SECIS 요소
SECIS element| 셀레노시스테인 삽입 배열 1 | |
|---|---|
 | |
| 식별자 | |
| 기호. | SECIS_1 |
| Alt. 기호 | 섹시스 |
| Rfam | RF00031 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 시스레그 |
| 도메인 | 진핵생물 |
| 가세요 | GO:0001514 |
| 그렇게 | 순서: 1001274 |
| PDB 구조 | PDBe |
생물학에서 SECIS 요소(SECIS: selenocysteine insertion sequence)는 스템루프 [1]구조를 채택한 길이가 약 60 뉴클레오티드인 RNA 원소이다.이 구조적 모티브(뉴클레오티드의 패턴)는 세포가 셀레노시스테인으로 UGA 코돈을 번역하도록 지시한다(UGA는 보통 정지 코돈이다).따라서 SECIS 요소는 하나 이상의 셀레노시스테인 잔기를 포함하는 단백질인 셀레노프로틴을 코드하는 메신저 RNA의 기본적인 측면이다.
박테리아에서 SECIS 요소는 그것이 영향을 미치는 UGA 코돈 직후에 나타납니다.고세균과 진핵생물에서는 mRNA의 3' UTR에서 발생하며, mRNA 내의 여러 UGA 코돈으로 셀레노시스테인을 코드화할 수 있다.메타노코쿠스의 한 고대 SECIS 요소는 5' [2][3]UTR에 위치해 있다.
SECIS 요소는 배열 특성, 즉 특정 뉴클레오티드가 특정 위치에 있는 경향이 있고 특징적인 2차 구조에 의해 정의되는 것으로 보인다.2차 구조는 상보적인 RNA 뉴클레오티드의 염기쌍의 결과로 머리핀 같은 구조를 일으킨다.진핵생물 SECIS 원소는 자연에서는 드물지만 정확한 SECIS 요소 기능에 매우 중요한 비표준 A-G 염기쌍을 포함한다.진핵생물, 고고생물 및 박테리아 SECIS 요소는 각각 일반적인 헤어핀 구조를 공유하지만 정렬할 수 없다. 예를 들어, 진핵생물 SECIS 요소를 인식하는 정렬 기반 스킴은 고고생물 SECIS 요소를 인식할 수 없다.그러나 로키아르체오타에서 SECIS 원소는 진핵 [4]원소와 더 유사하다.
생물정보학에서는 SECIS 요소의 배열과 2차 구조 특성을 바탕으로 게놈 배열 내에서 SECIS 요소를 검색하는 여러 컴퓨터 프로그램이 생성되었다.이 프로그램들은 새로운 셀레노프로틴을 [5]찾는 데 사용되어 왔다.
종 분포
SECIS 요소는 [5][6][7][8][9][10][11]생명체의 3개 영역(바이러스를 포함)의 다양한 생물에서 발견됩니다.
레퍼런스
- ^ Walczak R, Westhof E, Carbon P, Krol A (April 1996). "A novel RNA structural motif in the selenocysteine insertion element of eukaryotic selenoprotein mRNAs". RNA. 2 (4): 367–379. PMC 1369379. PMID 8634917.
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- ^ Kryukov GV, Gladyshev VN (May 2004). "The prokaryotic selenoproteome". EMBO Reports. 5 (5): 538–543. doi:10.1038/sj.embor.7400126. PMC 1299047. PMID 15105824.
- ^ Krol A (August 2002). "Evolutionarily different RNA motifs and RNA-protein complexes to achieve selenoprotein synthesis". Biochimie. 84 (8): 765–774. doi:10.1016/S0300-9084(02)01405-0. PMID 12457564.
