열충격 유전자 발현(ROSE) 원소 억제
Repression of heat shock gene expression (ROSE) element| 열충격 유전자 발현(ROSE) 원소 억제 | |
|---|---|
 | |
| 식별자 | |
| 기호 | 로즈. |
| Rfam | RF00435 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | Cis-reg; 온도 조절기 |
| 도메인 | 박테리아 |
| 그렇게 | SO:0000204 |
| PDB 구조 | PDBe |
열충격 유전자 발현(ROSE) 원소의 억제는 일부 열충격 단백질 mRNA의 5' UTR에서 발견되는 RNA 원소다.ROSE 원소는 열 충격 유전자 발현을 부정적으로 조절하는 RNA 온도계다.이차 구조는 온도에 의해 변한다고 생각되어 RNA 온도계다.이 구조물은 정상 온도에서 리보솜 결합 부지에 대한 접근을 차단한다.그러나 열충격 동안 구조물은 리보솜 결합 부위를 자유롭게 하고 표현이 가능해진다.[2][3]
이 RNA 소자의 부분 구조는 NMR을 사용하여 결정되었다.[1]
로즈와1 로즈AT2
ROSE와1 ROSE는AT2 ROSE 요소의 구체적인 예들이다.[4]ROSE는1 Bradyrhizobium japonicum에서 발견되는 반면 ROSE는AT2 아그로박테리움 투메파시엔스와 밀접한 관련이 있는 성분이다.두 개의 RNA 원소는 유사한 2차 구조를 가지고 있고 ROSE는1 여분의 머리핀을 가지고 있다.[4]모든 ROSE 원소에는 샤인-달가노 수열 결합 지점 맞은편에 있는 특성 '불덩어리 G'가 들어 있는데, 이 뉴클레오티드가 없으면 RNA 온도계는 온도 민감성을 상실한다.[5]
입바
필로모나스 종의 열충격 단백질 IpbA의 발현은 ROSE형 RNA 온도계에 의해 제어된다.이 온도계는 두 개의 머리핀으로만 구성되어 있다.저온에서 IpbA 번역을 억제하고 온도가 상승할 때 번역을 허용한다.[6]
rhlA 및 lsdI ROSE와 같은 원소
유사모나스 에어로기노사 정족수 감지 의존적 독성인자를 열량화할 수 있다.ROSE 온도계는 5시에 존재한다.rhla의 UTR과 ROSE와 같은 온도계 5'lasI의 UTR은 낮은 온도에서 번역을 막는다.[7]
참고 항목
참조
- ^ a b Chowdhury S, Maris C, Allain FH, Narberhaus F (2006). "Molecular basis for temperature sensing by an RNA thermometer". EMBO J. 25 (11): 2487–2497. doi:10.1038/sj.emboj.7601128. PMC 1478195. PMID 16710302.
- ^ Nocker, A; Hausherr T; Balsiger S; Krstulovic NP; Hennecke H; Narberhaus F (2001). "A mRNA-based thermosensor controls expression of rhizobial heat shock genes". Nucleic Acids Res. 29 (23): 4800–4807. doi:10.1093/nar/29.23.4800. PMC 96696. PMID 11726689.
- ^ Balsiger, S; Ragaz C; Baron C; Narberhaus F (2004). "Replicon-Specific Regulation of Small Heat Shock Genes in Agrobacterium tumefaciens". J Bacteriol. 186 (20): 6824–6829. doi:10.1128/JB.186.20.6824-6829.2004. PMC 522190. PMID 15466035.
- ^ a b Narberhaus F, Waldminghaus T, Chowdhury S (January 2006). "RNA thermometers". FEMS Microbiol. Rev. 30 (1): 3–16. doi:10.1111/j.1574-6976.2005.004.x. PMID 16438677.
- ^ Nocker A, Hausherr T, Balsiger S, Krstulovic NP, Hennecke H, Narberhaus F (December 2001). "A mRNA-based thermosensor controls expression of rhizobial heat shock genes". Nucleic Acids Res. 29 (23): 4800–4807. doi:10.1093/nar/29.23.4800. PMC 96696. PMID 11726689.
- ^ Krajewski, SS; Nagel, M; Narberhaus, F (2013). "Short ROSE-Like RNA Thermometers Control IbpA Synthesis in Pseudomonas Species". PLOS ONE. 8 (5): e65168. Bibcode:2013PLoSO...865168K. doi:10.1371/journal.pone.0065168. PMC 3669281. PMID 23741480.
- ^ Grosso-Becerra, María Victoria; Croda-García, Gerardo; Merino, Enrique; Servín-González, Luis; Mojica-Espinosa, Raúl; Soberón-Chávez, Gloria (2014-10-28). "Regulation of Pseudomonas aeruginosa virulence factors by two novel RNA thermometers". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (43): 15562–15567. Bibcode:2014PNAS..11115562G. doi:10.1073/pnas.1402536111. ISSN 1091-6490. PMC 4217398. PMID 25313031.
추가 읽기
- De La Fuente, M.; Valera, S.; Martínez-Guitarte, J. L. (2012). "NcRNAs and thermoregulation: A view in prokaryotes and eukaryotes". FEBS Letters. 586 (23): 4061–4069. doi:10.1016/j.febslet.2012.10.018. PMID 23098758.
