과학 관문

Science gateway

과학 게이트웨이는 이공계 연구원, 교육자 및 학생들을 위한 고급 자원에 대한 접근을 제공한다.간소화되고 온라인 친화적인 인터페이스를 통해 게이트웨이들은 커뮤니티별 툴, 애플리케이션 및 데이터 수집을 지원하기 위해 다양한 사이버 인프라(CI) 구성요소를 결합한다.[1]일반적으로 이러한 전문화된 공유 자원은 웹 포털, 모바일 앱 또는 애플리케이션 제품군으로 통합된다.[2]과학의 관문을 통해, 광범위한 연구자들은 자신과 그들의 기관을 위해 시간과 돈을 절약할 수 있는 다양한 자원에 접근할 수 있다.[3]아래 열거한 바와 같이 과학 게이트웨이가 제공하는 기능과 자원은 공유 장비와 기기, 계산 서비스, 고급 소프트웨어 애플리케이션, 협업 능력, 데이터 저장소, 네트워크 등이다.[2]

공유 장비 및 기구

  • 망원경
  • 센서스
  • 지진 진동표

계산 서비스

고급 소프트웨어 응용 프로그램

  • 워크플로우
  • 분석 도구
  • 시뮬레이션 도구
  • 모델링 도구
  • 시각화 도구

협업 능력

데이터 저장소

네트워크

  • 고속의
  • 고가의

역사

수십 년간 과학 게이트웨이는 당시에는 과학 게이트웨이로 불리지 않았을 다양한 형태로 존재했지만, 최근 10년 동안 이 용어를 전후해 더 많은 프로젝트가 결합되었다.예를 들어,[4] 단백질 데이터 은행은 1971년에 시작되어 지역사회에 중요한 서비스를 계속 제공하고 있다.

과학 관문은 흔히 세계의 공동체나 지역에 따라 다른 이름으로 표기된다.대체[5] 이름:

고성능 그리드 컴퓨팅에 대한 간소화된 인터페이스를 제공하기 위한 초기 게이트웨이 중 일부는 National Science Foundation의 자금 지원을 받는 미국 기반의 TeraGrid 컴퓨팅 인프라를 사용했다.TeraGrid(현재 Extreme Science and Engineering Discovery Environment, 또는 XSEDE의 후원 하에 계속됨)는 소프트웨어 개발자들로 이루어진 다양한 커뮤니티를 한데 모았는데, 이들은 달리 이질적인 응용 분야들에 의해 서로 격리되어 있었다.호주에서 전자 연구 기관인 NeCTAR은 게이트웨이에 대한 유사한 자원과 지원을 제공한다.미국, 유럽 및 오스트랄라시아에서 이 커뮤니티가 성장함에 따라, 여러 워크샵 시리즈는 게이트웨이 제작자와 사용자가 이 개념을 통합하고 실천 커뮤니티를 형성하는 데 도움을 주었다.게이트웨이 컴퓨팅 환경 (미국, 2005년 시작), 과학 게이트웨이 국제 워크숍 (유럽, 2009년 시작), 과학 게이트웨이 국제 워크숍 (2016년 시작)

또한 게이트웨이를 지원하기 위한 미들웨어가 증가했으며, 여기에는 다음이 포함된다.

초기 게이트웨이(및 기타 디지털 자원) 중 일부가 첫 번째 자금 조달 주기가 끝나면서, 사용자들은 자금 부족 또는 지속 가능한 도구를 구축하는 불충분한 진행으로 인해 일부 게이트웨이가 폐쇄되는 것을 보기 시작했다. 이는 이러한 프로젝트의 지속가능성에 대한 키에 대한 추가 조사를 촉발했다.[13][14]소프트웨어 재사용과 지역사회 교류의 필요성을 인식한 미국 국립과학재단은 2016년 과학 게이트웨이의 개발자와 사용자에게 보조 서비스와 자원을 제공하는 과학 게이트웨이즈 커뮤니티 연구소에 자금을 지원했다.[2]국제적인 차원에서, 과학 게이트웨이에 관한 국제 연합은 여러 나라와 대륙의 단체들을 모아 현장의 모범 사례와 미래 방향을 공유한다.

참고 항목

참조

  1. ^ 윌킨스-디어, 낸시"특별한 문제: 과학 관문—그리드 자원에 대한 공통 커뮤니티 인터페이스."동시성과 연산: 연습과 경험 19호, 제6호(2007) : 743-749.
  2. ^ a b c 로렌스, 캐서린 A, 마이클 젠트너, 낸시 윌킨스 디어, 줄리 A.베르너트, 말론 피어스, 수레쉬 마르루, 스콧 마이클."오늘과 내일 과학의 관문: 5000명에 가까운 연구계 구성원들의 긍정적인 관점," Concurrency and Computing: Practice and Experience 27, No.16(2015): 4252-4268.
  3. ^ 키스해, 타마스"분산 컴퓨팅 인프라의 광범위한 도입을 위한 과학의 통로"그리드 컴퓨팅 저널(2012): 1-2
  4. ^ Berman, H. M. (2008년 1월)"단백질 데이터 뱅크: 과거의 관점"(PDF)액타 결정그래피카 섹션 A.A64(1) : 88-95. PMID 18156675. doi:10.1107/S0108767307035623
  5. ^ 샤한드, S. (2015년)생물의학 빅데이터 분석을 위한 과학의 관문(의사논문)암스테르담 대학교 디지털 학술 자료실에서 검색
  6. ^ 피어스, 말론 E, 수레쉬 마르루, 라히루 구나틸라케, 돈 쿠샨 비제라트네, 라민더 싱, 차투리 위말라세나, 샤메라 라트냐카, 수다카르 파미디간탐."Apache Airavata: 과학 관문 프레임워크의 설계와 방향"동시성과 연산: 연습과 경험 27, 제16호(2015): 4282-4291.http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cpe.3534/full
  7. ^ 왕, Y, 카플란, N, 뉴먼, G, & 스카르피노, R. "CitSci.org: A New Model for Management, Documenting and Sharping Civil Science Data," PLoS Biology, vol. 13, (10), 2015.도이: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.1002280.
  8. ^ 상인, 니라브 외 연구진, "iPlant Collaborative: 생명 과학을 위한 데이터 검색 활성화를 위한 사이버 인프라," PLOS Biology(2016), doi: 10.1371/journal.pbio.1002342.
  9. ^ Goff, Stephen A 등, "iPlant Collaborative: 식물 생물학을 위한 사이버 인프라," Frontiers in Plant Science 2(2011), doi: 10.3389/fpls.00034.
  10. ^ Enis Afgan, Dannon Baker, Marius van den Beek, Daniel Blankenberg, Dave Bouvier, Martin Čech, John Chilton, Dave Clements, Nate Coraor, Carl Eberhard, Björn Grüning, Aysam Guerler, Jennifer Hillman-Jackson, Greg Von Kuster, Eric Rasche, Nicola Soranzo, Nitesh Turaga, James Taylor, Anton Nekrutenko, and Jeremy Goecks.접근성, 재현성, 협업성 바이오메디컬 분석을 위한 갤럭시 플랫폼: 2016 업데이트.핵산 연구 (2016) 44(W1): W3-W10 doi:10.1093/nar/gkw343
  11. ^ 카숙, 페터 (Ed.) 2014.분산 컴퓨팅 인프라의 과학 게이트웨이:스위스 과학 사용자 커뮤니티에 의한 개발 프레임워크와 개발: 스프링거 인터내셔널
  12. ^ M. McLennan, R. Kennell, "HUBzero: 계산과학과 공학에서의 보급과 협력을 위한 플랫폼," 과학과 공학에서의 컴퓨터, 12(2), 페이지 48-52, 2010년 3월/4월
  13. ^ 마론, 낸시 L, K. 커비 스미스, 매튜 로이."지속적인 디지털 리소스:오늘날의 프로젝트 현장 보기."이타카 S+R.2009년 7월 14일 마지막 수정.https://doi.org/10.18665/sr.22408.
  14. ^ Wilkins-Diehr, N. and K. A. Lawrence(2010) "미래 성공을 위한 과학 관문 개방:GCE(Gateway Computing Environments Workshop), 2010, 페이지.1-10, 2010년 11월 14일 "Gateway Sustainability"의 과제IEEE 컴퓨터 협회(Xplore Digital Library).doi: 10.1109/GCE.2010.5676121.