RNF40

RNF40
식별자
에일리어스	RNF40, BRE1B, RBP95, STING, 약지단백질 40
외부 ID	OMIM: 607700 MGI: 2142048 HomoloGene: 8856 GeneCard: RNF40
유전자 위치(인간)
크르.	16번 염색체(인간)
끝.	30,776,307 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	7번 염색체(쥐)
끝.	127,196,971 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	신경절 융기; ; 랑게르한스 섬; ; 갑상선 우엽; ; 상부 신경; ; 갑상선 좌엽; ; 좌측 자궁관; ; 단구; ; 은 자궁 경부 운하; ; 뇌하수체 전엽; ; 좌부신;
	상단 표시 위치:
	정자질; ; 정자 세포; ; 입술; ; 식도; ; 흉선; ; 정관; ; 상전두회; ; 노른자낭; ; 상완 삼두근; ; 측두근;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	금속 이온 결합; 단백질 함유 복합 결합; 유비퀴틴결합효소결합; 구문in-1 바인딩; 단백질 호모다이머화; mRNA3'-UTR결합; 유비퀴틴단백질리가수분해효소결합; 단백질 결합; 유비퀴틴산전달효소활성; 트랜스페라아제 활성;
셀룰러 컴포넌트	축삭 종단; 세포; 막; HULC 복합체; 막외 성분; 유비퀴틴리가아제복합체; 핵; 뉴런 투영; 핵소체; 단백질 함유 복합체;
생물학적 과정	mRNA 폴리아데닐화 음성조절; 히스톤H2B유비퀴티네이션; 프로테아솜단백질 이화과정 양성조절; 펩타이드 호르몬에 대한 반응; 유사분열세포주기조절; 단백질 폴리유비퀴티네이션의 양성 조절; 히스톤 모노우비퀴트화; 유비퀴틴의존성 단백질 이화 과정; 히스톤 H2B 유비퀴티네이션의 양성 조절; 단백질 ubiquitination; 크로마틴 조직;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	9810
	233900
	ENSG00000103549
	ENSMUSG000030816
	O75150
	Q3U319
	NM_001207033; NM_001207034; NM_001286572; NM_014771; NM_194352
	NM_172281; NM_001360883
	NP_001193962; NP_001193963; NP_001273501; NP_055586
	NP_758485; NP_001347812
	위키데이터
인간 보기/편집	마우스 표시/편집

E3 유비퀴틴-단백질 연결효소 BRE1B는 RNF40 ^[5]^[6]^[7]^[8]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 효소이다.

기능.

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 단백질-단백질 및 단백질-DNA 상호작용에 관여하는 것으로 알려진 모티브인 RING 핑거를 포함합니다.이 단백질은 종양 억제 단백질 RB1과 상호작용하는 것으로 보고되었다.랫드 대응물에 대한 연구는 이 단백질이 E3 유비퀴틴 단백질 연결효소로서 기능할 수 있으며 신경전달물질 ^[8]방출기계의 필수 성분인 구문신 1의 유비퀴티네이션 및 분해를 촉진할 수 있다는 것을 시사했다.

상호 작용

RNF40은 STX1A와 ^[7]상호 작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000103549 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000030816 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (Dec 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. X. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093/dnares/5.3.169. PMID 9734811.
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^ ^a ^b Chin LS, Vavalle JP, Li L (Sep 2002). "Staring, a novel E3 ubiquitin-protein ligase that targets syntaxin 1 for degradation". J. Biol. Chem. 277 (38): 35071–9. doi:10.1074/jbc.M203300200. PMID 12121982.
^ ^a ^b "Entrez Gene: RNF40 ring finger protein 40".

추가 정보

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K, Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2005). "Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093/dnares/12.2.117. PMID 16303743.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD, Mandal SS, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2005). "Monoubiquitination of human histone H2B: the factors involved and their roles in HOX gene regulation". Mol. Cell. 20 (4): 601–11. doi:10.1016/j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000103549 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000030816 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9734811-5] Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (Dec 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. X. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093/dnares/5.3.169. PMID 9734811.

[pmid10944455-6] Wen H, Ao S (Sep 2000). "RBP95, a novel leucine zipper protein, binds to the retinoblastoma protein". Biochem. Biophys. Res. Commun. 275 (1): 141–8. doi:10.1006/bbrc.2000.3242. PMID 10944455.

[pmid12121982-7] Chin LS, Vavalle JP, Li L (Sep 2002). "Staring, a novel E3 ubiquitin-protein ligase that targets syntaxin 1 for degradation". J. Biol. Chem. 277 (38): 35071–9. doi:10.1074/jbc.M203300200. PMID 12121982.

[entrez-8] "Entrez Gene: RNF40 ring finger protein 40".

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