RNA 수정 베이스
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| 내용물 | |
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| 묘사 | 높은 처리량의 시퀀싱 데이터 세트에서 식별된 RNA 수정 환경을 디코딩합니다. |
| 연락 | |
| 연구소 | 쑨원 대학 |
| 실험실. | 교육부 유전자공학 핵심연구소 |
| 작가들 | 양젠화 |
| 1차 인용 | Sun & al. (2015)[1] |
| 발매일 | 2010 |
| 접근 | |
| 웹사이트 | http://rna.sysu.edu.cn/rmbase/ |
RNA 수정 베이스(RMBase)[1][2]는 높은 처리량 시퀀싱 데이터(MeRIP-seq, m6A-seq, miCLIP, m6A-CLIP, Pseudo-seq, Δ-seq, CeU-seq, Aza-IP, RiboMeth-seq)에서 식별된 RNA 수정 환경을 디코딩하도록 설계되었습니다.그것은 ~124200 N6-메틸아데노신(m6A), ~9500 슈도우리딘(Δ) 변형, ~1000 5-메틸사이토신(m5C) 변형, ~1210 2'-O-메틸화(2'-O-Me) 및 ~3130 다른 유형의 RNA 변형을 포함합니다.RMBase는 mRNA, 조절 ncRNA(예: lncRNA, miRNA, pseudogenes, circRNA, snoRNA, tRNA), miRNA 표적 부위 및 질병 관련 SNP 내에 위치한 수천 개의 RNA 변형을 입증했습니다.
참고 항목
레퍼런스
- ^ a b Sun, WJ; Li, JH; Liu, S; Wu, J; Zhou, H; Qu, LH; Yang, JH (11 October 2015). "RMBase: a resource for decoding the landscape of RNA modifications from high-throughput sequencing data". Nucleic Acids Research. 44 (D1): D259–D265. doi:10.1093/nar/gkv1036. PMC 4702777. PMID 26464443.
- ^ Xuan, JJ; Sun, WJ; Lin, PH; Zhou, KR; Liu, S; Zheng, LL; Qu, LH; Yang, JH (4 January 2018). "RMBase v2.0: deciphering the map of RNA modifications from epitranscriptome sequencing data". Nucleic Acids Research. 46 (D1): D327–D334. doi:10.1093/nar/gkx934. PMC 5753293. PMID 29040692.
