DOE 공동 게놈 연구소 CP002792 염색체

플라스미드 pMETOK01 CP002793

 2011년 (크로모솜)
메타노토리스 이그네우스 Kol5, DSM 5666 1,854,000 1,843 DOE 공동 게놈 연구소 CP002737 2011

메타노미크로비아

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
칸디다스 메타노레굴라 부오니 6A8 2,542,000 2,518 DOE 공동 게놈 연구소[57] CP000780 2007
메타노셀라 sp.쌀 클러스터 I(RC-I) MRE50 3,179,916 3103 게놈 시퀀스,[58] 그 다음 분류법 배치[59] AM114193 2005
메타노셀라 팔루디콜라 사나에 2,957,635 3004 [60] AP011532 2011
메타노셀라 콘라디히 HZ254 1,316,380 2512 [61] CP003243 2012
메탄노코이데스 부르토니의 DSM6242 2,575,032 2,273 [62] CP000300 2009
메타노코르푸스쿨룸속 라브레벨의 Z 1,804,000 1,830 [63] CP000559 2009
메타노쿨레우스 마리스니그리 JR1, DSM 1498 2,478,000 2,560 [64] CP000562 2009
메타노할로비움속 에베스티가툼 Z-7303 2,406,232 2,254 DOE 공동 게놈 연구소[65] 염색체:CP002069

플라스미드 pMETEV01: CP002070

 2010년 (크로모솜)
메타노할로필루스 마히이 SLP, DSM 5219 2,012,000 2,095 [66] CP001994 2010
메타노플라누스 페트로리우스 SEBR 4847, DSM 11571 2,843,000 2,881 [67] CP002117 2011
메타노살숨 지린내 WeN5, DSM 4017 2,138,000 2,086 CP002101 2010
메타노사에타 회유하다 GP-6 3,008,000 [68] CP002565 2010
메타노사에타 하룬디나케아목 6Ac 2,559,000 [22] CP003117 2011
메타노사에타 보온병 PT 1,879,000 1,785 DOE 공동 게놈 연구소 CP000477 2006
메타노사르시나 아세티보란스 C2A 5,751,492 4,540 [69] AE010299 2002
메타노사르시나 바커리 후사로, DSM 804 4,837,408 3,607 [70] CP000099 염색체

플라스미드 1 CP000098

 2006년 (크로모솜)
메타노사르시나 메이시 바둑1 4,096,345 3,371 [71] AE008384 2002
메타노스포에룰라속 팔러스트리스 E1-9c, DSM 19958 2,922,000 2,859 DOE 공동 게놈 연구소 CP001338 2008
메타노스피릴룸속 헝가테이 JF-1 3,544,738 3,139 DOE 공동 게놈 연구소 CP000254 2006

메타노피리

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
메타노피루스칸들레리 AV19 1,694,969 1,691 [72] AE009439 2002

테르모코치

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
피로코쿠스 심원한 GE5 1,765,118 1,784 [73] NC_000868(NCBI 참조 시퀀스) 2000
피로코쿠스 후리오스 DSM 3638 1,908,256 2,065 [74] AE009950 1999
피로코쿠스 호리코시이 OT3 1,738,505 2,061 [75] NC_000961(NCBI 참조 시퀀스) 1998
피로코쿠스 sp.NA2 1,861,000 1,984 [22] CP002670 2011
피로코쿠스 야야노시이 CH1 1,716,000 1,952 [76] CP002779 2011
테르모코쿠스 바라필루스 MP, DSM 11836 2,010,000 2,196 [77] CP002372 2011
테르모코쿠스 감마톨레란스 EJ3 2,045,000 2,206 [78] CP001398 2009
테르모코쿠스 코다카라엔시스 KOD1 2,088,737 2,306 [79] AP006878 2005
테르모코쿠스 온누리누스 NA1 1,847,000 2,027 [80] NC_011529(NCBI 참조 시퀀스) 2008
테르모코쿠스 시비리쿠스 MM 739 1,845,000 2,085 [81] CP001463 2009
서모코쿠스 sp 4557 2,011,000 2,181 [82] CP002920 2011
열상구균 sp.AM4 2,086,000 2,279 [83] CP002952 2011

테르모플라스마타

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
페로플라즈마 산파르마누스 페르1 1,865,000 1,742 [84] AABC00000000 2007
피크로필루스 토리두스 DSM 9790 1,545,895 1,535 [85] AE017261 2004
테르모플라즈마 산도필름 DSM 1728 1,564,906 1,478 [86] NC_002578(NCBI 참조 시퀀스) 2000
테르모플라즈마 화산 GSS1 1,584,804 1,526 [87] NC_002689(NCBI 참조 시퀀스) 2000

미분류 에우리아카게오타

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
산술리프로펀덤 부오니 T469 1,486,000 1,587 DOE 공동 게놈 연구소 CP001941 2010

코라카에오타

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
칸디다스 코라카에움 크립토필룸 OPF8 1,590,000 1,661 [88] CP000968 2008

나노카케오타

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
나노아카움 등각류 킨4-M 490,885 536 [89] AE017199 2003

타우마르케오타

세나르카에아목

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
세나르카에움 공생 A 2,045,000 2,066 [90] DP000238 2006

니트로소푸밀목

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
칸디다스 니트로소아카움 림니아 SFB1 1,769,000 2,171 [91] AEGP000000 2011
니트로소푸밀루스마리무스 SCM1 1,645,000 1,842 [92] CP000866 2010

미분류 고고학

종 변형률 기본 쌍 유전자 참조 GenBank 식별자 발행년도
할로필릭 고고학 spDL31 게시되지[22] 않음 CP002988 2011

참고 항목

참조

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