SSR4

SSR4
식별자
별칭	SSR4, TRAPD, CDG1Y, 신호 시퀀스 수용체 하위 장치 4
외부 ID	OMIM: 300090 MGI: 1099464 HomoloGene: 4573 GeneCard: SSR4
유전자 위치(인간)
쳇.	X염색체(인간)
끝	153,798,499 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	X염색체(쥐)
끝	72,834,436 bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	뇌하수체; ; 전방 뇌하수체; ; 췌장체; ; 정맥주사; ; 기관지; ; 표백나무; ; 경조 침샘; ; 말뭉치 전염병; ; 자궁내막 세포; ; 위체;
	추가 참조 표현식 데이터
	추가 참조 표현식 데이터
직교체
	6748
	20832
	ENSG00000180879
	ENSMUSG00000002014
	P51571
	Q62186
	NM_001204526; NM_001204527; NM_006280
	NM_001166480; NM_009279; NM_001358212; NM_001358213
	NP_001191455; NP_001191456; NP_006271
	NP_001159952; NP_033305; NP_001345141; NP_001345142
	위키다타
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반투명 연계 단백질 소단위 델타는 인간에서 SSR4 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.^[5]^[6]

TRAPD라고도 불리는 SSR4는 단백질 분비에 관여하는 것으로 추정된다.Xq28 지역에 위치하며, IDH3G 유전자와 함께 콤팩트하게 배열되어 있다.이 두 유전자는 그들 사이에 위치한 양방향 촉진자에 의해 구동되며 세포의 서로 다른 구획에 위치한 관계없는 생화학적 경로에 관여하는 단백질을 인코딩한다.번역되지 않은 유전자간 영역은 단지 133 bp만을 나타내며 CpG 섬에 내장되어 있다.CpG 섬은 뚜렷한 표현 패턴을 가진 기능적으로 관련이 없는 두 유전자의 전사를 시작하는 양방향 촉진자 역할을 한다.SSR4는 6개의 exon으로 구성되며 ALD 유전자에서 약 70 kb의 말단자 길이입니다.인간 SSR4 유전자에서는 exon 5의 대체적 스플라이싱이 검출되지 않았지만, 인간 exon 5의 영역 동질성을 결여한 대본 변형이 Xenopus laevis와 Muss musculus 모두에서 검출되었다.^[6]

참조

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000180879 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000002014 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Brenner V, Nyakatura G, Rosenthal A, Platzer M (Nov 1997). "Genomic organization of two novel genes on human Xq28: compact head to head arrangement of IDH gamma and TRAP delta is conserved in rat and mouse". Genomics. 44 (1): 8–14. doi:10.1006/geno.1997.4822. PMID 9286695.
^ ^a ^b "Entrez Gene: SSR4 signal sequence receptor, delta (translocon-associated protein delta)".

추가 읽기

Holthuis JC, van Riel MC, Martens GJ (1996). "Translocon-associated protein TRAP delta and a novel TRAP-like protein are coordinately expressed with pro-opiomelanocortin in Xenopus intermediate pituitary". Biochem. J. 312 ( Pt 1) (Pt 1): 205–13. doi:10.1042/bj3120205. PMC 1136246. PMID 7492314.
Hartmann E, Görlich D, Kostka S, et al. (1993). "A tetrameric complex of membrane proteins in the endoplasmic reticulum". Eur. J. Biochem. 214 (2): 375–81. doi:10.1111/j.1432-1033.1993.tb17933.x. hdl:11858/00-001M-0000-0015-3BD2-F. PMID 7916687.
Wang L, Dobberstein B (1999). "Oligomeric complexes involved in translocation of proteins across the membrane of the endoplasmic reticulum". FEBS Lett. 457 (3): 316–22. doi:10.1016/S0014-5793(99)01075-3. PMID 10471800.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination". Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Miyazaki K, Fujita T, Ozaki T, et al. (2004). "NEDL1, a novel ubiquitin-protein isopeptide ligase for dishevelled-1, targets mutant superoxide dismutase-1". J. Biol. Chem. 279 (12): 11327–35. doi:10.1074/jbc.M312389200. PMID 14684739.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
Wang Z, VandeBerg JL (2005). "Cloning and molecular characterization of a human ortholog of Monodelphis TRAPD in ultraviolet B-induced melanoma". Melanoma Res. 14 (2): 107–14. doi:10.1097/00008390-200404000-00005. PMID 15057039. S2CID 12281868.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). "From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline". Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000180879 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000002014 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9286695-5] Brenner V, Nyakatura G, Rosenthal A, Platzer M (Nov 1997). "Genomic organization of two novel genes on human Xq28: compact head to head arrangement of IDH gamma and TRAP delta is conserved in rat and mouse". Genomics. 44 (1): 8–14. doi:10.1006/geno.1997.4822. PMID 9286695.

[entrez-6] "Entrez Gene: SSR4 signal sequence receptor, delta (translocon-associated protein delta)".

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