단백질@홈
Proteins@home |
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단백질@home("Protectins at home")은 BOINC 아키텍처를 사용한 많은 분산 컴퓨팅 프로젝트 중 하나이다.이 프로젝트는 에콜 폴리테크니크 생물학부에서 운영했다.이 프로젝트는 2006년 12월 28일에 시작되어 2008년 6월에 종료되었다.
목적
단백질@홈은 분산 컴퓨팅을 활용한 대규모 비영리 단백질 구조 예측 프로젝트로, 적은 시간 내에 많은 연산을 수행하였다.웹 사이트에서 다음을 참조하십시오.
단백질의 아미노산 염기서열은 단백질의 3차원 구조, 즉 '접힘'을 결정한다.반대로, 3차원 구조는 크지만 제한된 아미노산 배열의 집합과 호환된다.주어진 접힘에 대해 허용되는 시퀀스를 열거하는 것을 '역단백질 접힘 문제'라고 한다.우리는 많은 수의 알려진 단백질 접힘(대표적인 부분집합: 약 1500 접힘)에 대해 이 문제를 해결하기 위해 노력하고 있다.가장 비싼 단계는 이 모든 구조를 설명하는 에너지 기능의 데이터베이스를 구축하는 것이다.각 구조물에 대해, 우리는 가능한 모든 아미노산 염기서열을 고려한다.놀랍게도, 우리의 에너지 기능이 상호작용 쌍에 대한 합이기 때문에, 이것은 계산적으로 추적할 수 있다.일단 이것이 이루어지면, 우리는 빠르고 효율적인 방법으로 아미노산 염기서열의 공간을 탐색할 수 있고, 가장 유리한 염기서열을 유지할 수 있다.단백질 시퀀스 공간의 이 대규모 매핑은 단백질 구조와 기능을 예측하고 단백질 진화를 이해하며 새로운 단백질을 설계하기 위한 응용이 될 것이다.이 프로젝트에 참여함으로써, 당신은 에너지 기능의 데이터베이스를 구축하고 잠재적인 생물의학 응용으로 과학의 중요한 영역을 발전시키는데 도움을 줄 것이다.
통계
2007년 3월 25일 단백질@홈은 9548명의 사용자 중 6040명이 적극적으로 참여했고, 총 15381대의 컴퓨터 중 10405대가 기여했다.약 479개의 활동적인 팀이 100개국에 걸쳐 퍼져 있었다.
참고 항목
많은 다른 분산 컴퓨팅 프로젝트들도 단백질 접기 아이디어에 기여하고 있다.이러한 프로젝트 중 일부는 다음과 같다.
외부 링크
