프로토머

Protomer

구조생물학에서 프로토머는 올리고머 단백질의 구조 단위이다.최소 2개의 다른 단백질 사슬로 구성된 최소 단위이며, 최소 2개의 다른 단백질 사슬은 이 단위의 2개 이상의 복사본의 결합에 의해 더 큰 헤테로올리고머를 형성한다.

이 용어는 Na/K-ATPase 효소의 명명법을 모호하지 않게 하기 위해 쳇베린에[1] 의해 도입되었다.이 효소는 두 개의 소단위, 즉 큰 촉매 α 소단위 및 작은 당단백 β 소단위(및 단백질 지질, γ-소단위라고 함)로 구성됩니다.그 당시에는 얼마나 많은 사람들이 함께 일하는지 불분명했다.또한, 사람들이 이합체에 대해 언급할 때, 그들이 αβ 또는 (αβ)2를 지칭하는 것인지 불분명했다.쳇베린은 αβ를 프로토머라고 부르고 (αβ)2를 디프로토머라고 부르자고 제안했다.

프로토머는 일반적으로 닫힌 점군 대칭을 형성하기 위해 순환 대칭으로 배열됩니다.

화학에서 프로토머는 양성자의 위치에 [2][3]따라 호변이성을 보이는 분자다.

예

헤모글로빈은 4개의 소단위(2개의 α 및 2개의 β)로 구성된 헤테로테트라머이다.그러나 구조적으로나 기능적으로나 헤모글로빈은 (αβ)2로 더 잘 설명되기 때문에 우리는 그것을 두 개의 αβ-프로토머,[4] 즉 디프로토머의 이합체라고 부른다.

아스파르트산카르바모일전달효소는 αβ66 서브유닛 조성물을 가진다.6개의 αβ-프로토머는 D대칭으로3 배열되어 있다.

바이러스 캡시드는 종종 프로토머로 구성되어 있다.

화학의 예로는 티로신 및 4-아미노벤조산을 들 수 있다.전자는 탈양성자화되어 카르본산염과 페녹시드 [5]음이온을 형성할 수 있으며, 후자는 아미노기 [6]또는 카르복실기에서 양성자화될 수 있다.

레퍼런스

  1. ^ Chetverin, A.B. (1986). "Evidence for a diprotomeric structure of Na, K-ATPase: Accurate determination of protein concentration and quantitative end-group analysis". FEBS Lett. 196: 121–125. doi:10.1016/0014-5793(86)80225-3. PMID 3002859.
  2. ^ P.M. 랄리, B.A.이글레시아스, H. E. Toma, G. F. de Sa, R. J. Daroda, J. C. Silva Filho, J. E. Szulejko, K. Araki 및 M. N. E. Eberlin, J. Mass Spectrom, 2012, 477-19.
  3. ^ C. 랍손, T. J. 다인즈, B. Z.Chowdhry, G. L. Perkins, F.S. 풀렌, 래피드 커뮤니케이션질량 스펙트럼, 2013, 27, 2399–2410.
  4. ^ Buxbaum, E. (2007). Fundamentals of protein structure and function. New York: Springer. pp. 105–120. ISBN 978-0-387-26352-6.
  5. ^ J. Am. Chem.Soc., 2009, 131(3), 페이지 1174-1181
  6. ^ J. 피지스화학 A, 2011, 115(26), 페이지 7625-7632

외부 링크


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