PIN 도메인
PIN domain| PIN 도메인 | |||||||||||
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 Angstrom 분해능 1.90 Angstrom에서 Archioglus fulgidus에서 PIN(PilT N-terminus) 도메인(AF0591)의 결정구조. 1o4w | |||||||||||
| 식별자 | |||||||||||
| 기호. | PIN | ||||||||||
| 팜 | PF01850 | ||||||||||
| 인터프로 | IPR002716 | ||||||||||
| 스마트 | CBS | ||||||||||
| SCOP2 | 3dbo/SCOPe/SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd09852 | ||||||||||
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분자생물학에서 PIN 도메인은 길이가 약 130개의 아미노산인 단백질 도메인입니다.PIN 도메인은 염기서열 의존적 또는 [1][2]구조 의존적인 방식으로 단일 가닥 RNA를 절단하는 핵산가수분해효소 효소로 기능한다.
PIN 도메인은 4개의 거의 불변한 산성 [2]잔류물을 포함한다.결정 구조는 이러한 잔류물이 추정 활성 부위에서 함께 뭉쳐 있음을 보여줍니다.진핵생물에서 PIN 도메인은 난센스 매개 mRNA 붕괴와 관련된 단백질, SMG5, SMG6와 같은 단백질 및 18S 리보솜 RNA 처리에서 발견된다.원핵생물에서 발견되는 PIN 도메인 단백질의 대부분은 독소-항독소 오퍼론의 [2]독성 성분이다.이 위치들은 자유생활의 원핵생물들이 영양적 [3]스트레스에 대처하는 것을 돕는 조절 메커니즘을 제공합니다.
레퍼런스
- ^ Arcus VL, McKenzie JL, Robson J, Cook GM (January 2011). "The PIN-domain ribonucleases and the prokaryotic VapBC toxin-antitoxin array". Protein Engineering, Design & Selection. 24 (1–2): 33–40. doi:10.1093/protein/gzq081. PMID 21036780.
- ^ a b c Matelska D, Steczkiewicz K, Ginalski K (July 2017). "Comprehensive classification of the PIN domain-like superfamily". Nucleic Acids Research. 45 (12): 6995–7020. doi:10.1093/nar/gkx494. PMC 5499597. PMID 28575517.
- ^ Gerdes K, Christensen SK, Løbner-Olesen A (May 2005). "Prokaryotic toxin-antitoxin stress response loci". Nature Reviews. Microbiology. 3 (5): 371–82. doi:10.1038/nrmicro1147. PMID 15864262. S2CID 13417307.
